RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DISP3Q9P2K9 1392 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.05□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLCB2Q00722 1185 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEX14Q8IWB6 1497 aa10.04□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAMTSL3P82987 1691 aa10.03□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.02□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPRMP28827 1452 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTPRGP23470 1445 aa10.01□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MADDQ8WXG6 1647 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.99□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLHL34Q8N239 644 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPOCK2Q92563 424 aa9.98□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIER1Q8N108 512 aa9.97□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.97□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.96□□□□□ -0.81
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.96□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UACAQ9BZF9 1416 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CERKQ8TCT0 537 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IQGAP2Q13576 1575 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARXQ96QS3 562 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DISP1Q96F81 1524 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSPA2P54652 639 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HAX1O00165 279 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD109Q6YHK3 1445 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CREBZFQ9NS37 354 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA0556O60303 1618 aa9.87□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.86□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGF1RP08069 1367 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.85□□□□□ -0.83
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STRCQ7RTU9 1775 aa9.83□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHADLQ6NUI6 762 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.81□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.8□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNH8Q96L42 1107 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCA8O94911 1581 aa9.79□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RGL2O15211 777 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF27Q86VH2 1401 aa9.78□□□□□ -0.84
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RICTORQ6R327 1708 aa9.77□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAPGEF3O95398 923 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TTC37Q6PGP7 1564 aa9.76□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EVX2Q03828 476 aa9.75□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.74□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LTBP4Q8N2S1 1624 aa9.73□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCANQ96GW7 911 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEO1Q92859 1461 aa9.71□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FANCAO15360 1455 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM212AQ96EL1 285 aa9.69□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARID3CA6NKF2 412 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFAP44Q96MT7 982 aa9.68□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GSE1Q14687 1217 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa9.67□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHLDB1Q86UU1 1377 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa9.66□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP10BO94823 1461 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.65□□□□□ -0.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MLECQ14165 292 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.64□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUBP1P53384 320 aa9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 173.3 ms