RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587086.2

MISP3-202, Transcript of MISP family member 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MISP3, Length 1,535 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3-202ENST00000587086 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
MISP3-202ENST00000587086 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
MISP3-202ENST00000587086 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.31■■■■■ 4.2
MISP3-202ENST00000587086 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.3■■■■■ 4.2
MISP3-202ENST00000587086 ADGRL1O94910 1474 aa41.3■■■■■ 4.2
MISP3-202ENST00000587086 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.3■■■■■ 4.2
MISP3-202ENST00000587086 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.3■■■■■ 4.2
MISP3-202ENST00000587086 PREX2Q70Z35 1606 aa41.26■■■■■ 4.2
MISP3-202ENST00000587086 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.26■■■■■ 4.2
MISP3-202ENST00000587086 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
MISP3-202ENST00000587086 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
MISP3-202ENST00000587086 NCOA2Q15596 1464 aa41.2■■■■■ 4.19
MISP3-202ENST00000587086 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.2■■■■■ 4.19
MISP3-202ENST00000587086 RICTORQ6R327 1708 aa41.16■■■■■ 4.18
MISP3-202ENST00000587086 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
MISP3-202ENST00000587086 AFAP1Q8N556 730 aa41.14■■■■■ 4.18
MISP3-202ENST00000587086 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.14■■■■■ 4.18
MISP3-202ENST00000587086 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.09■■■■■ 4.17
MISP3-202ENST00000587086 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
MISP3-202ENST00000587086 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
MISP3-202ENST00000587086 ABCC1P33527 1531 aa41.05■■■■■ 4.16
MISP3-202ENST00000587086 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.04■■■■■ 4.16
MISP3-202ENST00000587086 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.04■■■■■ 4.16
MISP3-202ENST00000587086 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.03■■■■■ 4.16
MISP3-202ENST00000587086 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.02■■■■■ 4.16
MISP3-202ENST00000587086 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.99■■■■■ 4.15
MISP3-202ENST00000587086 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.99■■■■■ 4.15
MISP3-202ENST00000587086 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.98■■■■■ 4.15
MISP3-202ENST00000587086 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.97■■■■■ 4.15
MISP3-202ENST00000587086 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.96■■■■■ 4.15
MISP3-202ENST00000587086 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.96■■■■■ 4.15
MISP3-202ENST00000587086 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.93■■■■■ 4.14
MISP3-202ENST00000587086 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.93■■■■■ 4.14
MISP3-202ENST00000587086 KDM5CP41229 1560 aa40.92■■■■■ 4.14
MISP3-202ENST00000587086 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.9■■■■■ 4.14
MISP3-202ENST00000587086 MYOM3Q5VTT5 1437 aa40.88■■■■■ 4.13
MISP3-202ENST00000587086 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.87■■■■■ 4.13
MISP3-202ENST00000587086 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.86■■■■■ 4.13
MISP3-202ENST00000587086 MBD5Q9P267 1494 aa40.85■■■■■ 4.13
MISP3-202ENST00000587086 MIA2Q96PC5 1412 aa40.82■■■■■ 4.13
MISP3-202ENST00000587086 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
MISP3-202ENST00000587086 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
MISP3-202ENST00000587086 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.82■■■■■ 4.12
MISP3-202ENST00000587086 ATP10AO60312 1499 aa40.8■■■■■ 4.12
MISP3-202ENST00000587086 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.78■■■■■ 4.12
MISP3-202ENST00000587086 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.77■■■■■ 4.12
MISP3-202ENST00000587086 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
MISP3-202ENST00000587086 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
MISP3-202ENST00000587086 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.71■■■■■ 4.11
MISP3-202ENST00000587086 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.69■■■■■ 4.11
MISP3-202ENST00000587086 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.67■■■■■ 4.1
MISP3-202ENST00000587086 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.66■■■■■ 4.1
MISP3-202ENST00000587086 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.65■■■■■ 4.1
MISP3-202ENST00000587086 ABCA6Q8N139 1617 aa40.65■■■■■ 4.1
MISP3-202ENST00000587086 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.64■■■■■ 4.1
MISP3-202ENST00000587086 TSPY4P0CV99 314 aa40.63■■■■■ 4.1
MISP3-202ENST00000587086 TSPY10P0CW01 314 aa40.63■■■■■ 4.1
MISP3-202ENST00000587086 ATP7AQ04656 1500 aa40.62■■■■■ 4.09
MISP3-202ENST00000587086 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.6■■■■■ 4.09
MISP3-202ENST00000587086 MLECQ14165 292 aa40.6■■■■■ 4.09
MISP3-202ENST00000587086 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.59■■■■■ 4.09
MISP3-202ENST00000587086 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
MISP3-202ENST00000587086 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.57■■■■■ 4.09
MISP3-202ENST00000587086 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.55■■■■■ 4.08
MISP3-202ENST00000587086 REREQ9P2R6 1566 aa40.54■■■■■ 4.08
MISP3-202ENST00000587086 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
MISP3-202ENST00000587086 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.51■■■■■ 4.08
MISP3-202ENST00000587086 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
MISP3-202ENST00000587086 A2MP01023 1474 aa40.46■■■■■ 4.07
MISP3-202ENST00000587086 AGLP35573 1532 aa40.46■■■■■ 4.07
MISP3-202ENST00000587086 ABCC5O15440 1437 aa40.46■■■■■ 4.07
MISP3-202ENST00000587086 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.4■■■■■ 4.06
MISP3-202ENST00000587086 MADDQ8WXG6 1647 aa40.4■■■■■ 4.06
MISP3-202ENST00000587086 DAPK1P53355 1430 aa40.38■■■■■ 4.05
MISP3-202ENST00000587086 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.37■■■■■ 4.05
MISP3-202ENST00000587086 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.35■■■■■ 4.05
MISP3-202ENST00000587086 PTPRMP28827 1452 aa40.35■■■■■ 4.05
MISP3-202ENST00000587086 PLXNC1O60486 1568 aa40.34■■■■■ 4.05
MISP3-202ENST00000587086 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
MISP3-202ENST00000587086 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.32■■■■■ 4.04
MISP3-202ENST00000587086 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.29■■■■■ 4.04
MISP3-202ENST00000587086 GGT6Q6P531 493 aa40.28■■■■■ 4.04
MISP3-202ENST00000587086 KIF3BO15066 747 aa40.26■■■■■ 4.04
MISP3-202ENST00000587086 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.26■■■■■ 4.04
MISP3-202ENST00000587086 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
MISP3-202ENST00000587086 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
MISP3-202ENST00000587086 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.23■■■■■ 4.03
MISP3-202ENST00000587086 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.22■■■■■ 4.03
MISP3-202ENST00000587086 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.21■■■■■ 4.03
MISP3-202ENST00000587086 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.19■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 KIF15Q9NS87 1388 aa40.18■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.17■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 NCOA1Q15788 1441 aa40.16■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.16■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 PTPRKQ15262 1439 aa40.16■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 ITGAEP38570 1179 aa40.14■■■■■ 4.02
MISP3-202ENST00000587086 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.12■■■■■ 4.01
MISP3-202ENST00000587086 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms