RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.13■■■□□ 2.25
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PTPRK-218ENST00000525459 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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PTPRK-218ENST00000525459 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
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PTPRK-218ENST00000525459 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.76■■■□□ 2.19
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PTPRK-218ENST00000525459 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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PTPRK-218ENST00000525459 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.72■■■□□ 2.19
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PTPRK-218ENST00000525459 TSPY10P0CW01 314 aa28.57■■■□□ 2.16
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PTPRK-218ENST00000525459 ITGAEP38570 1179 aa28.32■■■□□ 2.12
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PTPRK-218ENST00000525459 DEPDC5O75140 1603 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRK-218ENST00000525459 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRK-218ENST00000525459 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRK-218ENST00000525459 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRK-218ENST00000525459 NAIPQ13075 1403 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRK-218ENST00000525459 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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