RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438576.2

C11orf68-201, Transcript of chromosome 11 open reading frame 68, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene C11orf68, Length 1,619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf68-201ENST00000438576 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.28■■■■■ 4.84
C11orf68-201ENST00000438576 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
C11orf68-201ENST00000438576 PREX2Q70Z35 1606 aa45.27■■■■■ 4.84
C11orf68-201ENST00000438576 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
C11orf68-201ENST00000438576 NCOA2Q15596 1464 aa45.25■■■■■ 4.83
C11orf68-201ENST00000438576 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.25■■■■■ 4.83
C11orf68-201ENST00000438576 CCNB3Q8WWL7 1395 aa45.25■■■■■ 4.83
C11orf68-201ENST00000438576 RAPGEF3O95398 923 aa45.16■■■■■ 4.82
C11orf68-201ENST00000438576 ADGRL1O94910 1474 aa45.14■■■■■ 4.82
C11orf68-201ENST00000438576 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP45.12■■■■■ 4.81
C11orf68-201ENST00000438576 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.11■■■■■ 4.81
C11orf68-201ENST00000438576 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
C11orf68-201ENST00000438576 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.08■■■■■ 4.81
C11orf68-201ENST00000438576 ITSN2Q9NZM3 1697 aa45.04■■■■■ 4.8
C11orf68-201ENST00000438576 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.04■■■■■ 4.8
C11orf68-201ENST00000438576 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa45.01■■■■■ 4.8
C11orf68-201ENST00000438576 RICTORQ6R327 1708 aa45.01■■■■■ 4.8
C11orf68-201ENST00000438576 ABCC1P33527 1531 aa44.98■■■■■ 4.79
C11orf68-201ENST00000438576 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa44.98■■■■■ 4.79
C11orf68-201ENST00000438576 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP44.98■■■■■ 4.79
C11orf68-201ENST00000438576 POGZQ7Z3K3 1410 aa44.96■■■■■ 4.79
C11orf68-201ENST00000438576 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
C11orf68-201ENST00000438576 AFAP1Q8N556 730 aa44.91■■■■■ 4.78
C11orf68-201ENST00000438576 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.9■■■■■ 4.78
C11orf68-201ENST00000438576 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP44.89■■■■■ 4.78
C11orf68-201ENST00000438576 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa44.89■■■■■ 4.78
C11orf68-201ENST00000438576 SYCP2Q9BX26 1530 aa44.87■■■■■ 4.77
C11orf68-201ENST00000438576 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa44.85■■■■■ 4.77
C11orf68-201ENST00000438576 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa44.84■■■■■ 4.77
C11orf68-201ENST00000438576 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa44.84■■■■■ 4.77
C11orf68-201ENST00000438576 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP44.83■■■■■ 4.77
C11orf68-201ENST00000438576 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa44.82■■■■■ 4.77
C11orf68-201ENST00000438576 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa44.8■■■■■ 4.76
C11orf68-201ENST00000438576 MIA2Q96PC5 1412 aa44.79■■■■■ 4.76
C11orf68-201ENST00000438576 PCGF6Q9BYE7 350 aa44.78■■■■■ 4.76
C11orf68-201ENST00000438576 KDM5CP41229 1560 aa44.77■■■■■ 4.76
C11orf68-201ENST00000438576 MBD5Q9P267 1494 aa44.75■■■■■ 4.75
C11orf68-201ENST00000438576 YEATS2Q9ULM3 1422 aa44.72■■■■■ 4.75
C11orf68-201ENST00000438576 MAGI2Q86UL8 1455 aa44.71■■■■■ 4.75
C11orf68-201ENST00000438576 FGD6Q6ZV73 1430 aa44.69■■■■■ 4.74
C11orf68-201ENST00000438576 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa44.67■■■■■ 4.74
C11orf68-201ENST00000438576 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa44.65■■■■■ 4.74
C11orf68-201ENST00000438576 MYT1LQ9UL68 1186 aa44.64■■■■■ 4.74
C11orf68-201ENST00000438576 MLH3Q9UHC1 1453 aa44.64■■■■■ 4.74
C11orf68-201ENST00000438576 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.64■■■■■ 4.74
C11orf68-201ENST00000438576 PTPN23Q9H3S7 1636 aa44.63■■■■■ 4.73
C11orf68-201ENST00000438576 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP44.6■■■■■ 4.73
C11orf68-201ENST00000438576 CCDC141Q6ZP82 1450 aa44.57■■■■■ 4.72
C11orf68-201ENST00000438576 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa44.56■■■■■ 4.72
C11orf68-201ENST00000438576 ARHGEF5Q12774 1597 aa44.55■■■■■ 4.72
C11orf68-201ENST00000438576 RSPH4AQ5TD94 716 aa44.55■■■■■ 4.72
C11orf68-201ENST00000438576 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
C11orf68-201ENST00000438576 ATP10AO60312 1499 aa44.51■■■■■ 4.72
C11orf68-201ENST00000438576 ABCA6Q8N139 1617 aa44.5■■■■■ 4.71
C11orf68-201ENST00000438576 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa44.49■■■■■ 4.71
C11orf68-201ENST00000438576 ATP7AQ04656 1500 aa44.49■■■■■ 4.71
C11orf68-201ENST00000438576 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP44.49■■■■■ 4.71
C11orf68-201ENST00000438576 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
C11orf68-201ENST00000438576 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa44.45■■■■■ 4.71
C11orf68-201ENST00000438576 TSPY4P0CV99 314 aa44.42■■■■■ 4.7
C11orf68-201ENST00000438576 TSPY10P0CW01 314 aa44.42■■■■■ 4.7
C11orf68-201ENST00000438576 C9orf84Q5VXU9 1444 aa44.42■■■■■ 4.7
C11orf68-201ENST00000438576 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa44.41■■■■■ 4.7
C11orf68-201ENST00000438576 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
C11orf68-201ENST00000438576 ABCC5O15440 1437 aa44.4■■■■■ 4.7
C11orf68-201ENST00000438576 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.36■■■■■ 4.69
C11orf68-201ENST00000438576 DAPK1P53355 1430 aa44.35■■■■■ 4.69
C11orf68-201ENST00000438576 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
C11orf68-201ENST00000438576 REREQ9P2R6 1566 aa44.31■■■■■ 4.68
C11orf68-201ENST00000438576 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.3■■■■■ 4.68
C11orf68-201ENST00000438576 CROCC2H7BZ55 1655 aa44.28■■■■■ 4.68
C11orf68-201ENST00000438576 A2MP01023 1474 aa44.25■■■■■ 4.67
C11orf68-201ENST00000438576 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
C11orf68-201ENST00000438576 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.24■■■■■ 4.67
C11orf68-201ENST00000438576 ADGBQ8N7X0 1667 aa44.22■■■■■ 4.67
C11orf68-201ENST00000438576 BCORL1Q5H9F3 1711 aa44.22■■■■■ 4.67
C11orf68-201ENST00000438576 MLECQ14165 292 aa44.21■■■■■ 4.67
C11orf68-201ENST00000438576 CHIC2Q9UKJ5 165 aa44.21■■■■■ 4.67
C11orf68-201ENST00000438576 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.19■■■■■ 4.662e-8■■■■■ 65.9
C11orf68-201ENST00000438576 PLXNC1O60486 1568 aa44.18■■■■■ 4.66
C11orf68-201ENST00000438576 AGLP35573 1532 aa44.18■■■■■ 4.66
C11orf68-201ENST00000438576 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
C11orf68-201ENST00000438576 PTPRKQ15262 1439 aa44.14■■■■■ 4.66
C11orf68-201ENST00000438576 ADAMTSL3P82987 1691 aa44.14■■■■■ 4.66
C11orf68-201ENST00000438576 HRCP23327 699 aa44.13■■■■■ 4.66
C11orf68-201ENST00000438576 ITGAEP38570 1179 aa44.11■■■■■ 4.65
C11orf68-201ENST00000438576 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.1■■■■■ 4.65
C11orf68-201ENST00000438576 KIF15Q9NS87 1388 aa44.05■■■■■ 4.64
C11orf68-201ENST00000438576 MADDQ8WXG6 1647 aa44.05■■■■■ 4.64
C11orf68-201ENST00000438576 NCOA1Q15788 1441 aa44.05■■■■■ 4.64
C11orf68-201ENST00000438576 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa44.04■■■■■ 4.64
C11orf68-201ENST00000438576 ADGRL2O95490 1459 aa44.02■■■■■ 4.64
C11orf68-201ENST00000438576 KIF3BO15066 747 aa43.99■■■■■ 4.63
C11orf68-201ENST00000438576 DUOX2Q9NRD8 1548 aa43.98■■■■■ 4.63
C11orf68-201ENST00000438576 GGT6Q6P531 493 aa43.96■■■■■ 4.63
C11orf68-201ENST00000438576 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa43.93■■■■■ 4.62
C11orf68-201ENST00000438576 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
C11orf68-201ENST00000438576 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.9■■■■■ 4.62
C11orf68-201ENST00000438576 PTPRMP28827 1452 aa43.88■■■■■ 4.62
C11orf68-201ENST00000438576 ROCK1Q13464 1354 aa43.88■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms