RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 UACAQ9BZF9 1416 aa18.58■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.57■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 CUL7Q14999 1698 aa18.56■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC184Q52MB2 194 aa18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 TMC1Q8TDI8 760 aa18.54■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 IQGAP2Q13576 1575 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPRGP23470 1445 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 HFM1A2PYH4 1435 aa18.53■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 IFT140Q96RY7 1462 aa18.52■□□□□ 0.56
RABGEF1-210ENST00000437078 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.55
RABGEF1-210ENST00000437078 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1-210ENST00000437078 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.47■□□□□ 0.55
RABGEF1-210ENST00000437078 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.46■□□□□ 0.55
RABGEF1-210ENST00000437078 MAP3K1Q13233 1512 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 GRIN2AQ12879 1464 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 CCER2I3L3R5 266 aa18.41■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 DAPK1P53355 1430 aa18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1-210ENST00000437078 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 HECW1Q76N89 1606 aa18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCC5O15440 1437 aa18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 AFAP1Q8N556 730 aa18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.39■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF11O15085 1522 aa18.38■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.38■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC24A1O60721 1099 aa18.37■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 GGT6Q6P531 493 aa18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF15Q9NS87 1388 aa18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.36■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 NBPF1Q3BBV0 1214 aa18.34■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF3BO15066 747 aa18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1-210ENST00000437078 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 USP47Q96K76 1375 aa18.32■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAMTS12P58397 1594 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.31■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 SYNJ2O15056 1496 aa18.3■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC7Q96M83 1385 aa18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 MIA2Q96PC5 1412 aa18.29■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 DISP1Q96F81 1524 aa18.28■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.27■□□□□ 0.52
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 KDM6BO15054 1643 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 PBRM1Q86U86 1689 aa18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.25■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 SAMD9Q5K651 1589 aa18.24■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.23■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR62O43379 1518 aa18.23■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 NCOA1Q15788 1441 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 MLECQ14165 292 aa18.22■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
RABGEF1-210ENST00000437078 NEUROD2Q15784 382 aa18.2■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA0556O60303 1618 aa18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP10BO94823 1461 aa18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.19■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.18■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.17■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 PANK3Q9H999 370 aa18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 AKNAQ7Z591 1439 aa18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.16■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.15■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 STK26Q9P289 416 aa18.14■□□□□ 0.5
RABGEF1-210ENST00000437078 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP170Q5SW79 1584 aa18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 KIF14Q15058 1648 aa18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TMF1P82094 1093 aa18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.12■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 ROCK1Q13464 1354 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.1■□□□□ 0.49
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms