RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538838.5

TMEM260-202, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM260, Length 1,638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-202ENST00000538838 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.24■■■■□ 3.39
TMEM260-202ENST00000538838 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TMEM260-202ENST00000538838 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.2■■■■□ 3.38
TMEM260-202ENST00000538838 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.17■■■■□ 3.38
TMEM260-202ENST00000538838 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
TMEM260-202ENST00000538838 MIA2Q96PC5 1412 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM260-202ENST00000538838 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM260-202ENST00000538838 FANCAO15360 1455 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM260-202ENST00000538838 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.15■■■■□ 3.38
TMEM260-202ENST00000538838 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.1■■■■□ 3.37
TMEM260-202ENST00000538838 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.09■■■■□ 3.37
TMEM260-202ENST00000538838 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
TMEM260-202ENST00000538838 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
TMEM260-202ENST00000538838 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.07■■■■□ 3.36
TMEM260-202ENST00000538838 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
TMEM260-202ENST00000538838 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
TMEM260-202ENST00000538838 NEO1Q92859 1461 aa36.05■■■■□ 3.36
TMEM260-202ENST00000538838 ABCC1P33527 1531 aa36.05■■■■□ 3.36
TMEM260-202ENST00000538838 AKNAQ7Z591 1439 aa36.01■■■■□ 3.36
TMEM260-202ENST00000538838 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.01■■■■□ 3.35
TMEM260-202ENST00000538838 ADGRL1O94910 1474 aa35.99■■■■□ 3.35
TMEM260-202ENST00000538838 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.97■■■■□ 3.35
TMEM260-202ENST00000538838 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
TMEM260-202ENST00000538838 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.95■■■■□ 3.35
TMEM260-202ENST00000538838 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.91■■■■□ 3.34
TMEM260-202ENST00000538838 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
TMEM260-202ENST00000538838 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.89■■■■□ 3.34
TMEM260-202ENST00000538838 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.89■■■■□ 3.34
TMEM260-202ENST00000538838 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.89■■■■□ 3.34
TMEM260-202ENST00000538838 MBD5Q9P267 1494 aa35.89■■■■□ 3.34
TMEM260-202ENST00000538838 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.88■■■■□ 3.33
TMEM260-202ENST00000538838 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.86■■■■□ 3.33
TMEM260-202ENST00000538838 RICTORQ6R327 1708 aa35.85■■■■□ 3.33
TMEM260-202ENST00000538838 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
TMEM260-202ENST00000538838 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.82■■■■□ 3.33
TMEM260-202ENST00000538838 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.82■■■■□ 3.32
TMEM260-202ENST00000538838 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
TMEM260-202ENST00000538838 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.81■■■■□ 3.32
TMEM260-202ENST00000538838 DAPK1P53355 1430 aa35.8■■■■□ 3.32
TMEM260-202ENST00000538838 ABCC5O15440 1437 aa35.78■■■■□ 3.32
TMEM260-202ENST00000538838 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
TMEM260-202ENST00000538838 KDM6BO15054 1643 aa35.77■■■■□ 3.32
TMEM260-202ENST00000538838 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.77■■■■□ 3.32
TMEM260-202ENST00000538838 KDM5CP41229 1560 aa35.75■■■■□ 3.31
TMEM260-202ENST00000538838 ITGAEP38570 1179 aa35.74■■■■□ 3.31
TMEM260-202ENST00000538838 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
TMEM260-202ENST00000538838 RAPGEF3O95398 923 aa35.72■■■■□ 3.31
TMEM260-202ENST00000538838 AFAP1Q8N556 730 aa35.72■■■■□ 3.31
TMEM260-202ENST00000538838 PTPRKQ15262 1439 aa35.71■■■■□ 3.31
TMEM260-202ENST00000538838 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.71■■■■□ 3.31
TMEM260-202ENST00000538838 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.7■■■■□ 3.31
TMEM260-202ENST00000538838 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.69■■■■□ 3.3
TMEM260-202ENST00000538838 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.68■■■■□ 3.3
TMEM260-202ENST00000538838 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
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TMEM260-202ENST00000538838 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.67■■■■□ 3.3
TMEM260-202ENST00000538838 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.66■■■■□ 3.3
TMEM260-202ENST00000538838 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.66■■■■□ 3.3
TMEM260-202ENST00000538838 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.63■■■■□ 3.29
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TMEM260-202ENST00000538838 TSPY10P0CW01 314 aa35.61■■■■□ 3.29
TMEM260-202ENST00000538838 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.6■■■■□ 3.29
TMEM260-202ENST00000538838 ADGRL2O95490 1459 aa35.57■■■■□ 3.29
TMEM260-202ENST00000538838 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.57■■■■□ 3.29
TMEM260-202ENST00000538838 PLXNC1O60486 1568 aa35.57■■■■□ 3.28
TMEM260-202ENST00000538838 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.55■■■■□ 3.28
TMEM260-202ENST00000538838 ABCA6Q8N139 1617 aa35.55■■■■□ 3.28
TMEM260-202ENST00000538838 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.51■■■■□ 3.28
TMEM260-202ENST00000538838 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.49■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.49■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 ROCK1Q13464 1354 aa35.49■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.49■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.48■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.48■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.48■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 NCOA1Q15788 1441 aa35.48■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.45■■■■□ 3.27
TMEM260-202ENST00000538838 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.44■■■■□ 3.26
TMEM260-202ENST00000538838 KIF15Q9NS87 1388 aa35.43■■■■□ 3.26
TMEM260-202ENST00000538838 HFM1A2PYH4 1435 aa35.4■■■■□ 3.26
TMEM260-202ENST00000538838 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.38■■■■□ 3.25
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TMEM260-202ENST00000538838 A2MP01023 1474 aa35.34■■■■□ 3.25
TMEM260-202ENST00000538838 ATP10AO60312 1499 aa35.32■■■■□ 3.25
TMEM260-202ENST00000538838 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.32■■■■□ 3.24
TMEM260-202ENST00000538838 REREQ9P2R6 1566 aa35.3■■■■□ 3.24
TMEM260-202ENST00000538838 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.28■■■■□ 3.24
TMEM260-202ENST00000538838 ERBINQ96RT1 1412 aa35.27■■■■□ 3.24
TMEM260-202ENST00000538838 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TMEM260-202ENST00000538838 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
TMEM260-202ENST00000538838 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.26■■■■□ 3.24
TMEM260-202ENST00000538838 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.21■■■■□ 3.23
TMEM260-202ENST00000538838 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.19■■■■□ 3.22
TMEM260-202ENST00000538838 AGLP35573 1532 aa35.16■■■■□ 3.22
TMEM260-202ENST00000538838 DEPDC5O75140 1603 aa35.14■■■■□ 3.22
TMEM260-202ENST00000538838 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
TMEM260-202ENST00000538838 UNC13BO14795 1591 aa35.12■■■■□ 3.21
TMEM260-202ENST00000538838 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.1■■■■□ 3.21
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