RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448310.1

CBX4-202, Transcript of chromobox 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene CBX4, Length 718 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-202ENST00000448310 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.36■■■■■ 5.01
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CBX4-202ENST00000448310 MTUS2Q5JR59 1369 aa45.6■■■■■ 4.89
CBX4-202ENST00000448310 AGLP35573 1532 aa45.6■■■■■ 4.89
CBX4-202ENST00000448310 CEP162Q5TB80 1403 aa45.57■■■■■ 4.89
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CBX4-202ENST00000448310 FBXO41Q8TF61 875 aa45.49■■■■■ 4.87
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CBX4-202ENST00000448310 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa45.45■■■■■ 4.87
CBX4-202ENST00000448310 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa45.45■■■■■ 4.87
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CBX4-202ENST00000448310 A2MP01023 1474 aa45.27■■■■■ 4.84
CBX4-202ENST00000448310 MROH2AA6NES4 1674 aa45.24■■■■■ 4.83
CBX4-202ENST00000448310 MBD5Q9P267 1494 aa45.23■■■■■ 4.83
CBX4-202ENST00000448310 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.22■■■■■ 4.83
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CBX4-202ENST00000448310 VPS8Q8N3P4 1428 aa45.08■■■■■ 4.81
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CBX4-202ENST00000448310 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa44.93■■■■■ 4.78
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CBX4-202ENST00000448310 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.87■■■■■ 4.77
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CBX4-202ENST00000448310 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
CBX4-202ENST00000448310 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
CBX4-202ENST00000448310 MAP3K1Q13233 1512 aa44.8■■■■■ 4.76
CBX4-202ENST00000448310 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa44.76■■■■■ 4.76
CBX4-202ENST00000448310 TSPY4P0CV99 314 aa44.75■■■■■ 4.75
CBX4-202ENST00000448310 TSPY10P0CW01 314 aa44.75■■■■■ 4.75
CBX4-202ENST00000448310 LTBP4Q8N2S1 1624 aa44.73■■■■■ 4.75
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