RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
RNU6-334P-201ENST00000517072 MFSD10Q14728 455 aa12.25□□□□□ -0.45
RNU6-334P-201ENST00000517072 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
RNU6-334P-201ENST00000517072 NBR1Q14596 966 aa12.23□□□□□ -0.45
RNU6-334P-201ENST00000517072 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
RNU6-334P-201ENST00000517072 POTEFA5A3E0 1075 aa12.2□□□□□ -0.46
RNU6-334P-201ENST00000517072 E2F4Q16254 413 aa12.2□□□□□ -0.46
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMC2Q8TDI7 906 aa12.19□□□□□ -0.46
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNV2Q8TDN2 545 aa12.18□□□□□ -0.46
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.15□□□□□ -0.46
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 FOXK1P85037 733 aa12.12□□□□□ -0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.12□□□□□ -0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIF3CO14782 793 aa12.11□□□□□ -0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 CAMK2BQ13554 666 aa12.11□□□□□ -0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 C2orf72A6NCS6 295 aa12.09□□□□□ -0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 DSG2Q14126 1118 aa12.09□□□□□ -0.47
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
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RNU6-334P-201ENST00000517072 PLPP6Q8IY26 295 aa12.04□□□□□ -0.48
RNU6-334P-201ENST00000517072 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RNU6-334P-201ENST00000517072 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.96□□□□□ -0.49
RNU6-334P-201ENST00000517072 EMILIN3Q9NT22 766 aa11.96□□□□□ -0.49
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.93□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 DPYSL4O14531 572 aa11.92□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 POTEB2H3BUK9 544 aa11.91□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 PDIA6Q15084 440 aa11.91□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 SEMA3EO15041 775 aa11.9□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 POTEJP0CG39 1038 aa11.9□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 OXER1Q8TDS5 423 aa11.9□□□□□ -0.5
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC34A2O95436 690 aa11.89□□□□□ -0.51
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAP3K9P80192 1104 aa11.89□□□□□ -0.51
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.89□□□□□ -0.51
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RNU6-334P-201ENST00000517072 TBC1D12O60347 775 aa11.86□□□□□ -0.51
RNU6-334P-201ENST00000517072 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
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RNU6-334P-201ENST00000517072 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.85□□□□□ -0.51
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.84□□□□□ -0.51
RNU6-334P-201ENST00000517072 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.83□□□□□ -0.52
RNU6-334P-201ENST00000517072 DOK7Q18PE1 504 aa11.8□□□□□ -0.52
RNU6-334P-201ENST00000517072 RIMBP2O15034 1052 aa11.77□□□□□ -0.53
RNU6-334P-201ENST00000517072 EVI5O60447 810 aa11.77□□□□□ -0.53
RNU6-334P-201ENST00000517072 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTGER2P43116 358 aa11.77□□□□□ -0.53
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.75□□□□□ -0.53
RNU6-334P-201ENST00000517072 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.75□□□□□ -0.53
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RNU6-334P-201ENST00000517072 LHX8Q68G74 356 aa11.71□□□□□ -0.53
RNU6-334P-201ENST00000517072 GRXCR2A6NFK2 248 aa11.69□□□□□ -0.54
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.69□□□□□ -0.54
RNU6-334P-201ENST00000517072 OTUD5Q96G74 571 aa11.69□□□□□ -0.54
RNU6-334P-201ENST00000517072 DDX12PQ92771 950 aa11.67□□□□□ -0.54
RNU6-334P-201ENST00000517072 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.66□□□□□ -0.54
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RNU6-334P-201ENST00000517072 PHF14O94880 888 aa11.64□□□□□ -0.55
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPR153Q6NV75 609 aa11.64□□□□□ -0.55
RNU6-334P-201ENST00000517072 EPAS1Q99814 870 aa11.64□□□□□ -0.55
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARSIQ5FYB1 569 aa11.63□□□□□ -0.55
RNU6-334P-201ENST00000517072 JPH4Q96JJ6 628 aa11.62□□□□□ -0.55
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUDT7P0C024 238 aa11.61□□□□□ -0.55
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RNU6-334P-201ENST00000517072 FBXW7Q969H0 707 aa11.59□□□□□ -0.55
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZMYND10O75800 440 aa11.58□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.58□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 NUTM2FA1L443 756 aa11.57□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 FOSBP53539 338 aa11.57□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.57□□□□□ -0.56
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RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.54□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPR37O15354 613 aa11.53□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAP3K7O43318 606 aa11.53□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 FCHSD2O94868 740 aa11.53□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.53□□□□□ -0.56
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 LHX6Q9UPM6 363 aa11.52□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 HIC1Q14526 733 aa11.5□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.5□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTGDRQ13258 359 aa11.49□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNPATO15228 680 aa11.47□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 CERKQ8TCT0 537 aa11.47□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC24A3Q9HC58 644 aa11.46□□□□□ -0.57
RNU6-334P-201ENST00000517072 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
RNU6-334P-201ENST00000517072 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.45□□□□□ -0.58
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