RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486418.5

TIMMDC1-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TIMMDC1, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMMDC1-205ENST00000486418 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.1■■□□□ 1.45
TIMMDC1-205ENST00000486418 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.1■■□□□ 1.45
TIMMDC1-205ENST00000486418 PREX2Q70Z35 1606 aa24.09■■□□□ 1.45
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.06■■□□□ 1.44
TIMMDC1-205ENST00000486418 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.06■■□□□ 1.44
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
TIMMDC1-205ENST00000486418 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.06■■□□□ 1.44
TIMMDC1-205ENST00000486418 AFAP1Q8N556 730 aa24.03■■□□□ 1.44
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.02■■□□□ 1.44
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TIMMDC1-205ENST00000486418 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.01■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.99■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.98■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.96■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.95■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.95■■□□□ 1.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCC1P33527 1531 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1-205ENST00000486418 ATP10AO60312 1499 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1-205ENST00000486418 TIAM1Q13009 1591 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMMDC1-205ENST00000486418 KDM5CP41229 1560 aa23.93■■□□□ 1.42
TIMMDC1-205ENST00000486418 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.93■■□□□ 1.42
TIMMDC1-205ENST00000486418 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.421e-6■■■■□ 22.9
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TIMMDC1-205ENST00000486418 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1-205ENST00000486418 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.89■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 APLP2Q06481 763 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 MAP3K1Q13233 1512 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 MLECQ14165 292 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 NCOA2Q15596 1464 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 MADDQ8WXG6 1647 aa23.84■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 PTPRMP28827 1452 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.82■■□□□ 1.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCA6Q8N139 1617 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.77■■□□□ 1.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 REREQ9P2R6 1566 aa23.77■■□□□ 1.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMMDC1-205ENST00000486418 MBD5Q9P267 1494 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMMDC1-205ENST00000486418 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.72■■□□□ 1.39
TIMMDC1-205ENST00000486418 ATP7AQ04656 1500 aa23.72■■□□□ 1.39
TIMMDC1-205ENST00000486418 AGLP35573 1532 aa23.71■■□□□ 1.39
TIMMDC1-205ENST00000486418 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.69■■□□□ 1.38
TIMMDC1-205ENST00000486418 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
TIMMDC1-205ENST00000486418 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
TIMMDC1-205ENST00000486418 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.66■■□□□ 1.38
TIMMDC1-205ENST00000486418 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.66■■□□□ 1.38
TIMMDC1-205ENST00000486418 TSPY4P0CV99 314 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMMDC1-205ENST00000486418 TSPY10P0CW01 314 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMMDC1-205ENST00000486418 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.64■■□□□ 1.37
TIMMDC1-205ENST00000486418 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TIMMDC1-205ENST00000486418 A2MP01023 1474 aa23.63■■□□□ 1.37
TIMMDC1-205ENST00000486418 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.63■■□□□ 1.37
TIMMDC1-205ENST00000486418 MIA2Q96PC5 1412 aa23.63■■□□□ 1.37
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.61■■□□□ 1.37
TIMMDC1-205ENST00000486418 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TIMMDC1-205ENST00000486418 GGT6Q6P531 493 aa23.57■■□□□ 1.36
TIMMDC1-205ENST00000486418 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
TIMMDC1-205ENST00000486418 PLXNC1O60486 1568 aa23.56■■□□□ 1.36
TIMMDC1-205ENST00000486418 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.54■■□□□ 1.36
TIMMDC1-205ENST00000486418 C3P01024 1663 aa23.54■■□□□ 1.36
TIMMDC1-205ENST00000486418 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.53■■□□□ 1.36
TIMMDC1-205ENST00000486418 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1-205ENST00000486418 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIF3BO15066 747 aa23.5■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.49■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 MROH2AA6NES4 1674 aa23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZMYM3Q14202 1370 aa23.48■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 HSPA2P54652 639 aa23.46■■□□□ 1.35
TIMMDC1-205ENST00000486418 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCC5O15440 1437 aa23.42■■□□□ 1.34
TIMMDC1-205ENST00000486418 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1-205ENST00000486418 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.4■■□□□ 1.34
TIMMDC1-205ENST00000486418 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 DAPK1P53355 1430 aa23.38■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.37■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 NPATQ14207 1427 aa23.37■■□□□ 1.33
TIMMDC1-205ENST00000486418 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.37■■□□□ 1.33
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