RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 PRDM2Q13029 1718 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-228ENST00000636120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-228ENST00000636120 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-228ENST00000636120 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRGP23470 1445 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-228ENST00000636120 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 GRIN2BQ13224 1484 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.4□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 MORC1Q86VD1 984 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.072e-6■■■□□ 14.7
PDE4D-228ENST00000636120 IFT140Q96RY7 1462 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 GGT6Q6P531 493 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC144AA2RUR9 1427 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 HECW1Q76N89 1606 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 FOXD1Q16676 465 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP44Q96MT7 982 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 CUL7Q14999 1698 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 KIF3BO15066 747 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 TOPBP1Q92547 1522 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-228ENST00000636120 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 L3MBTL2Q969R5 705 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 KIF15Q9NS87 1388 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 NEUROD2Q15784 382 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 NCOA2Q15596 1464 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 MLECQ14165 292 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 PRXQ9BXM0 1461 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 NBR1Q14596 966 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 ARAP1Q96P48 1450 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 SYNJ2O15056 1496 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 STAC3Q96MF2 364 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 PDE3BQ13370 1112 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 TIAM1Q13009 1591 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 STK26Q9P289 416 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 EID1Q9Y6B2 187 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 A0A0G2JS52 829 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 NLRP13Q86W25 1043 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 OSCARQ8IYS5 282 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-228ENST00000636120 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 ARHGAP5Q13017 1502 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 MIA2Q96PC5 1412 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHG5O94827 1062 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 NESP48681 1621 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 USP47Q96K76 1375 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 LMOD3Q0VAK6 560 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.25□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 RGS3P49796 1198 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 MCCP23508 829 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 IQGAP2Q13576 1575 aa8.24□□□□□ -1.09
PDE4D-228ENST00000636120 EVC2Q86UK5 1308 aa8.23□□□□□ -1.09
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