RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SNAP23-223	ENST00000627440	CPS1	P31327	1500 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SNAP23-223	ENST00000627440	YY1	P25490	414 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SNAP23-223	ENST00000627440	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SNAP23-223	ENST00000627440	NEO1	Q92859	1461 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC34A2	O95436	690 aa		12.4	□□□□□ -0.42
SNAP23-223	ENST00000627440	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	12.39	□□□□□ -0.43
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		12.39	□□□□□ -0.43
SNAP23-223	ENST00000627440	PKD2	Q13563	968 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SNAP23-223	ENST00000627440	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SNAP23-223	ENST00000627440	MSH5	O43196	834 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	LRP5	O75197	1615 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	PLA2R1	Q13018	1463 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	RICTOR	Q6R327	1708 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	C3	P01024	1663 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		12.27	□□□□□ -0.44
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SNAP23-223	ENST00000627440	RXRB	P28702	533 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		12.26	□□□□□ -0.45
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	12.25	□□□□□ -0.45
SNAP23-223	ENST00000627440	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		12.23	□□□□□ -0.45
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SNAP23-223	ENST00000627440	DISP1	Q96F81	1524 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SNAP23-223	ENST00000627440	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	IQGAP2	Q13576	1575 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP10A	O60312	1499 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	HECW1	Q76N89	1606 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	C1QTNF8	P60827	252 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		12.15	□□□□□ -0.46
SNAP23-223	ENST00000627440	NPAT	Q14207	1427 aa		12.14	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		12.13	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS12	O14924	1447 aa		12.12	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		12.11	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	JCAD	Q9P266	1359 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNM	O15061	1565 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SNAP23-223	ENST00000627440	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCA8	O94911	1581 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	LRP6	O75581	1613 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CAPN15	O75808	1086 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		12.02	□□□□□ -0.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ARID3C	A6NKF2	412 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC125	Q86Z20	511 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	AGL	P35573	1532 aa		12.01	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		12	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		12	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.99	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HRC	P23327	699 aa		11.97	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	IGF1R	P08069	1367 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		11.96	□□□□□ -0.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MROH2A	A6NES4	1674 aa		11.96	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PHLPP1	O60346	1717 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	KDM5C	P41229	1560 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP10B	O94823	1461 aa		11.95	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	AFF2	P51816	1311 aa		11.94	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.93	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP350	Q5VT06	3117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	NGLY1	Q96IV0	654 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SNAP23-223	ENST00000627440	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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