RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522397.5

TCEA1-210, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 3

Gene TCEA1, Length 852 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-210ENST00000522397 ADGRL1O94910 1474 aa30.7■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 MAP3K1Q13233 1512 aa30.69■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 APLP2Q06481 763 aa30.67■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 RAPGEF3O95398 923 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 RICTORQ6R327 1708 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.66■■■□□ 2.5
TCEA1-210ENST00000522397 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
TCEA1-210ENST00000522397 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.63■■■□□ 2.49
TCEA1-210ENST00000522397 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.62■■■□□ 2.49
TCEA1-210ENST00000522397 NCOA2Q15596 1464 aa30.61■■■□□ 2.49
TCEA1-210ENST00000522397 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
TCEA1-210ENST00000522397 POGZQ7Z3K3 1410 aa30.56■■■□□ 2.48
TCEA1-210ENST00000522397 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
TCEA1-210ENST00000522397 ABCC1P33527 1531 aa30.56■■■□□ 2.48
TCEA1-210ENST00000522397 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.55■■■□□ 2.48
TCEA1-210ENST00000522397 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
TCEA1-210ENST00000522397 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.52■■■□□ 2.48
TCEA1-210ENST00000522397 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.49■■■□□ 2.47
TCEA1-210ENST00000522397 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.47■■■□□ 2.47
TCEA1-210ENST00000522397 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.47■■■□□ 2.47
TCEA1-210ENST00000522397 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.47■■■□□ 2.47
TCEA1-210ENST00000522397 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa30.45■■■□□ 2.47
TCEA1-210ENST00000522397 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.44■■■□□ 2.46
TCEA1-210ENST00000522397 KDM5CP41229 1560 aa30.43■■■□□ 2.46
TCEA1-210ENST00000522397 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.42■■■□□ 2.46
TCEA1-210ENST00000522397 AFAP1Q8N556 730 aa30.41■■■□□ 2.46
TCEA1-210ENST00000522397 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.41■■■□□ 2.46
TCEA1-210ENST00000522397 HECW2Q9P2P5 1572 aa30.4■■■□□ 2.46
TCEA1-210ENST00000522397 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.39■■■□□ 2.45
TCEA1-210ENST00000522397 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.38■■■□□ 2.45
TCEA1-210ENST00000522397 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.37■■■□□ 2.451e-6■■■■□ 21.8
TCEA1-210ENST00000522397 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
TCEA1-210ENST00000522397 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.37■■■□□ 2.45
TCEA1-210ENST00000522397 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.37■■■□□ 2.45
TCEA1-210ENST00000522397 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.36■■■□□ 2.45
TCEA1-210ENST00000522397 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.3■■■□□ 2.44
TCEA1-210ENST00000522397 ABCA6Q8N139 1617 aa30.29■■■□□ 2.44
TCEA1-210ENST00000522397 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa30.28■■■□□ 2.44
TCEA1-210ENST00000522397 MIA2Q96PC5 1412 aa30.28■■■□□ 2.44
TCEA1-210ENST00000522397 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.28■■■□□ 2.44
TCEA1-210ENST00000522397 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
TCEA1-210ENST00000522397 ATP10AO60312 1499 aa30.26■■■□□ 2.44
TCEA1-210ENST00000522397 MBD5Q9P267 1494 aa30.26■■■□□ 2.44
TCEA1-210ENST00000522397 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.26■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.25■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.24■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 ATP7AQ04656 1500 aa30.23■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.22■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.22■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.21■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.21■■■□□ 2.43
TCEA1-210ENST00000522397 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.19■■■□□ 2.42
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TCEA1-210ENST00000522397 ADAMTSL3P82987 1691 aa30.14■■■□□ 2.41
TCEA1-210ENST00000522397 ADGBQ8N7X0 1667 aa30.11■■■□□ 2.41
TCEA1-210ENST00000522397 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
TCEA1-210ENST00000522397 MADDQ8WXG6 1647 aa30.1■■■□□ 2.41
TCEA1-210ENST00000522397 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.09■■■□□ 2.41
TCEA1-210ENST00000522397 MLECQ14165 292 aa30.09■■■□□ 2.41
TCEA1-210ENST00000522397 TSPY4P0CV99 314 aa30.08■■■□□ 2.41
TCEA1-210ENST00000522397 TSPY10P0CW01 314 aa30.08■■■□□ 2.41
TCEA1-210ENST00000522397 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.07■■■□□ 2.4
TCEA1-210ENST00000522397 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-210ENST00000522397 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-210ENST00000522397 AGLP35573 1532 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-210ENST00000522397 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-210ENST00000522397 A2MP01023 1474 aa30.04■■■□□ 2.4
TCEA1-210ENST00000522397 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
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TCEA1-210ENST00000522397 PLXNC1O60486 1568 aa30.02■■■□□ 2.4
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TCEA1-210ENST00000522397 ABCC5O15440 1437 aa29.98■■■□□ 2.39
TCEA1-210ENST00000522397 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.97■■■□□ 2.39
TCEA1-210ENST00000522397 PTPRMP28827 1452 aa29.94■■■□□ 2.38
TCEA1-210ENST00000522397 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
TCEA1-210ENST00000522397 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.86■■■□□ 2.37
TCEA1-210ENST00000522397 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.86■■■□□ 2.37
TCEA1-210ENST00000522397 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
TCEA1-210ENST00000522397 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.83■■■□□ 2.37
TCEA1-210ENST00000522397 GGT6Q6P531 493 aa29.83■■■□□ 2.37
TCEA1-210ENST00000522397 KIF15Q9NS87 1388 aa29.82■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 KIF3BO15066 747 aa29.81■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.8■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.8■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 ADGRL2O95490 1459 aa29.77■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.77■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
TCEA1-210ENST00000522397 ITGAEP38570 1179 aa29.76■■■□□ 2.35
TCEA1-210ENST00000522397 C3P01024 1663 aa29.76■■■□□ 2.35
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