RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615008.4

TMEM230-211, Transcript of transmembrane protein 230, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TMEM230, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM230-211ENST00000615008 RAPGEF3O95398 923 aa20.64■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 PREX2Q70Z35 1606 aa20.63■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.61■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.6■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.6■□□□□ 0.89
TMEM230-211ENST00000615008 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.57■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 MAP3K1Q13233 1512 aa20.57■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.56■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.55■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 RICTORQ6R327 1708 aa20.55■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.55■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 NCOA2Q15596 1464 aa20.54■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.53■□□□□ 0.88
TMEM230-211ENST00000615008 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa20.51■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 ABCC1P33527 1531 aa20.5■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 AFAP1Q8N556 730 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM230-211ENST00000615008 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.45■□□□□ 0.86
TMEM230-211ENST00000615008 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
TMEM230-211ENST00000615008 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.43■□□□□ 0.86
TMEM230-211ENST00000615008 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.42■□□□□ 0.86
TMEM230-211ENST00000615008 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.42■□□□□ 0.86
TMEM230-211ENST00000615008 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.41■□□□□ 0.86
TMEM230-211ENST00000615008 KDM5CP41229 1560 aa20.41■□□□□ 0.86
TMEM230-211ENST00000615008 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.4■□□□□ 0.86
TMEM230-211ENST00000615008 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 ATP10AO60312 1499 aa20.36■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.35■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 MIA2Q96PC5 1412 aa20.34■□□□□ 0.85
TMEM230-211ENST00000615008 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.31■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa20.31■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.31■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 ABCA6Q8N139 1617 aa20.31■□□□□ 0.84
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TMEM230-211ENST00000615008 ATP7AQ04656 1500 aa20.3■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.29■□□□□ 0.84
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TMEM230-211ENST00000615008 TSPY10P0CW01 314 aa20.29■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 MBD5Q9P267 1494 aa20.29■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.28■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.27■□□□□ 0.84
TMEM230-211ENST00000615008 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.27■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.25■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 REREQ9P2R6 1566 aa20.22■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.22■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.22■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.22■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 MADDQ8WXG6 1647 aa20.21■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TMEM230-211ENST00000615008 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.2■□□□□ 0.82
TMEM230-211ENST00000615008 A2MP01023 1474 aa20.2■□□□□ 0.82
TMEM230-211ENST00000615008 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.19■□□□□ 0.82
TMEM230-211ENST00000615008 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TMEM230-211ENST00000615008 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.18■□□□□ 0.82
TMEM230-211ENST00000615008 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TMEM230-211ENST00000615008 AGLP35573 1532 aa20.17■□□□□ 0.82
TMEM230-211ENST00000615008 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 PTPRMP28827 1452 aa20.14■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 DAPK1P53355 1430 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.13■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 PLXNC1O60486 1568 aa20.12■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 ABCC5O15440 1437 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 GGT6Q6P531 493 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.11■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 KIF3BO15066 747 aa20.09■□□□□ 0.81
TMEM230-211ENST00000615008 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.07■□□□□ 0.8
TMEM230-211ENST00000615008 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.07■□□□□ 0.8
TMEM230-211ENST00000615008 KIF15Q9NS87 1388 aa20.06■□□□□ 0.8
TMEM230-211ENST00000615008 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.05■□□□□ 0.8
TMEM230-211ENST00000615008 ITGAEP38570 1179 aa20.05■□□□□ 0.8
TMEM230-211ENST00000615008 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.04■□□□□ 0.8
TMEM230-211ENST00000615008 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TMEM230-211ENST00000615008 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20■□□□□ 0.79
TMEM230-211ENST00000615008 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
TMEM230-211ENST00000615008 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TMEM230-211ENST00000615008 ERBINQ96RT1 1412 aa19.98■□□□□ 0.79
TMEM230-211ENST00000615008 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
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