RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536229.7

SALL3-201, Transcript of spalt like transcription factor 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SALL3, Length 3,997 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3-201ENST00000536229 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SALL3-201ENST00000536229 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.27■□□□□ 0.84
SALL3-201ENST00000536229 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.27■□□□□ 0.84
SALL3-201ENST00000536229 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 USP35Q9P2H5 1018 aa20.27■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 TIAM1Q13009 1591 aa20.26■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 CCDC184Q52MB2 194 aa20.24■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 PDE4AP27815 886 aa20.23■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 HMGXB3Q12766 1538 aa20.23■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SALL3-201ENST00000536229 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.2■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.2■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 TSPY4P0CV99 314 aa20.19■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 TSPY10P0CW01 314 aa20.19■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.19■□□□□ 0.82
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SALL3-201ENST00000536229 MAPKBP1O60336 1514 aa20.17■□□□□ 0.82
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SALL3-201ENST00000536229 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.17■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SALL3-201ENST00000536229 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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SALL3-201ENST00000536229 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.14■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.13■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 NCOA2Q15596 1464 aa20.13■□□□□ 0.81
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SALL3-201ENST00000536229 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.12■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.12■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 TOPBP1Q92547 1522 aa20.12■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.11■□□□□ 0.81
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SALL3-201ENST00000536229 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.1■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.1■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 ZMYND15Q9H091 742 aa20.09■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 UACAQ9BZF9 1416 aa20.09■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 PTPRKQ15262 1439 aa20.08■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 NUDCQ9Y266 331 aa20.08■□□□□ 0.81
SALL3-201ENST00000536229 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.07■□□□□ 0.8
SALL3-201ENST00000536229 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SALL3-201ENST00000536229 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.05■□□□□ 0.8
SALL3-201ENST00000536229 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.04■□□□□ 0.8
SALL3-201ENST00000536229 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SALL3-201ENST00000536229 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SALL3-201ENST00000536229 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
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SALL3-201ENST00000536229 RCAN3Q9UKA8 241 aa20■□□□□ 0.79
SALL3-201ENST00000536229 NUP155O75694 1391 aa19.98■□□□□ 0.79
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SALL3-201ENST00000536229 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.98■□□□□ 0.79
SALL3-201ENST00000536229 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.97■□□□□ 0.79
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SALL3-201ENST00000536229 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SALL3-201ENST00000536229 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa19.95■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.95■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 PLEKHG5O94827 1062 aa19.95■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 AKNAQ7Z591 1439 aa19.93■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.93■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.93■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 CCDC7Q96M83 1385 aa19.92■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 ERCC6Q03468 1493 aa19.92■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 JPH4Q96JJ6 628 aa19.91■□□□□ 0.78
SALL3-201ENST00000536229 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.89■□□□□ 0.77
SALL3-201ENST00000536229 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SALL3-201ENST00000536229 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SALL3-201ENST00000536229 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.87■□□□□ 0.77
SALL3-201ENST00000536229 USP47Q96K76 1375 aa19.85■□□□□ 0.77
SALL3-201ENST00000536229 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.84■□□□□ 0.77
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SALL3-201ENST00000536229 MAP3K1Q13233 1512 aa19.83■□□□□ 0.77
SALL3-201ENST00000536229 BACH2Q9BYV9 841 aa19.83■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 FAM13BQ9NYF5 915 aa19.83■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.82■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 PRDM2Q13029 1718 aa19.81■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.8■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 CRBNQ96SW2 442 aa19.8■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.79■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 POGKQ9P215 609 aa19.79■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.79■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SALL3-201ENST00000536229 MS4A1P11836 297 aa19.76■□□□□ 0.75
SALL3-201ENST00000536229 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
SALL3-201ENST00000536229 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.76■□□□□ 0.75
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