RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
SOBP-202ENST00000477448 PLCH2O75038 1416 aa39.65■■■■□ 3.94
SOBP-202ENST00000477448 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.64■■■■□ 3.94
SOBP-202ENST00000477448 AKNAQ7Z591 1439 aa39.64■■■■□ 3.94
SOBP-202ENST00000477448 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.64■■■■□ 3.94
SOBP-202ENST00000477448 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
SOBP-202ENST00000477448 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.61■■■■□ 3.93
SOBP-202ENST00000477448 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.59■■■■□ 3.93
SOBP-202ENST00000477448 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.58■■■■□ 3.93
SOBP-202ENST00000477448 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.93
SOBP-202ENST00000477448 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.54■■■■□ 3.92
SOBP-202ENST00000477448 PREX2Q70Z35 1606 aa39.52■■■■□ 3.92
SOBP-202ENST00000477448 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.52■■■■□ 3.92
SOBP-202ENST00000477448 MIA2Q96PC5 1412 aa39.52■■■■□ 3.92
SOBP-202ENST00000477448 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.51■■■■□ 3.92
SOBP-202ENST00000477448 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.51■■■■□ 3.92
SOBP-202ENST00000477448 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.51■■■■□ 3.91
SOBP-202ENST00000477448 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
SOBP-202ENST00000477448 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.5■■■■□ 3.91
SOBP-202ENST00000477448 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.48■■■■□ 3.91
SOBP-202ENST00000477448 ADGRL1O94910 1474 aa39.45■■■■□ 3.91
SOBP-202ENST00000477448 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.45■■■■□ 3.91
SOBP-202ENST00000477448 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.44■■■■□ 3.9
SOBP-202ENST00000477448 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
SOBP-202ENST00000477448 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.41■■■■□ 3.9
SOBP-202ENST00000477448 RICTORQ6R327 1708 aa39.41■■■■□ 3.9
SOBP-202ENST00000477448 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
SOBP-202ENST00000477448 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
SOBP-202ENST00000477448 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.31■■■■□ 3.88
SOBP-202ENST00000477448 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.3■■■■□ 3.88
SOBP-202ENST00000477448 AFAP1Q8N556 730 aa39.28■■■■□ 3.88
SOBP-202ENST00000477448 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.28■■■■□ 3.88
SOBP-202ENST00000477448 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.27■■■■□ 3.88
SOBP-202ENST00000477448 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
SOBP-202ENST00000477448 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.24■■■■□ 3.87
SOBP-202ENST00000477448 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.24■■■■□ 3.87
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.22■■■■□ 3.87
SOBP-202ENST00000477448 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.19■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.17■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.17■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.16■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 ABCC1P33527 1531 aa39.15■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.15■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 ITGAEP38570 1179 aa39.14■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.14■■■■□ 3.86
SOBP-202ENST00000477448 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.12■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.11■■■■□ 3.852e-7■■■□□ 17.6
SOBP-202ENST00000477448 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.1■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.1■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.1■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.1■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 DAPK1P53355 1430 aa39.09■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 PTPRKQ15262 1439 aa39.08■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.08■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 KDM5CP41229 1560 aa39.07■■■■□ 3.85
SOBP-202ENST00000477448 MBD5Q9P267 1494 aa39.07■■■■□ 3.84
SOBP-202ENST00000477448 ABCC5O15440 1437 aa39.06■■■■□ 3.84
SOBP-202ENST00000477448 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.05■■■■□ 3.84
SOBP-202ENST00000477448 ATP10AO60312 1499 aa39■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.98■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.97■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.97■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.97■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.96■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 MLECQ14165 292 aa38.96■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.95■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 SHANK2Q9UPX8 1470 aa38.95■■■■□ 3.83
SOBP-202ENST00000477448 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.94■■■■□ 3.82
SOBP-202ENST00000477448 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.93■■■■□ 3.82
SOBP-202ENST00000477448 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.9■■■■□ 3.82
SOBP-202ENST00000477448 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 ABCA6Q8N139 1617 aa38.88■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.88■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.87■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.87■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 MADDQ8WXG6 1647 aa38.85■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 ROCK1Q13464 1354 aa38.85■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 ADGRL2O95490 1459 aa38.85■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.83■■■■□ 3.81
SOBP-202ENST00000477448 TSPY4P0CV99 314 aa38.82■■■■□ 3.8
SOBP-202ENST00000477448 TSPY10P0CW01 314 aa38.82■■■■□ 3.8
SOBP-202ENST00000477448 HFM1A2PYH4 1435 aa38.82■■■■□ 3.8
SOBP-202ENST00000477448 PTPRMP28827 1452 aa38.82■■■■□ 3.8
SOBP-202ENST00000477448 NAIPQ13075 1403 aa38.76■■■■□ 3.8
SOBP-202ENST00000477448 NCOA1Q15788 1441 aa38.76■■■■□ 3.8
SOBP-202ENST00000477448 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.76■■■■□ 3.8
SOBP-202ENST00000477448 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.74■■■■□ 3.79
SOBP-202ENST00000477448 ATP7AQ04656 1500 aa38.74■■■■□ 3.79
SOBP-202ENST00000477448 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.73■■■■□ 3.79
SOBP-202ENST00000477448 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.73■■■■□ 3.79
SOBP-202ENST00000477448 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
SOBP-202ENST00000477448 REREQ9P2R6 1566 aa38.72■■■■□ 3.79
SOBP-202ENST00000477448 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
SOBP-202ENST00000477448 PLXNC1O60486 1568 aa38.71■■■■□ 3.79
SOBP-202ENST00000477448 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.68■■■■□ 3.78
SOBP-202ENST00000477448 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.68■■■■□ 3.78
SOBP-202ENST00000477448 AGLP35573 1532 aa38.63■■■■□ 3.78
SOBP-202ENST00000477448 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.63■■■■□ 3.77
SOBP-202ENST00000477448 KIF15Q9NS87 1388 aa38.6■■■■□ 3.77
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