RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 SPOCK2Q92563 424 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 PYGBP11216 843 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.37□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 G3V3G9 751 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.36□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 PKD2Q13563 968 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.35□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 RGS20O76081 388 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.34□□□□□ -1.39
CS-232ENST00000552331 GPR153Q6NV75 609 aa6.33□□□□□ -1.4
CS-232ENST00000552331 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CS-232ENST00000552331 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.32□□□□□ -1.4
CS-232ENST00000552331 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CS-232ENST00000552331 C14orf37Q86TY3 774 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-232ENST00000552331 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-232ENST00000552331 CFAP44Q96MT7 982 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-232ENST00000552331 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.26□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 PBX2P40425 430 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 NBR1Q14596 966 aa6.25□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 PSEN1P49768 467 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 RGL2O15211 777 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 ARSIQ5FYB1 569 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-232ENST00000552331 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 IFFO2Q5TF58 517 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.2□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 Q6ZNB5 142 aa6.19□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 CABP2Q9NPB3 220 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.17□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 A0A0G2JS52 829 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 GSE1Q14687 1217 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 TRIM41Q8WV44 630 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-232ENST00000552331 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.14□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 MICALL2Q8IY33 904 aa6.13□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 HRO43593 1189 aa6.11□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 TK2O00142 265 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CS-232ENST00000552331 ARHGAP33O14559 1287 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 NUDT7P0C024 238 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 LHX6Q9UPM6 363 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.06□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 LCE2BO14633 110 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 STK25O00506 426 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 PTPN5P54829 565 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 MYT1Q01538 1121 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-232ENST00000552331 LAPTM4AQ15012 233 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 STAC3Q96MF2 364 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 VGFO15240 615 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 STK24Q9Y6E0 443 aa6□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 PSEN2P49810 448 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-232ENST00000552331 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 SLC34A2O95436 690 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 MS4A4AQ96JQ5 239 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 HRCP23327 699 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 ZNF787Q6DD87 383 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 KIF3CO14782 793 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 SOX12O15370 315 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 GFRA3O60609 400 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 WDR70Q9NW82 654 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-232ENST00000552331 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-232ENST00000552331 C2orf72A6NCS6 295 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-232ENST00000552331 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CS-232ENST00000552331 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CS-232ENST00000552331 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa5.86□□□□□ -1.47
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