RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 RICTORQ6R327 1708 aa28.43■■■□□ 2.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.43■■■□□ 2.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.39■■■□□ 2.14
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 AFAP1Q8N556 730 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 PREX2Q70Z35 1606 aa28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.32■■■□□ 2.12
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CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.29■■■□□ 2.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.28■■■□□ 2.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.27■■■□□ 2.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.26■■■□□ 2.12
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCC1P33527 1531 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.26■■■□□ 2.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 MLECQ14165 292 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.23■■■□□ 2.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP10AO60312 1499 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-207ENST00000572043 KDM5CP41229 1560 aa28.2■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-207ENST00000572043 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.18■■■□□ 2.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 MADDQ8WXG6 1647 aa28.17■■■□□ 2.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.16■■■□□ 2.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 TIAM1Q13009 1591 aa28.15■■■□□ 2.1
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.13■■■□□ 2.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 NCOA2Q15596 1464 aa28.11■■■□□ 2.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.1■■■□□ 2.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
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CTDNEP1-207ENST00000572043 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.08■■■□□ 2.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABCA6Q8N139 1617 aa28.07■■■□□ 2.08
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CTDNEP1-207ENST00000572043 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
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CTDNEP1-207ENST00000572043 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.82■■■□□ 2.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.82■■■□□ 2.04
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CTDNEP1-207ENST00000572043 TSPY10P0CW01 314 aa27.79■■■□□ 2.04
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLXNC1O60486 1568 aa27.78■■■□□ 2.04
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CTDNEP1-207ENST00000572043 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.66■■■□□ 2.02
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CTDNEP1-207ENST00000572043 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.6■■■□□ 2.01
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CTDNEP1-207ENST00000572043 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-207ENST00000572043 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-207ENST00000572043 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-207ENST00000572043 DAPK1P53355 1430 aa27.55■■■□□ 2
CTDNEP1-207ENST00000572043 NPATQ14207 1427 aa27.54■■■□□ 2
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.54■■■□□ 2
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTPRKQ15262 1439 aa27.53■■■□□ 2
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