RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466596.5

HS3ST3B1-202, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

TSL 2

Gene HS3ST3B1, Length 2,808 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-202ENST00000466596 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.64■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.64■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-202ENST00000466596 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.62■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MRS2Q9HD23 443 aa20.61■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HECW1Q76N89 1606 aa20.6■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ADAMTS12P58397 1594 aa20.6■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NBR1Q14596 966 aa20.58■□□□□ 0.89
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.57■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 WDR62O43379 1518 aa20.57■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 FBLN2P98095 1184 aa20.57■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.52■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.52■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.51■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DISP1Q96F81 1524 aa20.49■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ABCC5O15440 1437 aa20.49■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DAPK1P53355 1430 aa20.49■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.47■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CCDC7Q96M83 1385 aa20.46■□□□□ 0.87
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MIA2Q96PC5 1412 aa20.45■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.44■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.43■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 AKNAQ7Z591 1439 aa20.43■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KIAA0556O60303 1618 aa20.43■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NCOA1Q15788 1441 aa20.4■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.39■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.38■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GRIN2AQ12879 1464 aa20.38■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.36■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IFT140Q96RY7 1462 aa20.36■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.35■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KIF14Q15058 1648 aa20.34■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.34■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.33■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PKD2Q13563 968 aa20.32■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PZPP20742 1482 aa20.31■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ROCK1Q13464 1354 aa20.31■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CEP170Q5SW79 1584 aa20.29■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ERCC6Q03468 1493 aa20.29■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 JPH4Q96JJ6 628 aa20.27■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.27■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.27■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NUDCQ9Y266 331 aa20.26■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.25■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-202ENST00000466596 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.832e-10■□□□□ 11
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-202ENST00000466596 USP47Q96K76 1375 aa20.2■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SKAP1Q86WV1 359 aa20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 NUP155O75694 1391 aa20.18■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.18■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.16■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 TMC1Q8TDI8 760 aa20.16■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 SYNJ2O15056 1496 aa20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.14■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.14■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ATP10BO94823 1461 aa20.11■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 MBD5Q9P267 1494 aa20.11■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 RGL3Q3MIN7 710 aa20.09■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.09■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 IL27Q8NEV9 243 aa20.08■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.08■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-202ENST00000466596 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.82e-6■□□□□ 10.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms