RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.3■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 KDM6BO15054 1643 aa29.3■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.3■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 AKNAQ7Z591 1439 aa29.28■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.26■■■□□ 2.28
CTDSP2-207ENST00000551594 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDSP2-207ENST00000551594 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
CTDSP2-207ENST00000551594 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDSP2-207ENST00000551594 ADGRL1O94910 1474 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDSP2-207ENST00000551594 RAPGEF3O95398 923 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDSP2-207ENST00000551594 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDSP2-207ENST00000551594 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.16■■■□□ 2.26
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CTDSP2-207ENST00000551594 MYOM3Q5VTT5 1437 aa29.13■■■□□ 2.25
CTDSP2-207ENST00000551594 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.12■■■□□ 2.25
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCC1P33527 1531 aa29.1■■■□□ 2.25
CTDSP2-207ENST00000551594 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDSP2-207ENST00000551594 RICTORQ6R327 1708 aa29.09■■■□□ 2.25
CTDSP2-207ENST00000551594 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
CTDSP2-207ENST00000551594 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.06■■■□□ 2.24
CTDSP2-207ENST00000551594 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDSP2-207ENST00000551594 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDSP2-207ENST00000551594 AFAP1Q8N556 730 aa29.05■■■□□ 2.24
CTDSP2-207ENST00000551594 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.04■■■□□ 2.24
CTDSP2-207ENST00000551594 MIA2Q96PC5 1412 aa29.03■■■□□ 2.24
CTDSP2-207ENST00000551594 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.02■■■□□ 2.24
CTDSP2-207ENST00000551594 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.01■■■□□ 2.23
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.98■■■□□ 2.23
CTDSP2-207ENST00000551594 MBD5Q9P267 1494 aa28.97■■■□□ 2.23
CTDSP2-207ENST00000551594 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDSP2-207ENST00000551594 KDM5CP41229 1560 aa28.94■■■□□ 2.22
CTDSP2-207ENST00000551594 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.91■■■□□ 2.22
CTDSP2-207ENST00000551594 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CTDSP2-207ENST00000551594 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.9■■■□□ 2.22
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CTDSP2-207ENST00000551594 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.88■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.87■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.87■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.87■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.86■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.85■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.84■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.84■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.84■■■□□ 2.21
CTDSP2-207ENST00000551594 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP7AQ04656 1500 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCC5O15440 1437 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 TSPY4P0CV99 314 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 TSPY10P0CW01 314 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 ABCA6Q8N139 1617 aa28.79■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 DAPK1P53355 1430 aa28.77■■■□□ 2.2
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP10AO60312 1499 aa28.76■■■□□ 2.19
CTDSP2-207ENST00000551594 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CTDSP2-207ENST00000551594 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDSP2-207ENST00000551594 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDSP2-207ENST00000551594 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDSP2-207ENST00000551594 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.72■■■□□ 2.19
CTDSP2-207ENST00000551594 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.71■■■□□ 2.19
CTDSP2-207ENST00000551594 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.71■■■□□ 2.19
CTDSP2-207ENST00000551594 ITGAEP38570 1179 aa28.7■■■□□ 2.18
CTDSP2-207ENST00000551594 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.186e-9■■■■■ 82.2
CTDSP2-207ENST00000551594 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPRKQ15262 1439 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDSP2-207ENST00000551594 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDSP2-207ENST00000551594 A2MP01023 1474 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDSP2-207ENST00000551594 REREQ9P2R6 1566 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDSP2-207ENST00000551594 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDSP2-207ENST00000551594 PLXNC1O60486 1568 aa28.59■■■□□ 2.17
CTDSP2-207ENST00000551594 MLECQ14165 292 aa28.58■■■□□ 2.17
CTDSP2-207ENST00000551594 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CTDSP2-207ENST00000551594 NCOA1Q15788 1441 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDSP2-207ENST00000551594 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.56■■■□□ 2.16
CTDSP2-207ENST00000551594 KIF15Q9NS87 1388 aa28.55■■■□□ 2.16
CTDSP2-207ENST00000551594 AGLP35573 1532 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDSP2-207ENST00000551594 ADGRL2O95490 1459 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDSP2-207ENST00000551594 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDSP2-207ENST00000551594 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.54■■■□□ 2.16
CTDSP2-207ENST00000551594 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDSP2-207ENST00000551594 KIF3BO15066 747 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDSP2-207ENST00000551594 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDSP2-207ENST00000551594 ROCK1Q13464 1354 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDSP2-207ENST00000551594 GGT6Q6P531 493 aa28.45■■■□□ 2.14
CTDSP2-207ENST00000551594 MADDQ8WXG6 1647 aa28.43■■■□□ 2.14
CTDSP2-207ENST00000551594 ERBINQ96RT1 1412 aa28.41■■■□□ 2.14
CTDSP2-207ENST00000551594 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.39■■■□□ 2.13
CTDSP2-207ENST00000551594 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
CTDSP2-207ENST00000551594 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDSP2-207ENST00000551594 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CTDSP2-207ENST00000551594 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CTDSP2-207ENST00000551594 NAIPQ13075 1403 aa28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms