RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477726.1

SIGMAR1-205, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ADGRL1	O94910	1474 aa		42.92	■■■■■ 4.46
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SIGMAR1-205	ENST00000477726	RAPGEF3	O95398	923 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		42.88	■■■■■ 4.46
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		42.88	■■■■■ 4.45
SIGMAR1-205	ENST00000477726	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SIGMAR1-205	ENST00000477726	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SIGMAR1-205	ENST00000477726	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	42.85	■■■■■ 4.45
SIGMAR1-205	ENST00000477726	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	42.84	■■■■■ 4.45
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	42.79	■■■■■ 4.44
SIGMAR1-205	ENST00000477726	RICTOR	Q6R327	1708 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SIGMAR1-205	ENST00000477726	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SIGMAR1-205	ENST00000477726	NCOA2	Q15596	1464 aa		42.75	■■■■■ 4.43
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		42.75	■■■■■ 4.43
SIGMAR1-205	ENST00000477726	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	42.73	■■■■■ 4.43
SIGMAR1-205	ENST00000477726	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ABCC1	P33527	1531 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SIGMAR1-205	ENST00000477726	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		42.66	■■■■■ 4.42
SIGMAR1-205	ENST00000477726	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		42.61	■■■■■ 4.41
SIGMAR1-205	ENST00000477726	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		42.58	■■■■■ 4.41
SIGMAR1-205	ENST00000477726	AFAP1	Q8N556	730 aa		42.57	■■■■■ 4.41
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		42.55	■■■■■ 4.4
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		42.54	■■■■■ 4.4
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		42.54	■■■■■ 4.4
SIGMAR1-205	ENST00000477726	KDM5C	P41229	1560 aa		42.53	■■■■■ 4.4
SIGMAR1-205	ENST00000477726	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SIGMAR1-205	ENST00000477726	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SIGMAR1-205	ENST00000477726	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	42.49	■■■■■ 4.39
SIGMAR1-205	ENST00000477726	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		42.45	■■■■■ 4.39
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.45	■■■■■ 4.39
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.43	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		42.4	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		42.4	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	42.4	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ATP10A	O60312	1499 aa		42.38	■■■■■ 4.38
SIGMAR1-205	ENST00000477726	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	42.38	■■■■■ 4.37
SIGMAR1-205	ENST00000477726	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SIGMAR1-205	ENST00000477726	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		42.33	■■■■■ 4.37
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MBD5	Q9P267	1494 aa		42.33	■■■■■ 4.37
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SIGMAR1-205	ENST00000477726	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SIGMAR1-205	ENST00000477726	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ATP7A	Q04656	1500 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ABCA6	Q8N139	1617 aa		42.22	■■■■■ 4.35
SIGMAR1-205	ENST00000477726	TSPY4	P0CV99	314 aa		42.21	■■■■■ 4.35
SIGMAR1-205	ENST00000477726	TSPY10	P0CW01	314 aa		42.21	■■■■■ 4.35
SIGMAR1-205	ENST00000477726	RERE	Q9P2R6	1566 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SIGMAR1-205	ENST00000477726	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SIGMAR1-205	ENST00000477726	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SIGMAR1-205	ENST00000477726	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
SIGMAR1-205	ENST00000477726	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SIGMAR1-205	ENST00000477726	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SIGMAR1-205	ENST00000477726	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
SIGMAR1-205	ENST00000477726	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		42.07	■■■■■ 4.33
SIGMAR1-205	ENST00000477726	AGL	P35573	1532 aa		42.07	■■■■■ 4.33
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MLEC	Q14165	292 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SIGMAR1-205	ENST00000477726	A2M	P01023	1474 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SIGMAR1-205	ENST00000477726	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.02	■■■■■ 4.32
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		41.99	■■■■■ 4.31
SIGMAR1-205	ENST00000477726	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
SIGMAR1-205	ENST00000477726	MADD	Q8WXG6	1647 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SIGMAR1-205	ENST00000477726	PLXNC1	O60486	1568 aa		41.93	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		41.93	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	41.93	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ABCC5	O15440	1437 aa		41.92	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	DAPK1	P53355	1430 aa		41.92	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	41.9	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	PTPRM	P28827	1452 aa		41.89	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		41.88	■■■■■ 4.3
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		41.88	■■■■■ 4.29
SIGMAR1-205	ENST00000477726	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	41.87	■■■■■ 4.29
SIGMAR1-205	ENST00000477726	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	41.77	■■■■■ 4.28
SIGMAR1-205	ENST00000477726	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		41.77	■■■■■ 4.28
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.76	■■■■■ 4.28
SIGMAR1-205	ENST00000477726	GGT6	Q6P531	493 aa		41.76	■■■■■ 4.28
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		41.76	■■■■■ 4.28
SIGMAR1-205	ENST00000477726	KIF3B	O15066	747 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SIGMAR1-205	ENST00000477726	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SIGMAR1-205	ENST00000477726	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.72	■■■■■ 4.27
SIGMAR1-205	ENST00000477726	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.72	■■■■■ 4.27
SIGMAR1-205	ENST00000477726	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.69	■■■■■ 4.26
SIGMAR1-205	ENST00000477726	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		41.65	■■■■■ 4.26
SIGMAR1-205	ENST00000477726	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
SIGMAR1-205	ENST00000477726	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.65	■■■■■ 4.26
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SIGMAR1-205	ENST00000477726	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.63	■■■■■ 4.26
SIGMAR1-205	ENST00000477726	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.62	■■■■■ 4.25

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