RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446281.5

LMCD1-AS1-204, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMCD1-AS1, Length 932 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.61■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.6■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FAM69CQ0P6D2 419 aa29.59■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CD109Q6YHK3 1445 aa29.59■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.58■■■□□ 2.33
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.56■■■□□ 2.32
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.56■■■□□ 2.32
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.54■■■□□ 2.32
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.53■■■□□ 2.32
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.49■■■□□ 2.31
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FANCAO15360 1455 aa29.48■■■□□ 2.31
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.46■■■□□ 2.31
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.46■■■□□ 2.31
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ITGAEP38570 1179 aa29.43■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.43■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.42■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 AKNAQ7Z591 1439 aa29.39■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NEO1Q92859 1461 aa29.39■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ABCC1P33527 1531 aa29.39■■■□□ 2.3
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MBD5Q9P267 1494 aa29.38■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.38■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ABCC5O15440 1437 aa29.37■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DAPK1P53355 1430 aa29.37■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.37■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.36■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PTPRKQ15262 1439 aa29.35■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.35■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ADGRL1O94910 1474 aa29.34■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.34■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.31■■■□□ 2.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.31■■■□□ 2.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TSPOAP1O95153 1857 aa29.3■■■□□ 2.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TSPY4P0CV99 314 aa29.27■■■□□ 2.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TSPY10P0CW01 314 aa29.27■■■□□ 2.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.27■■■□□ 2.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.27■■■□□ 2.28
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.26■■■□□ 2.27
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.25■■■□□ 2.27
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.21■■■□□ 2.27
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ROCK1Q13464 1354 aa29.21■■■□□ 2.27
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 AFAP1Q8N556 730 aa29.2■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.2■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ADGRL2O95490 1459 aa29.19■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.18■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.17■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.16■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.15■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HFM1A2PYH4 1435 aa29.14■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.14■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NCOA1Q15788 1441 aa29.14■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.14■■■□□ 2.26
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.12■■■□□ 2.25
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 NAIPQ13075 1403 aa29.11■■■□□ 2.25
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KDM5CP41229 1560 aa29.11■■■□□ 2.25
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RAPGEF3O95398 923 aa29.1■■■□□ 2.25
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RICTORQ6R327 1708 aa29.09■■■□□ 2.25
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.07■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.06■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 PLXNC1O60486 1568 aa29.06■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ATP7AQ04656 1500 aa29.06■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.06■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.05■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.04■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.03■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIF15Q9NS87 1388 aa29.03■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.02■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 HRCP23327 699 aa29.02■■■□□ 2.24
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29■■■□□ 2.23
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.99■■■□□ 2.23
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.96■■■□□ 2.23
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.96■■■□□ 2.23
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.95■■■□□ 2.23
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KDM6BO15054 1643 aa28.94■■■□□ 2.22
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ERBINQ96RT1 1412 aa28.89■■■□□ 2.22
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ABCA6Q8N139 1617 aa28.89■■■□□ 2.22
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.88■■■□□ 2.21
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.88■■■□□ 2.21
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 A2MP01023 1474 aa28.86■■■□□ 2.21
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ATP10AO60312 1499 aa28.81■■■□□ 2.2
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 TRIM52Q96A61 297 aa28.79■■■□□ 2.2
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.78■■■□□ 2.2
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 REREQ9P2R6 1566 aa28.75■■■□□ 2.19
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 UNC13BO14795 1591 aa28.73■■■□□ 2.19
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 KIF3BO15066 747 aa28.73■■■□□ 2.19
LMCD1-AS1-204ENST00000446281 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms