RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438233.2

CYCSP43-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 43, humanhuman

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Gene CYCSP43, Length 310 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP43-201ENST00000438233 WIZO95785 1651 aa7.51□□□□□ -1.21
CYCSP43-201ENST00000438233 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CYCSP43-201ENST00000438233 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
CYCSP43-201ENST00000438233 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CYCSP43-201ENST00000438233 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CYCSP43-201ENST00000438233 CEP164Q9UPV0 1460 aa7.48□□□□□ -1.21
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGEF11O15085 1522 aa7.47□□□□□ -1.21
CYCSP43-201ENST00000438233 CADPSQ9ULU8 1353 aa7.47□□□□□ -1.21
CYCSP43-201ENST00000438233 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.46□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.46□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 CHD1O14646 1710 aa7.46□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 PSEN1P49768 467 aa7.45□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.44□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 NBR1Q14596 966 aa7.44□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 SEC24BO95487 1268 aa7.43□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 CFTRP13569 1480 aa7.42□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 IFNL1Q8IU54 200 aa7.41□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 KIF12Q96FN5 646 aa7.41□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 ARAP1Q96P48 1450 aa7.41□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 MAP3K13O43283 966 aa7.4□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CYCSP43-201ENST00000438233 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.38□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 POTEJP0CG39 1038 aa7.37□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.37□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 MFRPQ9BY79 579 aa7.37□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 TIE1P35590 1138 aa7.36□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 P3H3Q8IVL6 736 aa7.36□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 SOX12O15370 315 aa7.35□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 CABP2Q9NPB3 220 aa7.35□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.34□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 NLRP6P59044 892 aa7.34□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 EFCAB3Q8N7B9 438 aa7.34□□□□□ -1.23
CYCSP43-201ENST00000438233 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 WDR70Q9NW82 654 aa7.33□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 TOPBP1Q92547 1522 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 IFT140Q96RY7 1462 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 FBXO22Q8NEZ5 403 aa7.32□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.31□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.3□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 IER5LQ5T953 404 aa7.3□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 PHF8Q9UPP1 1060 aa7.3□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 WDR97A6NE52 1622 aa7.3□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 GOLGA2Q08379 1002 aa7.29□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.29□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CYCSP43-201ENST00000438233 PPP1R37O75864 691 aa7.27□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.27□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.26□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 SNPHO15079 494 aa7.25□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 PLCG2P16885 1265 aa7.25□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.25□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.25□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 KIF13AQ9H1H9 1805 aa7.24□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 POTEFA5A3E0 1075 aa7.24□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 PBRM1Q86U86 1689 aa7.23□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 ST18O60284 1047 aa7.23□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.22□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 TRPC6Q9Y210 931 aa7.22□□□□□ -1.25
CYCSP43-201ENST00000438233 CCDC88BA6NC98 1476 aa7.21□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.21□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 ERCC6L2Q5T890 1561 aa7.2□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 MMRN1Q13201 1228 aa7.2□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 E2F4Q16254 413 aa7.2□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.2□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 SYNJ1O43426 1573 aa7.2□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 PDE4AP27815 886 aa7.19□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.18□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.17□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 ABCC8Q09428 1581 aa7.17□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.17□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.17□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.17□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 SHROOM2Q13796 1616 aa7.16□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 MFSD10Q14728 455 aa7.16□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
CYCSP43-201ENST00000438233 CUX1P39880 1505 aa7.15□□□□□ -1.27
CYCSP43-201ENST00000438233 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.14□□□□□ -1.27
CYCSP43-201ENST00000438233 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.14□□□□□ -1.27
CYCSP43-201ENST00000438233 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.13□□□□□ -1.27
CYCSP43-201ENST00000438233 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
CYCSP43-201ENST00000438233 CEP170Q5SW79 1584 aa7.12□□□□□ -1.27
CYCSP43-201ENST00000438233 SYNJ2O15056 1496 aa7.12□□□□□ -1.27
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