RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478298.5

ABTB1-210, Transcript of ankyrin repeat and BTB domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene ABTB1, Length 818 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABTB1-210ENST00000478298 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.21■■■□□ 2.27
ABTB1-210ENST00000478298 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.21■■■□□ 2.27
ABTB1-210ENST00000478298 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.2■■■□□ 2.27
ABTB1-210ENST00000478298 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
ABTB1-210ENST00000478298 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.2■■■□□ 2.26
ABTB1-210ENST00000478298 AKNAQ7Z591 1439 aa29.2■■■□□ 2.26
ABTB1-210ENST00000478298 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.18■■■□□ 2.26
ABTB1-210ENST00000478298 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
ABTB1-210ENST00000478298 ADGRL1O94910 1474 aa29.11■■■□□ 2.25
ABTB1-210ENST00000478298 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.11■■■□□ 2.25
ABTB1-210ENST00000478298 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.07■■■□□ 2.24
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ABTB1-210ENST00000478298 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.04■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 ABCC1P33527 1531 aa29.04■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 RAPGEF3O95398 923 aa29.03■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.01■■■□□ 2.24
ABTB1-210ENST00000478298 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.01■■■□□ 2.23
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ABTB1-210ENST00000478298 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29■■■□□ 2.23
ABTB1-210ENST00000478298 MIA2Q96PC5 1412 aa29■■■□□ 2.23
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ABTB1-210ENST00000478298 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.94■■■□□ 2.22
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ABTB1-210ENST00000478298 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.92■■■□□ 2.22
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ABTB1-210ENST00000478298 AFAP1Q8N556 730 aa28.9■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 MBD5Q9P267 1494 aa28.9■■■□□ 2.22
ABTB1-210ENST00000478298 KDM5CP41229 1560 aa28.89■■■□□ 2.22
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ABTB1-210ENST00000478298 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.84■■■□□ 2.21
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ABTB1-210ENST00000478298 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.81■■■□□ 2.2
ABTB1-210ENST00000478298 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.8■■■□□ 2.2
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ABTB1-210ENST00000478298 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.78■■■□□ 2.2
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ABTB1-210ENST00000478298 GGT6Q6P531 493 aa28.3■■■□□ 2.12
ABTB1-210ENST00000478298 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.29■■■□□ 2.12
ABTB1-210ENST00000478298 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.27■■■□□ 2.12
ABTB1-210ENST00000478298 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
ABTB1-210ENST00000478298 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.25■■■□□ 2.11
ABTB1-210ENST00000478298 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
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