RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433557.1

UTRN-208, Transcript of utrophin, humanhuman

TSL 4

Gene UTRN, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRN-208ENST00000433557 AKNAQ7Z591 1439 aa34.55■■■■□ 3.12
UTRN-208ENST00000433557 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.54■■■■□ 3.12
UTRN-208ENST00000433557 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.53■■■■□ 3.12
UTRN-208ENST00000433557 CCNB3Q8WWL7 1395 aa34.51■■■■□ 3.12
UTRN-208ENST00000433557 ITSN2Q9NZM3 1697 aa34.48■■■■□ 3.11
UTRN-208ENST00000433557 ADGRL1O94910 1474 aa34.46■■■■□ 3.11
UTRN-208ENST00000433557 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 NCOA2Q15596 1464 aa34.44■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 RAPGEF3O95398 923 aa34.4■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.39■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 RICTORQ6R327 1708 aa34.39■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
UTRN-208ENST00000433557 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.36■■■■□ 3.09
UTRN-208ENST00000433557 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa34.32■■■■□ 3.09
UTRN-208ENST00000433557 ABCC1P33527 1531 aa34.32■■■■□ 3.08
UTRN-208ENST00000433557 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.3■■■■□ 3.08
UTRN-208ENST00000433557 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.25■■■■□ 3.07
UTRN-208ENST00000433557 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa34.25■■■■□ 3.07
UTRN-208ENST00000433557 SYCP2Q9BX26 1530 aa34.24■■■■□ 3.07
UTRN-208ENST00000433557 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.23■■■■□ 3.07
UTRN-208ENST00000433557 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.21■■■■□ 3.07
UTRN-208ENST00000433557 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.2■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.19■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.17■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 AFAP1Q8N556 730 aa34.17■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP34.16■■■■□ 3.063e-7■■■□□ 16
UTRN-208ENST00000433557 KDM5CP41229 1560 aa34.15■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.15■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.15■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa34.15■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa34.15■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.14■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.14■■■■□ 3.06
UTRN-208ENST00000433557 MIA2Q96PC5 1412 aa34.1■■■■□ 3.05
UTRN-208ENST00000433557 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
UTRN-208ENST00000433557 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.07■■■■□ 3.04
UTRN-208ENST00000433557 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.04■■■■□ 3.04
UTRN-208ENST00000433557 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
UTRN-208ENST00000433557 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.02■■■■□ 3.04
UTRN-208ENST00000433557 MBD5Q9P267 1494 aa34.01■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 FGD6Q6ZV73 1430 aa34■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.99■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 ABCA6Q8N139 1617 aa33.98■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 ARHGEF5Q12774 1597 aa33.98■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 ATP7AQ04656 1500 aa33.97■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.97■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 ATP10AO60312 1499 aa33.96■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.96■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
UTRN-208ENST00000433557 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.95■■■■□ 3.02
UTRN-208ENST00000433557 TSPY4P0CV99 314 aa33.89■■■■□ 3.02
UTRN-208ENST00000433557 TSPY10P0CW01 314 aa33.89■■■■□ 3.02
UTRN-208ENST00000433557 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
UTRN-208ENST00000433557 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.87■■■■□ 3.01
UTRN-208ENST00000433557 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
UTRN-208ENST00000433557 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.85■■■■□ 3.01
UTRN-208ENST00000433557 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.84■■■■□ 3.01
UTRN-208ENST00000433557 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.84■■■■□ 3.01
UTRN-208ENST00000433557 REREQ9P2R6 1566 aa33.84■■■■□ 3.01
UTRN-208ENST00000433557 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.84■■■■□ 3.01
UTRN-208ENST00000433557 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.82■■■■□ 3
UTRN-208ENST00000433557 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
UTRN-208ENST00000433557 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
UTRN-208ENST00000433557 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.79■■■■□ 3
UTRN-208ENST00000433557 MLECQ14165 292 aa33.78■■■■□ 3
UTRN-208ENST00000433557 DAPK1P53355 1430 aa33.76■■■□□ 2.99
UTRN-208ENST00000433557 A2MP01023 1474 aa33.76■■■□□ 2.99
UTRN-208ENST00000433557 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.74■■■□□ 2.99
UTRN-208ENST00000433557 ABCC5O15440 1437 aa33.74■■■□□ 2.99
UTRN-208ENST00000433557 SHANK2Q9UPX8 1470 aa33.72■■■□□ 2.99
UTRN-208ENST00000433557 AGLP35573 1532 aa33.72■■■□□ 2.99
UTRN-208ENST00000433557 MADDQ8WXG6 1647 aa33.71■■■□□ 2.99
UTRN-208ENST00000433557 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.7■■■□□ 2.98
UTRN-208ENST00000433557 PLXNC1O60486 1568 aa33.69■■■□□ 2.98
UTRN-208ENST00000433557 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
UTRN-208ENST00000433557 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
UTRN-208ENST00000433557 CHIC2Q9UKJ5 165 aa33.63■■■□□ 2.97
UTRN-208ENST00000433557 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
UTRN-208ENST00000433557 ITGAEP38570 1179 aa33.58■■■□□ 2.97
UTRN-208ENST00000433557 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
UTRN-208ENST00000433557 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.58■■■□□ 2.97
UTRN-208ENST00000433557 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP33.58■■■□□ 2.97
UTRN-208ENST00000433557 KIF15Q9NS87 1388 aa33.57■■■□□ 2.96
UTRN-208ENST00000433557 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa33.56■■■□□ 2.96
UTRN-208ENST00000433557 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.56■■■□□ 2.96
UTRN-208ENST00000433557 KIF3BO15066 747 aa33.54■■■□□ 2.96
UTRN-208ENST00000433557 GGT6Q6P531 493 aa33.54■■■□□ 2.96
UTRN-208ENST00000433557 PTPRMP28827 1452 aa33.53■■■□□ 2.96
UTRN-208ENST00000433557 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.96
UTRN-208ENST00000433557 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.51■■■□□ 2.95
UTRN-208ENST00000433557 ADGRL2O95490 1459 aa33.5■■■□□ 2.95
UTRN-208ENST00000433557 NCOA1Q15788 1441 aa33.47■■■□□ 2.95
UTRN-208ENST00000433557 PTPRKQ15262 1439 aa33.45■■■□□ 2.95
UTRN-208ENST00000433557 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms