RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442396.6

ZNF839-202, Transcript of zinc finger protein 839, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene ZNF839, Length 2,987 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ZNF839-202ENST00000442396 KDM6BO15054 1643 aa25.15■■□□□ 1.62
ZNF839-202ENST00000442396 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.13■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.1■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 TMC1Q8TDI8 760 aa25.09■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ZNF839-202ENST00000442396 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.08■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 HECW1Q76N89 1606 aa25.08■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 NESP48681 1621 aa25.07■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.07■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 PRDM2Q13029 1718 aa25.06■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 PDE4AP27815 886 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.03■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ZNF839-202ENST00000442396 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.01■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.01■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 GRIN2BQ13224 1484 aa25.01■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.98■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.98■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.97■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 SKAP1Q86WV1 359 aa24.96■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.96■■□□□ 1.59
ZNF839-202ENST00000442396 BACH2Q9BYV9 841 aa24.93■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 USP47Q96K76 1375 aa24.93■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.92■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.91■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 USP35Q9P2H5 1018 aa24.9■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 CUL7Q14999 1698 aa24.9■■□□□ 1.58
ZNF839-202ENST00000442396 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.89■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 ARHGEF11O15085 1522 aa24.87■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 SLC4A3P48751 1232 aa24.87■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 TOPBP1Q92547 1522 aa24.86■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 SAMD9Q5K651 1589 aa24.86■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 PLIN1O60240 522 aa24.86■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 MIA2Q96PC5 1412 aa24.84■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.84■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ZNF839-202ENST00000442396 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.83■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.82■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.81■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 MS4A1P11836 297 aa24.79■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 GSE1Q14687 1217 aa24.78■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.77■■□□□ 1.56
ZNF839-202ENST00000442396 DAPK1P53355 1430 aa24.76■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.76■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 NFKBIBQ15653 356 aa24.75■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 KIF15Q9NS87 1388 aa24.75■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.73■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 PKD2Q13563 968 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 CRBNQ96SW2 442 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 ABCC5O15440 1437 aa24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
ZNF839-202ENST00000442396 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 ROCK1Q13464 1354 aa24.68■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 RALBP1Q15311 655 aa24.67■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.67■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 PZPP20742 1482 aa24.65■■□□□ 1.54
ZNF839-202ENST00000442396 KDM5CP41229 1560 aa24.63■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 MBD5Q9P267 1494 aa24.62■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.62■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 PDE3BQ13370 1112 aa24.61■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 NLRP13Q86W25 1043 aa24.61■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.6■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
ZNF839-202ENST00000442396 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.57■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 KIF14Q15058 1648 aa24.56■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.56■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 RGS3P49796 1198 aa24.53■■□□□ 1.52
ZNF839-202ENST00000442396 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.51■■□□□ 1.51
ZNF839-202ENST00000442396 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms