RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433557.1

UTRN-208, Transcript of utrophin, humanhuman

TSL 4

Gene UTRN, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRN-208ENST00000433557 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.91■■■■■ 6.06
UTRN-208ENST00000433557 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.05■■■■■ 5.12
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UTRN-208ENST00000433557 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.27■■■■■ 4.68
UTRN-208ENST00000433557 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.18■■■■■ 4.66
UTRN-208ENST00000433557 NACADO15069 1562 aa44.13■■■■■ 4.65
UTRN-208ENST00000433557 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
UTRN-208ENST00000433557 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.84■■■■■ 4.61
UTRN-208ENST00000433557 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.75■■■■■ 4.59
UTRN-208ENST00000433557 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.23■■■■■ 4.51
UTRN-208ENST00000433557 SCRIBQ14160 1630 aa42.97■■■■■ 4.47
UTRN-208ENST00000433557 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.81■■■■■ 4.44
UTRN-208ENST00000433557 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.73■■■■■ 4.43
UTRN-208ENST00000433557 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.31■■■■■ 4.36
UTRN-208ENST00000433557 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.71■■■■■ 4.27
UTRN-208ENST00000433557 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
UTRN-208ENST00000433557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.45■■■■■ 4.23
UTRN-208ENST00000433557 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.18■■■■■ 4.18
UTRN-208ENST00000433557 SMARCA4P51532 1647 aa41.07■■■■■ 4.17
UTRN-208ENST00000433557 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
UTRN-208ENST00000433557 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.79■■■■■ 4.12
UTRN-208ENST00000433557 SMARCA2P51531 1590 aa40.76■■■■■ 4.12
UTRN-208ENST00000433557 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.72■■■■■ 4.11
UTRN-208ENST00000433557 NCAPD3P42695 1498 aa40.64■■■■■ 4.1
UTRN-208ENST00000433557 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.59■■■■■ 4.09
UTRN-208ENST00000433557 HMGXB3Q12766 1538 aa40.52■■■■■ 4.08
UTRN-208ENST00000433557 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
UTRN-208ENST00000433557 WIZO95785 1651 aa40.43■■■■■ 4.06
UTRN-208ENST00000433557 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
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UTRN-208ENST00000433557 NESP48681 1621 aa39.67■■■■□ 3.94
UTRN-208ENST00000433557 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.64■■■■□ 3.94
UTRN-208ENST00000433557 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.93
UTRN-208ENST00000433557 ERCC6Q03468 1493 aa39.53■■■■□ 3.92
UTRN-208ENST00000433557 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.5■■■■□ 3.91
UTRN-208ENST00000433557 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.48■■■■□ 3.91
UTRN-208ENST00000433557 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.35■■■■□ 3.89
UTRN-208ENST00000433557 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.31■■■■□ 3.88
UTRN-208ENST00000433557 CFTRP13569 1480 aa39.3■■■■□ 3.88
UTRN-208ENST00000433557 PRDM2Q13029 1718 aa39.21■■■■□ 3.87
UTRN-208ENST00000433557 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.1■■■■□ 3.85
UTRN-208ENST00000433557 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.06■■■■□ 3.84
UTRN-208ENST00000433557 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
UTRN-208ENST00000433557 CUX2O14529 1486 aa38.95■■■■□ 3.83
UTRN-208ENST00000433557 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.93■■■■□ 3.82
UTRN-208ENST00000433557 WDR62O43379 1518 aa38.78■■■■□ 3.8
UTRN-208ENST00000433557 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
UTRN-208ENST00000433557 ABCC8Q09428 1581 aa38.52■■■■□ 3.76
UTRN-208ENST00000433557 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.49■■■■□ 3.75
UTRN-208ENST00000433557 TOPBP1Q92547 1522 aa38.48■■■■□ 3.75
UTRN-208ENST00000433557 CUX1P39880 1505 aa38.27■■■■□ 3.72
UTRN-208ENST00000433557 IFT140Q96RY7 1462 aa38.2■■■■□ 3.71
UTRN-208ENST00000433557 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
UTRN-208ENST00000433557 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.13■■■■□ 3.69
UTRN-208ENST00000433557 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.12■■■■□ 3.69
UTRN-208ENST00000433557 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
UTRN-208ENST00000433557 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.05■■■■□ 3.68
UTRN-208ENST00000433557 SOGA1O94964 1423 aa38.03■■■■□ 3.68
UTRN-208ENST00000433557 SYNJ1O43426 1573 aa38.02■■■■□ 3.68
UTRN-208ENST00000433557 TOP2BQ02880 1626 aa38.02■■■■□ 3.68
UTRN-208ENST00000433557 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.01■■■■□ 3.67
UTRN-208ENST00000433557 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
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UTRN-208ENST00000433557 WDR97A6NE52 1622 aa37.83■■■■□ 3.65
UTRN-208ENST00000433557 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.81■■■■□ 3.64
UTRN-208ENST00000433557 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
UTRN-208ENST00000433557 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.73■■■■□ 3.63
UTRN-208ENST00000433557 PBRM1Q86U86 1689 aa37.62■■■■□ 3.61
UTRN-208ENST00000433557 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.61■■■■□ 3.61
UTRN-208ENST00000433557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.61■■■■□ 3.61
UTRN-208ENST00000433557 GRIN2BQ13224 1484 aa37.57■■■■□ 3.6
UTRN-208ENST00000433557 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.51■■■■□ 3.59
UTRN-208ENST00000433557 CHD1O14646 1710 aa37.47■■■■□ 3.59
UTRN-208ENST00000433557 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.45■■■■□ 3.59
UTRN-208ENST00000433557 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
UTRN-208ENST00000433557 FBLN2P98095 1184 aa37.42■■■■□ 3.58
UTRN-208ENST00000433557 TRIM41Q8WV44 630 aa37.41■■■■□ 3.58
UTRN-208ENST00000433557 OSCARQ8IYS5 282 aa37.38■■■■□ 3.57
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UTRN-208ENST00000433557 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.31■■■■□ 3.56
UTRN-208ENST00000433557 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
UTRN-208ENST00000433557 SYNJ2O15056 1496 aa37.29■■■■□ 3.56
UTRN-208ENST00000433557 ADAMTS12P58397 1594 aa37.25■■■■□ 3.55
UTRN-208ENST00000433557 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.16■■■■□ 3.54
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UTRN-208ENST00000433557 IGF1RP08069 1367 aa37.04■■■■□ 3.52
UTRN-208ENST00000433557 CHIC1Q5VXU3 224 aa37■■■■□ 3.51
UTRN-208ENST00000433557 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37■■■■□ 3.51
UTRN-208ENST00000433557 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.93■■■■□ 3.5
UTRN-208ENST00000433557 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.91■■■■□ 3.5
UTRN-208ENST00000433557 CEP170Q5SW79 1584 aa36.9■■■■□ 3.5
UTRN-208ENST00000433557 NUP160Q12769 1436 aa36.85■■■■□ 3.49
UTRN-208ENST00000433557 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.81■■■■□ 3.48
UTRN-208ENST00000433557 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.81■■■■□ 3.48
UTRN-208ENST00000433557 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.81■■■■□ 3.48
UTRN-208ENST00000433557 ARHGEF11O15085 1522 aa36.78■■■■□ 3.48
UTRN-208ENST00000433557 EEA1Q15075 1411 aa36.74■■■■□ 3.47
UTRN-208ENST00000433557 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.73■■■■□ 3.47
UTRN-208ENST00000433557 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
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