RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.04■■□□□ 1.6
SSR4-209ENST00000482902 FOXD1Q16676 465 aa25.04■■□□□ 1.6
SSR4-209ENST00000482902 ROCK1Q13464 1354 aa25.03■■□□□ 1.6
SSR4-209ENST00000482902 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
SSR4-209ENST00000482902 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.03■■□□□ 1.6
SSR4-209ENST00000482902 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SSR4-209ENST00000482902 ABCC5O15440 1437 aa25■■□□□ 1.59
SSR4-209ENST00000482902 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SSR4-209ENST00000482902 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SSR4-209ENST00000482902 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SSR4-209ENST00000482902 GRIN2AQ12879 1464 aa24.97■■□□□ 1.59
SSR4-209ENST00000482902 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.96■■□□□ 1.59
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.96■■□□□ 1.59
SSR4-209ENST00000482902 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.92■■□□□ 1.58
SSR4-209ENST00000482902 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SSR4-209ENST00000482902 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
SSR4-209ENST00000482902 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SSR4-209ENST00000482902 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SSR4-209ENST00000482902 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.9■■□□□ 1.58
SSR4-209ENST00000482902 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.88■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.86■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 NCOA1Q15788 1441 aa24.86■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 CCDC7Q96M83 1385 aa24.85■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.84■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.83■■□□□ 1.57
SSR4-209ENST00000482902 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.82■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 PZPP20742 1482 aa24.79■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 CEP170Q5SW79 1584 aa24.78■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.78■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 CCDC184Q52MB2 194 aa24.77■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 SYNJ2O15056 1496 aa24.77■■□□□ 1.56
SSR4-209ENST00000482902 ERCC6Q03468 1493 aa24.76■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 FBLN2P98095 1184 aa24.76■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.76■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 KIF14Q15058 1648 aa24.74■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.74■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.73■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.73■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 ADGRL2O95490 1459 aa24.71■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.71■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.71■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 JPH4Q96JJ6 628 aa24.71■■□□□ 1.55
SSR4-209ENST00000482902 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.7■■□□□ 1.54
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.69■■□□□ 1.54
SSR4-209ENST00000482902 MRS2Q9HD23 443 aa24.69■■□□□ 1.54
SSR4-209ENST00000482902 NUP160Q12769 1436 aa24.67■■□□□ 1.54
SSR4-209ENST00000482902 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.67■■□□□ 1.54
SSR4-209ENST00000482902 PKD2Q13563 968 aa24.66■■□□□ 1.54
SSR4-209ENST00000482902 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.66■■□□□ 1.54
SSR4-209ENST00000482902 MBD5Q9P267 1494 aa24.65■■□□□ 1.54
SSR4-209ENST00000482902 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.63■■□□□ 1.53
SSR4-209ENST00000482902 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.63■■□□□ 1.53
SSR4-209ENST00000482902 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
SSR4-209ENST00000482902 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SSR4-209ENST00000482902 USP47Q96K76 1375 aa24.59■■□□□ 1.53
SSR4-209ENST00000482902 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SSR4-209ENST00000482902 ABCA8O94911 1581 aa24.58■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.57■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.57■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 ATP10BO94823 1461 aa24.56■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.56■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.56■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 NUP155O75694 1391 aa24.55■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.55■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.54■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.53■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 TSPY4P0CV99 314 aa24.52■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 TSPY10P0CW01 314 aa24.52■■□□□ 1.52
SSR4-209ENST00000482902 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.5■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.49■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 KDM5CP41229 1560 aa24.48■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.46■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 NBR1Q14596 966 aa24.45■■□□□ 1.51
SSR4-209ENST00000482902 KIF15Q9NS87 1388 aa24.45■■□□□ 1.5
SSR4-209ENST00000482902 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.45■■□□□ 1.5
SSR4-209ENST00000482902 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.44■■□□□ 1.5
SSR4-209ENST00000482902 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.42■■□□□ 1.5
SSR4-209ENST00000482902 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.4■■□□□ 1.5
SSR4-209ENST00000482902 PTPRGP23470 1445 aa24.4■■□□□ 1.5
SSR4-209ENST00000482902 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.39■■□□□ 1.5
SSR4-209ENST00000482902 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
SSR4-209ENST00000482902 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.36■■□□□ 1.49
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