RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SPIN3-222	ENST00000639482	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	NAIP	Q13075	1403 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	NUP160	Q12769	1436 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.91	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	KDM6B	O15054	1643 aa		13.9	□□□□□ -0.18
SPIN3-222	ENST00000639482	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF11	O15085	1522 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.87	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	NBR1	Q14596	966 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF14	Q15058	1648 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	PTPRG	P23470	1445 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.85	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SPIN3-222	ENST00000639482	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP10B	O94823	1461 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	CHD1	O14646	1710 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCC5	O15440	1437 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	DAPK1	P53355	1430 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SPIN3-222	ENST00000639482	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCA8	O94911	1581 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SPIN3-222	ENST00000639482	TSPY4	P0CV99	314 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	TSPY10	P0CW01	314 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	PKD2	Q13563	968 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	NUP155	O75694	1391 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.65	□□□□□ -0.22
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	ROCK1	Q13464	1354 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	PZP	P20742	1482 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	RGL3	Q3MIN7	710 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SPIN3-222	ENST00000639482	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.57	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	TMC1	Q8TDI8	760 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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