RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616360.1

TSC22D1-AS1-201, TSC22D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TSC22D1-AS1, Length 2,845 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ANP32CO43423 234 aa23.92■■□□□ 1.42
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.91■■□□□ 1.42
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.91■■□□□ 1.42
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CEP170Q5SW79 1584 aa23.9■■□□□ 1.42
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.88■■□□□ 1.41
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DAPK1P53355 1430 aa23.87■■□□□ 1.41
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CCER2I3L3R5 266 aa23.86■■□□□ 1.41
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ABCC5O15440 1437 aa23.86■■□□□ 1.41
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 AKNAQ7Z591 1439 aa23.85■■□□□ 1.41
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.81■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SYNJ2O15056 1496 aa23.81■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 JPH4Q96JJ6 628 aa23.78■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 KIF14Q15058 1648 aa23.78■■□□□ 1.4
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.74■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ROCK1Q13464 1354 aa23.74■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.73■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.71■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.7■■□□□ 1.39
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NUP160Q12769 1436 aa23.69■■□□□ 1.38
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.68■■□□□ 1.38
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.66■■□□□ 1.38
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.66■■□□□ 1.38
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.38
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NCOA1Q15788 1441 aa23.63■■□□□ 1.37
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PZPP20742 1482 aa23.63■■□□□ 1.37
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.61■■□□□ 1.37
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.61■■□□□ 1.37
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.59■■□□□ 1.37
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ATP10BO94823 1461 aa23.58■■□□□ 1.37
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.57■■□□□ 1.36
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ABCA8O94911 1581 aa23.57■■□□□ 1.36
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CCDC184Q52MB2 194 aa23.56■■□□□ 1.36
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.55■■□□□ 1.36
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.55■■□□□ 1.36
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.54■■□□□ 1.36
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PKD2Q13563 968 aa23.53■■□□□ 1.36
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.51■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CCDC7Q96M83 1385 aa23.51■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ADGRL2O95490 1459 aa23.5■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.49■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.49■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.48■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.47■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.46■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.45■■□□□ 1.35
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.45■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.45■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.44■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PTPRGP23470 1445 aa23.44■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NUP155O75694 1391 aa23.42■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 MBD5Q9P267 1494 aa23.39■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.39■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.39■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CHD1O14646 1710 aa23.38■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TSPY4P0CV99 314 aa23.38■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TSPY10P0CW01 314 aa23.38■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 KIF15Q9NS87 1388 aa23.35■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.34■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.33■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.33■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.33■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.33■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NBR1Q14596 966 aa23.33■■□□□ 1.33
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 USP47Q96K76 1375 aa23.33■■□□□ 1.32
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.32■■□□□ 1.32
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.32■■□□□ 1.32
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 MRS2Q9HD23 443 aa23.32■■□□□ 1.32
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.26■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 PREX2Q70Z35 1606 aa23.25■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.25■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 KDM5CP41229 1560 aa23.24■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.24■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.23■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.23■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.23■■□□□ 1.31
TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms