RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
MEIS3-204ENST00000558555 PREX2Q70Z35 1606 aa36.26■■■■□ 3.39
MEIS3-204ENST00000558555 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.25■■■■□ 3.39
MEIS3-204ENST00000558555 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.39
MEIS3-204ENST00000558555 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
MEIS3-204ENST00000558555 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
MEIS3-204ENST00000558555 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.2■■■■□ 3.39
MEIS3-204ENST00000558555 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.2■■■■□ 3.39
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.16■■■■□ 3.38
MEIS3-204ENST00000558555 PLCH2O75038 1416 aa36.15■■■■□ 3.38
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
MEIS3-204ENST00000558555 KDM6BO15054 1643 aa36.12■■■■□ 3.37
MEIS3-204ENST00000558555 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.12■■■■□ 3.37
MEIS3-204ENST00000558555 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.12■■■■□ 3.37
MEIS3-204ENST00000558555 ITGAEP38570 1179 aa36.08■■■■□ 3.37
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
MEIS3-204ENST00000558555 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.06■■■■□ 3.36
MEIS3-204ENST00000558555 CD109Q6YHK3 1445 aa36.06■■■■□ 3.36
MEIS3-204ENST00000558555 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.03■■■■□ 3.36
MEIS3-204ENST00000558555 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36■■■■□ 3.35
MEIS3-204ENST00000558555 FANCAO15360 1455 aa35.98■■■■□ 3.35
MEIS3-204ENST00000558555 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.98■■■■□ 3.35
MEIS3-204ENST00000558555 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
MEIS3-204ENST00000558555 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.94■■■■□ 3.34
MEIS3-204ENST00000558555 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
MEIS3-204ENST00000558555 DAPK1P53355 1430 aa35.92■■■■□ 3.34
MEIS3-204ENST00000558555 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.91■■■■□ 3.34
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.9■■■■□ 3.34
MEIS3-204ENST00000558555 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.9■■■■□ 3.34
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC5O15440 1437 aa35.89■■■■□ 3.34
MEIS3-204ENST00000558555 ABCC1P33527 1531 aa35.89■■■■□ 3.34
MEIS3-204ENST00000558555 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.88■■■■□ 3.33
MEIS3-204ENST00000558555 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.86■■■■□ 3.33
MEIS3-204ENST00000558555 PTPRKQ15262 1439 aa35.86■■■■□ 3.33
MEIS3-204ENST00000558555 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.86■■■■□ 3.33
MEIS3-204ENST00000558555 MBD5Q9P267 1494 aa35.86■■■■□ 3.33
MEIS3-204ENST00000558555 AKNAQ7Z591 1439 aa35.83■■■■□ 3.33
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.83■■■■□ 3.33
MEIS3-204ENST00000558555 ADGRL1O94910 1474 aa35.82■■■■□ 3.32
MEIS3-204ENST00000558555 NEO1Q92859 1461 aa35.82■■■■□ 3.32
MEIS3-204ENST00000558555 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.79■■■■□ 3.32
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.79■■■■□ 3.32
MEIS3-204ENST00000558555 TSPY4P0CV99 314 aa35.78■■■■□ 3.32
MEIS3-204ENST00000558555 TSPY10P0CW01 314 aa35.78■■■■□ 3.32
MEIS3-204ENST00000558555 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.78■■■■□ 3.32
MEIS3-204ENST00000558555 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.75■■■■□ 3.31
MEIS3-204ENST00000558555 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.75■■■■□ 3.31
MEIS3-204ENST00000558555 ROCK1Q13464 1354 aa35.73■■■■□ 3.31
MEIS3-204ENST00000558555 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.72■■■■□ 3.31
MEIS3-204ENST00000558555 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.7■■■■□ 3.31
MEIS3-204ENST00000558555 HFM1A2PYH4 1435 aa35.69■■■■□ 3.3
MEIS3-204ENST00000558555 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.69■■■■□ 3.3
MEIS3-204ENST00000558555 ADGRL2O95490 1459 aa35.68■■■■□ 3.3
MEIS3-204ENST00000558555 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.67■■■■□ 3.3
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.67■■■■□ 3.3
MEIS3-204ENST00000558555 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.66■■■■□ 3.3
MEIS3-204ENST00000558555 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.64■■■■□ 3.3
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.62■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 NAIPQ13075 1403 aa35.62■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 NCOA1Q15788 1441 aa35.62■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 AFAP1Q8N556 730 aa35.61■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.59■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.58■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
MEIS3-204ENST00000558555 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.55■■■■□ 3.28
MEIS3-204ENST00000558555 RAPGEF3O95398 923 aa35.54■■■■□ 3.28
MEIS3-204ENST00000558555 PLXNC1O60486 1568 aa35.54■■■■□ 3.28
MEIS3-204ENST00000558555 KDM5CP41229 1560 aa35.51■■■■□ 3.28
MEIS3-204ENST00000558555 KIF15Q9NS87 1388 aa35.51■■■■□ 3.27
MEIS3-204ENST00000558555 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.51■■■■□ 3.27
MEIS3-204ENST00000558555 HRCP23327 699 aa35.51■■■■□ 3.27
MEIS3-204ENST00000558555 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.27
MEIS3-204ENST00000558555 ATP7AQ04656 1500 aa35.5■■■■□ 3.27
MEIS3-204ENST00000558555 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.5■■■■□ 3.27
MEIS3-204ENST00000558555 RICTORQ6R327 1708 aa35.5■■■■□ 3.27
MEIS3-204ENST00000558555 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.48■■■■□ 3.27
MEIS3-204ENST00000558555 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.45■■■■□ 3.26
MEIS3-204ENST00000558555 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.45■■■■□ 3.26
MEIS3-204ENST00000558555 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.43■■■■□ 3.26
MEIS3-204ENST00000558555 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.42■■■■□ 3.26
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.41■■■■□ 3.26
MEIS3-204ENST00000558555 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.4■■■■□ 3.26
MEIS3-204ENST00000558555 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
MEIS3-204ENST00000558555 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.35■■■■□ 3.25
MEIS3-204ENST00000558555 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
MEIS3-204ENST00000558555 ERBINQ96RT1 1412 aa35.31■■■■□ 3.24
MEIS3-204ENST00000558555 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.29■■■■□ 3.24
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM52Q96A61 297 aa35.28■■■■□ 3.24
MEIS3-204ENST00000558555 ABCA6Q8N139 1617 aa35.27■■■■□ 3.24
MEIS3-204ENST00000558555 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
MEIS3-204ENST00000558555 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
MEIS3-204ENST00000558555 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.22■■■■□ 3.23
MEIS3-204ENST00000558555 A2MP01023 1474 aa35.22■■■■□ 3.23
MEIS3-204ENST00000558555 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
MEIS3-204ENST00000558555 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.18■■■■□ 3.22
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.17■■■■□ 3.22
MEIS3-204ENST00000558555 UNC13BO14795 1591 aa35.14■■■■□ 3.22
MEIS3-204ENST00000558555 ATP10AO60312 1499 aa35.11■■■■□ 3.21
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