RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.36■■□□□ 1.97
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.36■■□□□ 1.97
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.36■■□□□ 1.97
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.35■■□□□ 1.97
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCOA2Q15596 1464 aa27.34■■□□□ 1.97
CCNDBP1-204ENST00000563065 PREX2Q70Z35 1606 aa27.33■■□□□ 1.96
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CCNDBP1-204ENST00000563065 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.3■■□□□ 1.96
CCNDBP1-204ENST00000563065 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRL1O94910 1474 aa27.3■■□□□ 1.96
CCNDBP1-204ENST00000563065 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.29■■□□□ 1.96
CCNDBP1-204ENST00000563065 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CCNDBP1-204ENST00000563065 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.23■■□□□ 1.95
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.22■■□□□ 1.95
CCNDBP1-204ENST00000563065 AFAP1Q8N556 730 aa27.2■■□□□ 1.95
CCNDBP1-204ENST00000563065 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.2■■□□□ 1.94
CCNDBP1-204ENST00000563065 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-204ENST00000563065 RICTORQ6R327 1708 aa27.19■■□□□ 1.94
CCNDBP1-204ENST00000563065 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.18■■□□□ 1.94
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCC1P33527 1531 aa27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.17■■□□□ 1.94
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.16■■□□□ 1.94
CCNDBP1-204ENST00000563065 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.13■■□□□ 1.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.12■■□□□ 1.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.09■■□□□ 1.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.09■■□□□ 1.93
CCNDBP1-204ENST00000563065 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.07■■□□□ 1.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.07■■□□□ 1.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.07■■□□□ 1.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.06■■□□□ 1.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.06■■□□□ 1.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 MBD5Q9P267 1494 aa27.05■■□□□ 1.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM5CP41229 1560 aa27.04■■□□□ 1.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 MIA2Q96PC5 1412 aa27.03■■□□□ 1.92
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.01■■□□□ 1.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAGI2Q86UL8 1455 aa27■■□□□ 1.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.99■■□□□ 1.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.98■■□□□ 1.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.97■■□□□ 1.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.96■■□□□ 1.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.96■■□□□ 1.91
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.93■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.92■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP10AO60312 1499 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.91■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCA6Q8N139 1617 aa26.9■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.89■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.89■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.89■■□□□ 1.9
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP7AQ04656 1500 aa26.88■■□□□ 1.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSPY4P0CV99 314 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 TSPY10P0CW01 314 aa26.87■■□□□ 1.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.86■■□□□ 1.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 ABCC5O15440 1437 aa26.84■■□□□ 1.89
CCNDBP1-204ENST00000563065 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.82■■□□□ 1.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 MLECQ14165 292 aa26.81■■□□□ 1.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 DAPK1P53355 1430 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CCNDBP1-204ENST00000563065 A2MP01023 1474 aa26.75■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.74■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 REREQ9P2R6 1566 aa26.74■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.74■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITGAEP38570 1179 aa26.72■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.71■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.71■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.71■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTPRKQ15262 1439 aa26.71■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CCNDBP1-204ENST00000563065 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.7■■□□□ 1.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.69■■□□□ 1.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 AGLP35573 1532 aa26.68■■□□□ 1.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLXNC1O60486 1568 aa26.68■■□□□ 1.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 MADDQ8WXG6 1647 aa26.64■■□□□ 1.86
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF3BO15066 747 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNDBP1-204ENST00000563065 GGT6Q6P531 493 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF15Q9NS87 1388 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNDBP1-204ENST00000563065 NCOA1Q15788 1441 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.59■■□□□ 1.85
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRL2O95490 1459 aa26.57■■□□□ 1.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.57■■□□□ 1.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 PTPRMP28827 1452 aa26.56■■□□□ 1.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.55■■□□□ 1.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CCNDBP1-204ENST00000563065 ROCK1Q13464 1354 aa26.49■■□□□ 1.83
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