RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.49■■■■■ 7.27
SOBP-202ENST00000477448 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.71■■■■■ 6.19
SOBP-202ENST00000477448 ABCC9O60706 1549 aa53.04■■■■■ 6.08
SOBP-202ENST00000477448 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.87■■■■■ 5.73
SOBP-202ENST00000477448 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.74■■■■■ 5.71
SOBP-202ENST00000477448 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.64■■■■■ 5.7
SOBP-202ENST00000477448 NACADO15069 1562 aa50.62■■■■■ 5.69
SOBP-202ENST00000477448 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.17■■■■■ 5.62
SOBP-202ENST00000477448 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.05■■■■■ 5.6
SOBP-202ENST00000477448 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.65■■■■■ 5.54
SOBP-202ENST00000477448 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.64■■■■■ 5.54
SOBP-202ENST00000477448 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.31■■■■■ 5.48
SOBP-202ENST00000477448 SCRIBQ14160 1630 aa49.19■■■■■ 5.46
SOBP-202ENST00000477448 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.04■■■■■ 5.44
SOBP-202ENST00000477448 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.58■■■■■ 5.37
SOBP-202ENST00000477448 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.99■■■■■ 5.27
SOBP-202ENST00000477448 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.89■■■■■ 5.26
SOBP-202ENST00000477448 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.62■■■■■ 5.21
SOBP-202ENST00000477448 SMARCA4P51532 1647 aa46.96■■■■■ 5.11
SOBP-202ENST00000477448 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.83■■■■■ 5.09
SOBP-202ENST00000477448 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.81■■■■■ 5.08
SOBP-202ENST00000477448 NCAPD3P42695 1498 aa46.77■■■■■ 5.08
SOBP-202ENST00000477448 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.68■■■■■ 5.06
SOBP-202ENST00000477448 SMARCA2P51531 1590 aa46.63■■■■■ 5.06
SOBP-202ENST00000477448 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
SOBP-202ENST00000477448 HMGXB3Q12766 1538 aa46.44■■■■■ 5.03
SOBP-202ENST00000477448 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.44■■■■■ 5.02
SOBP-202ENST00000477448 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.38■■■■■ 5.01
SOBP-202ENST00000477448 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
SOBP-202ENST00000477448 WIZO95785 1651 aa46.25■■■■■ 5
SOBP-202ENST00000477448 NESP48681 1621 aa45.86■■■■■ 4.93
SOBP-202ENST00000477448 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
SOBP-202ENST00000477448 ERCC6Q03468 1493 aa45.65■■■■■ 4.9
SOBP-202ENST00000477448 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.51■■■■■ 4.88
SOBP-202ENST00000477448 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.44■■■■■ 4.86
SOBP-202ENST00000477448 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.27■■■■■ 4.84
SOBP-202ENST00000477448 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.22■■■■■ 4.83
SOBP-202ENST00000477448 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.2■■■■■ 4.83
SOBP-202ENST00000477448 CUX2O14529 1486 aa45.16■■■■■ 4.82
SOBP-202ENST00000477448 CFTRP13569 1480 aa45.09■■■■■ 4.81
SOBP-202ENST00000477448 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
SOBP-202ENST00000477448 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.92■■■■■ 4.78
SOBP-202ENST00000477448 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.84■■■■■ 4.77
SOBP-202ENST00000477448 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.81■■■■■ 4.76
SOBP-202ENST00000477448 WDR62O43379 1518 aa44.66■■■■■ 4.74
SOBP-202ENST00000477448 PRDM2Q13029 1718 aa44.6■■■■■ 4.73
SOBP-202ENST00000477448 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
SOBP-202ENST00000477448 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.2■■■■■ 4.67
SOBP-202ENST00000477448 TOPBP1Q92547 1522 aa44.17■■■■■ 4.66
SOBP-202ENST00000477448 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.04■■■■■ 4.64
SOBP-202ENST00000477448 ABCC8Q09428 1581 aa44.03■■■■■ 4.64
SOBP-202ENST00000477448 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.03■■■■■ 4.64
SOBP-202ENST00000477448 IFT140Q96RY7 1462 aa43.9■■■■■ 4.62
SOBP-202ENST00000477448 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
SOBP-202ENST00000477448 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
SOBP-202ENST00000477448 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
SOBP-202ENST00000477448 CUX1P39880 1505 aa43.78■■■■■ 4.6
SOBP-202ENST00000477448 SYNJ1O43426 1573 aa43.74■■■■■ 4.59
SOBP-202ENST00000477448 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.69■■■■■ 4.59
SOBP-202ENST00000477448 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
SOBP-202ENST00000477448 TRIM41Q8WV44 630 aa43.68■■■■■ 4.58
SOBP-202ENST00000477448 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.66■■■■■ 4.58
SOBP-202ENST00000477448 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.66■■■■■ 4.58
SOBP-202ENST00000477448 TOP2BQ02880 1626 aa43.65■■■■■ 4.58
SOBP-202ENST00000477448 SOGA1O94964 1423 aa43.63■■■■■ 4.58
SOBP-202ENST00000477448 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.59■■■■■ 4.57
SOBP-202ENST00000477448 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
SOBP-202ENST00000477448 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
SOBP-202ENST00000477448 OSCARQ8IYS5 282 aa43.39■■■■■ 4.54
SOBP-202ENST00000477448 WDR97A6NE52 1622 aa43.22■■■■■ 4.51
SOBP-202ENST00000477448 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.17■■■■■ 4.5
SOBP-202ENST00000477448 FBLN2P98095 1184 aa43.16■■■■■ 4.5
SOBP-202ENST00000477448 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.1■■■■■ 4.49
SOBP-202ENST00000477448 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.09■■■■■ 4.49
SOBP-202ENST00000477448 GRIN2BQ13224 1484 aa43.08■■■■■ 4.49
SOBP-202ENST00000477448 CHD1O14646 1710 aa43.05■■■■■ 4.48
SOBP-202ENST00000477448 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43■■■■■ 4.47
SOBP-202ENST00000477448 PBRM1Q86U86 1689 aa42.95■■■■■ 4.47
SOBP-202ENST00000477448 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
SOBP-202ENST00000477448 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
SOBP-202ENST00000477448 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.9■■■■■ 4.46
SOBP-202ENST00000477448 EEA1Q15075 1411 aa42.83■■■■■ 4.45
SOBP-202ENST00000477448 SYNJ2O15056 1496 aa42.82■■■■■ 4.45
SOBP-202ENST00000477448 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
SOBP-202ENST00000477448 KIF27Q86VH2 1401 aa42.79■■■■■ 4.44
SOBP-202ENST00000477448 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.67■■■■■ 4.42
SOBP-202ENST00000477448 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.67■■■■■ 4.42
SOBP-202ENST00000477448 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.67■■■■■ 4.42
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF11O15085 1522 aa42.64■■■■■ 4.42
SOBP-202ENST00000477448 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.61■■■■■ 4.41
SOBP-202ENST00000477448 ADAMTS12P58397 1594 aa42.61■■■■■ 4.41
SOBP-202ENST00000477448 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.58■■■■■ 4.41
SOBP-202ENST00000477448 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.57■■■■■ 4.41
SOBP-202ENST00000477448 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.56■■■■■ 4.4
SOBP-202ENST00000477448 GRIN2AQ12879 1464 aa42.55■■■■■ 4.4
SOBP-202ENST00000477448 IGF1RP08069 1367 aa42.46■■■■■ 4.39
SOBP-202ENST00000477448 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.41■■■■■ 4.38
SOBP-202ENST00000477448 KIF21BO75037 1637 aa42.38■■■■■ 4.38
SOBP-202ENST00000477448 CEP170Q5SW79 1584 aa42.37■■■■■ 4.37
SOBP-202ENST00000477448 NUP160Q12769 1436 aa42.36■■■■■ 4.37
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