RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554698.5

SDR39U1-208, Transcript of short chain dehydrogenase/reductase family 39U member 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SDR39U1, Length 1,364 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDR39U1-208	ENST00000554698	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.51	■■■□□ 2.96
SDR39U1-208	ENST00000554698	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		33.51	■■■□□ 2.95
SDR39U1-208	ENST00000554698	KDM6B	O15054	1643 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.5	■■■□□ 2.95
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SDR39U1-208	ENST00000554698	AKNA	Q7Z591	1439 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SDR39U1-208	ENST00000554698	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SDR39U1-208	ENST00000554698	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADGRL1	O94910	1474 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SDR39U1-208	ENST00000554698	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SDR39U1-208	ENST00000554698	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.35	■■■□□ 2.93
SDR39U1-208	ENST00000554698	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SDR39U1-208	ENST00000554698	RAPGEF3	O95398	923 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	ABCC1	P33527	1531 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.31	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.26	■■■□□ 2.91
SDR39U1-208	ENST00000554698	RICTOR	Q6R327	1708 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SDR39U1-208	ENST00000554698	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
SDR39U1-208	ENST00000554698	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SDR39U1-208	ENST00000554698	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SDR39U1-208	ENST00000554698	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SDR39U1-208	ENST00000554698	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SDR39U1-208	ENST00000554698	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.17	■■■□□ 2.9
SDR39U1-208	ENST00000554698	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SDR39U1-208	ENST00000554698	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SDR39U1-208	ENST00000554698	KDM5C	P41229	1560 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SDR39U1-208	ENST00000554698	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.11	■■■□□ 2.89
SDR39U1-208	ENST00000554698	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SDR39U1-208	ENST00000554698	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SDR39U1-208	ENST00000554698	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SDR39U1-208	ENST00000554698	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SDR39U1-208	ENST00000554698	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SDR39U1-208	ENST00000554698	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SDR39U1-208	ENST00000554698	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SDR39U1-208	ENST00000554698	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SDR39U1-208	ENST00000554698	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	ABCC5	O15440	1437 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	ATP10A	O60312	1499 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.91	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	DAPK1	P53355	1430 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SDR39U1-208	ENST00000554698	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.85
SDR39U1-208	ENST00000554698	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SDR39U1-208	ENST00000554698	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SDR39U1-208	ENST00000554698	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.86	■■■□□ 2.85
SDR39U1-208	ENST00000554698	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SDR39U1-208	ENST00000554698	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SDR39U1-208	ENST00000554698	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SDR39U1-208	ENST00000554698	A2M	P01023	1474 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SDR39U1-208	ENST00000554698	AGL	P35573	1532 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SDR39U1-208	ENST00000554698	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SDR39U1-208	ENST00000554698	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SDR39U1-208	ENST00000554698	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SDR39U1-208	ENST00000554698	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SDR39U1-208	ENST00000554698	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SDR39U1-208	ENST00000554698	KIF15	Q9NS87	1388 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SDR39U1-208	ENST00000554698	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SDR39U1-208	ENST00000554698	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SDR39U1-208	ENST00000554698	ITGAE	P38570	1179 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SDR39U1-208	ENST00000554698	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SDR39U1-208	ENST00000554698	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SDR39U1-208	ENST00000554698	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SDR39U1-208	ENST00000554698	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SDR39U1-208	ENST00000554698	MLEC	Q14165	292 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SDR39U1-208	ENST00000554698	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SDR39U1-208	ENST00000554698	KIF3B	O15066	747 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SDR39U1-208	ENST00000554698	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
SDR39U1-208	ENST00000554698	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SDR39U1-208	ENST00000554698	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SDR39U1-208	ENST00000554698	GGT6	Q6P531	493 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SDR39U1-208	ENST00000554698	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SDR39U1-208	ENST00000554698	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SDR39U1-208	ENST00000554698	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SDR39U1-208	ENST00000554698	PTPRM	P28827	1452 aa		32.37	■■■□□ 2.77

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