RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.22■■■■□ 3.71
SH3BP5-208ENST00000459627 PREX2Q70Z35 1606 aa38.17■■■■□ 3.7
SH3BP5-208ENST00000459627 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.15■■■■□ 3.7
SH3BP5-208ENST00000459627 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.15■■■■□ 3.7
SH3BP5-208ENST00000459627 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.15■■■■□ 3.7
SH3BP5-208ENST00000459627 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.12■■■■□ 3.69
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.12■■■■□ 3.69
SH3BP5-208ENST00000459627 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.11■■■■□ 3.69
SH3BP5-208ENST00000459627 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
SH3BP5-208ENST00000459627 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.07■■■■□ 3.69
SH3BP5-208ENST00000459627 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.07■■■■□ 3.69
SH3BP5-208ENST00000459627 AFAP1Q8N556 730 aa38.06■■■■□ 3.68
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.06■■■■□ 3.68
SH3BP5-208ENST00000459627 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.03■■■■□ 3.68
SH3BP5-208ENST00000459627 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.02■■■■□ 3.68
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCC1P33527 1531 aa38■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.99■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.99■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.98■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.97■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.96■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 TIAM1Q13009 1591 aa37.96■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.96■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.95■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.95■■■■□ 3.67
SH3BP5-208ENST00000459627 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.93■■■■□ 3.66
SH3BP5-208ENST00000459627 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
SH3BP5-208ENST00000459627 KDM5CP41229 1560 aa37.93■■■■□ 3.66
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.92■■■■□ 3.66
SH3BP5-208ENST00000459627 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.89■■■■□ 3.66
SH3BP5-208ENST00000459627 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.87■■■■□ 3.65
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP10AO60312 1499 aa37.86■■■■□ 3.65
SH3BP5-208ENST00000459627 MLECQ14165 292 aa37.86■■■■□ 3.65
SH3BP5-208ENST00000459627 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.85■■■■□ 3.65
SH3BP5-208ENST00000459627 MADDQ8WXG6 1647 aa37.85■■■■□ 3.65
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
SH3BP5-208ENST00000459627 NCOA2Q15596 1464 aa37.84■■■■□ 3.65
SH3BP5-208ENST00000459627 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.65
SH3BP5-208ENST00000459627 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
SH3BP5-208ENST00000459627 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.8■■■■□ 3.64
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.8■■■■□ 3.64
SH3BP5-208ENST00000459627 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.8■■■■□ 3.64
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCA6Q8N139 1617 aa37.79■■■■□ 3.64
SH3BP5-208ENST00000459627 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.77■■■■□ 3.64
SH3BP5-208ENST00000459627 PTPRMP28827 1452 aa37.77■■■■□ 3.64
SH3BP5-208ENST00000459627 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
SH3BP5-208ENST00000459627 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.74■■■■□ 3.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.72■■■■□ 3.63
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.71■■■■□ 3.63
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.7■■■■□ 3.63
SH3BP5-208ENST00000459627 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
SH3BP5-208ENST00000459627 MAP3K1Q13233 1512 aa37.68■■■■□ 3.62
SH3BP5-208ENST00000459627 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.61■■■■□ 3.61
SH3BP5-208ENST00000459627 MBD5Q9P267 1494 aa37.61■■■■□ 3.61
SH3BP5-208ENST00000459627 APLP2Q06481 763 aa37.61■■■■□ 3.61
SH3BP5-208ENST00000459627 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.6■■■■□ 3.61
SH3BP5-208ENST00000459627 ATP7AQ04656 1500 aa37.59■■■■□ 3.61
SH3BP5-208ENST00000459627 REREQ9P2R6 1566 aa37.59■■■■□ 3.61
SH3BP5-208ENST00000459627 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
SH3BP5-208ENST00000459627 AGLP35573 1532 aa37.49■■■■□ 3.59
SH3BP5-208ENST00000459627 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
SH3BP5-208ENST00000459627 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.46■■■■□ 3.59
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.45■■■■□ 3.59
SH3BP5-208ENST00000459627 A2MP01023 1474 aa37.43■■■■□ 3.58
SH3BP5-208ENST00000459627 PLXNC1O60486 1568 aa37.38■■■■□ 3.57
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.37■■■■□ 3.57
SH3BP5-208ENST00000459627 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.36■■■■□ 3.57
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.35■■■■□ 3.57
SH3BP5-208ENST00000459627 MIA2Q96PC5 1412 aa37.35■■■■□ 3.57
SH3BP5-208ENST00000459627 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
SH3BP5-208ENST00000459627 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.32■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.32■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 GGT6Q6P531 493 aa37.3■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 TSPY4P0CV99 314 aa37.29■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 TSPY10P0CW01 314 aa37.29■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.26■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 C3P01024 1663 aa37.26■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 HSPA2P54652 639 aa37.26■■■■□ 3.56
SH3BP5-208ENST00000459627 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
SH3BP5-208ENST00000459627 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.22■■■■□ 3.55
SH3BP5-208ENST00000459627 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
SH3BP5-208ENST00000459627 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.19■■■■□ 3.54
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF3BO15066 747 aa37.18■■■■□ 3.54
SH3BP5-208ENST00000459627 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.17■■■■□ 3.54
SH3BP5-208ENST00000459627 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.17■■■■□ 3.54
SH3BP5-208ENST00000459627 ABCC5O15440 1437 aa37.14■■■■□ 3.54
SH3BP5-208ENST00000459627 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
SH3BP5-208ENST00000459627 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.12■■■■□ 3.53
SH3BP5-208ENST00000459627 ZMYM3Q14202 1370 aa37.12■■■■□ 3.53
SH3BP5-208ENST00000459627 MROH2AA6NES4 1674 aa37.1■■■■□ 3.53
SH3BP5-208ENST00000459627 CROCC2H7BZ55 1655 aa37.08■■■■□ 3.53
SH3BP5-208ENST00000459627 DAPK1P53355 1430 aa37.07■■■■□ 3.52
SH3BP5-208ENST00000459627 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
SH3BP5-208ENST00000459627 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.05■■■■□ 3.52
SH3BP5-208ENST00000459627 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.04■■■■□ 3.52
SH3BP5-208ENST00000459627 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.02■■■■□ 3.52
SH3BP5-208ENST00000459627 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.3 ms