RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553277.5

LRP1-204, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 1,693 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-204ENST00000553277 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.92■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 PLCH2O75038 1416 aa27.91■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.91■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.89■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
LRP1-204ENST00000553277 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.84■■■□□ 2.05
LRP1-204ENST00000553277 GLI2P10070 1586 aa27.83■■■□□ 2.05
LRP1-204ENST00000553277 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
LRP1-204ENST00000553277 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.79■■■□□ 2.04
LRP1-204ENST00000553277 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.77■■■□□ 2.04
LRP1-204ENST00000553277 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
LRP1-204ENST00000553277 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.77■■■□□ 2.04
LRP1-204ENST00000553277 PTPRKQ15262 1439 aa27.77■■■□□ 2.04
LRP1-204ENST00000553277 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.77■■■□□ 2.04
LRP1-204ENST00000553277 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.75■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 MBD5Q9P267 1494 aa27.75■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 DIP2BQ9P265 1576 aa27.74■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 ABCC5O15440 1437 aa27.74■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 CD109Q6YHK3 1445 aa27.74■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 DAPK1P53355 1430 aa27.73■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.73■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.72■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.71■■■□□ 2.03
LRP1-204ENST00000553277 ITGAEP38570 1179 aa27.7■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 FANCAO15360 1455 aa27.69■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 AKNAQ7Z591 1439 aa27.67■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 ABCC1P33527 1531 aa27.66■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.66■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 ROCK1Q13464 1354 aa27.65■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.64■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.64■■■□□ 2.02
LRP1-204ENST00000553277 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.63■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 HFM1A2PYH4 1435 aa27.63■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.62■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.62■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.62■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 ADGRL2O95490 1459 aa27.61■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 NEO1Q92859 1461 aa27.61■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.61■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.59■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.59■■■□□ 2.01
LRP1-204ENST00000553277 NAIPQ13075 1403 aa27.57■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.56■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 NCOA1Q15788 1441 aa27.56■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 ADGRL1O94910 1474 aa27.55■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.54■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 TSPY4P0CV99 314 aa27.54■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 TSPY10P0CW01 314 aa27.54■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.53■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.53■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.52■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.52■■■□□ 2
LRP1-204ENST00000553277 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.51■■□□□ 1.99
LRP1-204ENST00000553277 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.51■■□□□ 1.99
LRP1-204ENST00000553277 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.49■■□□□ 1.99
LRP1-204ENST00000553277 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.48■■□□□ 1.99
LRP1-204ENST00000553277 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.47■■□□□ 1.99
LRP1-204ENST00000553277 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.46■■□□□ 1.99
LRP1-204ENST00000553277 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.44■■□□□ 1.98
LRP1-204ENST00000553277 PLXNC1O60486 1568 aa27.43■■□□□ 1.98
LRP1-204ENST00000553277 POGZQ7Z3K3 1410 aa27.43■■□□□ 1.98
LRP1-204ENST00000553277 AFAP1Q8N556 730 aa27.43■■□□□ 1.98
LRP1-204ENST00000553277 KDM5CP41229 1560 aa27.41■■□□□ 1.98
LRP1-204ENST00000553277 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
LRP1-204ENST00000553277 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
LRP1-204ENST00000553277 TSPOAP1O95153 1857 aa27.39■■□□□ 1.98
LRP1-204ENST00000553277 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.38■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 KIF15Q9NS87 1388 aa27.37■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.35■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 KDM6BO15054 1643 aa27.34■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 ATP7AQ04656 1500 aa27.34■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.34■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 RICTORQ6R327 1708 aa27.34■■□□□ 1.97
LRP1-204ENST00000553277 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.3■■□□□ 1.96
LRP1-204ENST00000553277 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.3■■□□□ 1.96
LRP1-204ENST00000553277 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.28■■□□□ 1.96
LRP1-204ENST00000553277 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.27■■□□□ 1.96
LRP1-204ENST00000553277 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.27■■□□□ 1.96
LRP1-204ENST00000553277 RAPGEF3O95398 923 aa27.27■■□□□ 1.96
LRP1-204ENST00000553277 ERBINQ96RT1 1412 aa27.26■■□□□ 1.95
LRP1-204ENST00000553277 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.22■■□□□ 1.95
LRP1-204ENST00000553277 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
LRP1-204ENST00000553277 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
LRP1-204ENST00000553277 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
LRP1-204ENST00000553277 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.16■■□□□ 1.94
LRP1-204ENST00000553277 ABCA6Q8N139 1617 aa27.14■■□□□ 1.94
LRP1-204ENST00000553277 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 UNC13BO14795 1591 aa27.13■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 A2MP01023 1474 aa27.13■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa27.13■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 TRIM52Q96A61 297 aa27.11■■□□□ 1.93
LRP1-204ENST00000553277 PZPP20742 1482 aa27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms