RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CS-232ENST00000552331 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-232ENST00000552331 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-232ENST00000552331 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-232ENST00000552331 POTEDQ86YR6 584 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-232ENST00000552331 FOXD1Q16676 465 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-232ENST00000552331 MSH5O43196 834 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-232ENST00000552331 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-232ENST00000552331 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.01□□□□□ -0.65
CS-232ENST00000552331 ADRA2BP18089 450 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-232ENST00000552331 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-232ENST00000552331 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
CS-232ENST00000552331 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.36□□□□□ -0.75
CS-232ENST00000552331 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CS-232ENST00000552331 RNF39Q9H2S5 420 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-232ENST00000552331 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-232ENST00000552331 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-232ENST00000552331 POTEHQ6S545 545 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-232ENST00000552331 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-232ENST00000552331 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CS-232ENST00000552331 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-232ENST00000552331 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
CS-232ENST00000552331 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-232ENST00000552331 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-232ENST00000552331 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
CS-232ENST00000552331 DSG3P32926 999 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-232ENST00000552331 CAPN15O75808 1086 aa9.06□□□□□ -0.96
CS-232ENST00000552331 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
CS-232ENST00000552331 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CS-232ENST00000552331 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CS-232ENST00000552331 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.88□□□□□ -0.99
CS-232ENST00000552331 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
CS-232ENST00000552331 ABCB7O75027 752 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-232ENST00000552331 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
CS-232ENST00000552331 TRHP20396 242 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-232ENST00000552331 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-232ENST00000552331 APLP2Q06481 763 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-232ENST00000552331 NPM3O75607 178 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-232ENST00000552331 HAX1O00165 279 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-232ENST00000552331 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-232ENST00000552331 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-232ENST00000552331 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CS-232ENST00000552331 AKT1S1Q96B36 256 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-232ENST00000552331 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.44□□□□□ -1.06
CS-232ENST00000552331 SLC4A2P04920 1241 aa8.43□□□□□ -1.06
CS-232ENST00000552331 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CS-232ENST00000552331 LHX8Q68G74 356 aa8.38□□□□□ -1.07
CS-232ENST00000552331 EVX2Q03828 476 aa8.37□□□□□ -1.07
CS-232ENST00000552331 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
CS-232ENST00000552331 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-232ENST00000552331 POLA2Q14181 598 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-232ENST00000552331 PITPNM1O00562 1244 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-232ENST00000552331 GABBR2O75899 941 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-232ENST00000552331 KCNA4P22459 653 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-232ENST00000552331 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CS-232ENST00000552331 OSCARQ8IYS5 282 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-232ENST00000552331 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-232ENST00000552331 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CS-232ENST00000552331 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-232ENST00000552331 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
CS-232ENST00000552331 POTEIP0CG38 1075 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-232ENST00000552331 POTEMA6NI47 508 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-232ENST00000552331 POTEGQ6S5H5 508 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-232ENST00000552331 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.88□□□□□ -1.15
CS-232ENST00000552331 SLC24A1O60721 1099 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-232ENST00000552331 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-232ENST00000552331 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-232ENST00000552331 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-232ENST00000552331 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-232ENST00000552331 SPDYE2BA6NHP3 402 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-232ENST00000552331 SPDYE6P0CI01 402 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-232ENST00000552331 SPDYE2Q495Y8 402 aa7.83□□□□□ -1.16
CS-232ENST00000552331 CLCN6P51797 869 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-232ENST00000552331 OTUD5Q96G74 571 aa7.82□□□□□ -1.16
CS-232ENST00000552331 CHADLQ6NUI6 762 aa7.8□□□□□ -1.16
CS-232ENST00000552331 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.79□□□□□ -1.16
CS-232ENST00000552331 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-232ENST00000552331 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.72□□□□□ -1.17
CS-232ENST00000552331 POTEB2H3BUK9 544 aa7.7□□□□□ -1.18
CS-232ENST00000552331 PRR29P0C7W0 189 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-232ENST00000552331 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.64□□□□□ -1.19
CS-232ENST00000552331 FBLN2P98095 1184 aa7.62□□□□□ -1.19
CS-232ENST00000552331 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CS-232ENST00000552331 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CS-232ENST00000552331 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CS-232ENST00000552331 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CS-232ENST00000552331 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CS-232ENST00000552331 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-232ENST00000552331 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-232ENST00000552331 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CS-232ENST00000552331 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CS-232ENST00000552331 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.47□□□□□ -1.21
CS-232ENST00000552331 POTEJP0CG39 1038 aa7.46□□□□□ -1.22
CS-232ENST00000552331 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.223e-8■■■□□ 16.7
CS-232ENST00000552331 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CS-232ENST00000552331 ZBTB22O15209 634 aa7.45□□□□□ -1.22
CS-232ENST00000552331 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.44□□□□□ -1.22
CS-232ENST00000552331 METRNQ9UJH8 293 aa7.43□□□□□ -1.22
CS-232ENST00000552331 SCUBE2Q9NQ36 999 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-232ENST00000552331 C7P10643 843 aa7.39□□□□□ -1.23
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