RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.28□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 CASC1Q6TDU7 716 aa14.27□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.27□□□□□ -0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 C14orf37Q86TY3 774 aa14.27□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS3P49796 1198 aa14.26□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.25□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHG5O94827 1062 aa14.24□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 NEUROD2Q15784 382 aa14.23□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 ERCC6Q03468 1493 aa14.23□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCB2Q00722 1185 aa14.22□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.22□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.21□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIN2BQ13224 1484 aa14.21□□□□□ -0.13
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.2□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.19□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDCQ9Y266 331 aa14.19□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.18□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 NRDCO43847 1150 aa14.17□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.17□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.17□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.16□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP170Q5SW79 1584 aa14.16□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 MS4A1P11836 297 aa14.16□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.16□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNH8Q96L42 1107 aa14.16□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 FGD1P98174 961 aa14.14□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 TIAM1Q13009 1591 aa14.12□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.12□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIN2AQ12879 1464 aa14.11□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K1Q13233 1512 aa14.11□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 IQGAP2Q13576 1575 aa14.11□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNJ4P48050 445 aa14.11□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.1□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.1□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.1□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.09□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 DISP1Q96F81 1524 aa14.09□□□□□ -0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 HSCBQ8IWL3 235 aa14.08□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.07□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNJ2O15056 1496 aa14.06□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 POGKQ9P215 609 aa14.06□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP160Q12769 1436 aa14.05□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 CHD1O14646 1710 aa14.05□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0556O60303 1618 aa14.04□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.04□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.03□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.03□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.02□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.02□□□□□ -0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 TMF1P82094 1093 aa14□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 MCCP23508 829 aa13.99□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 CCER2I3L3R5 266 aa13.99□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP44Q96MT7 982 aa13.99□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 SHROOM2Q13796 1616 aa13.98□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF11O15085 1522 aa13.97□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 NPHP1O15259 732 aa13.96□□□□□ -0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 GOLGA2Q08379 1002 aa13.96□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 DRC7Q8IY82 874 aa13.96□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.96□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF11Q8TEB1 546 aa13.95□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 GBP4Q96PP9 640 aa13.93□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 FMN1Q68DA7 1419 aa13.92□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.92□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 PHLDB1Q86UU1 1377 aa13.92□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 MORC1Q86VD1 984 aa13.91□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.9□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa13.9□□□□□ -0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.1 ms