RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425171.1

PXDN-202, Transcript of peroxidasin, humanhuman

TSL 5

Gene PXDN, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDN-202ENST00000425171 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.63■■■■□ 3.29
PXDN-202ENST00000425171 PREX2Q70Z35 1606 aa35.62■■■■□ 3.29
PXDN-202ENST00000425171 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa35.59■■■■□ 3.29
PXDN-202ENST00000425171 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
PXDN-202ENST00000425171 RAPGEF3O95398 923 aa35.58■■■■□ 3.29
PXDN-202ENST00000425171 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.57■■■■□ 3.29
PXDN-202ENST00000425171 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.56■■■■□ 3.28
PXDN-202ENST00000425171 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
PXDN-202ENST00000425171 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.54■■■■□ 3.28
PXDN-202ENST00000425171 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
PXDN-202ENST00000425171 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.51■■■■□ 3.28
PXDN-202ENST00000425171 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.5■■■■□ 3.27
PXDN-202ENST00000425171 RICTORQ6R327 1708 aa35.49■■■■□ 3.27
PXDN-202ENST00000425171 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.49■■■■□ 3.27
PXDN-202ENST00000425171 NCOA2Q15596 1464 aa35.48■■■■□ 3.27
PXDN-202ENST00000425171 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.48■■■■□ 3.27
PXDN-202ENST00000425171 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.47■■■■□ 3.27
PXDN-202ENST00000425171 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.47■■■■□ 3.27
PXDN-202ENST00000425171 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.46■■■■□ 3.27
PXDN-202ENST00000425171 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.43■■■■□ 3.26
PXDN-202ENST00000425171 ABCC1P33527 1531 aa35.42■■■■□ 3.26
PXDN-202ENST00000425171 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PXDN-202ENST00000425171 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PXDN-202ENST00000425171 KDM5CP41229 1560 aa35.34■■■■□ 3.25
PXDN-202ENST00000425171 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.34■■■■□ 3.25
PXDN-202ENST00000425171 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.33■■■■□ 3.25
PXDN-202ENST00000425171 AFAP1Q8N556 730 aa35.32■■■■□ 3.24
PXDN-202ENST00000425171 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.32■■■■□ 3.24
PXDN-202ENST00000425171 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.32■■■■□ 3.24
PXDN-202ENST00000425171 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.29■■■■□ 3.24
PXDN-202ENST00000425171 MIA2Q96PC5 1412 aa35.29■■■■□ 3.24
PXDN-202ENST00000425171 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.28■■■■□ 3.24
PXDN-202ENST00000425171 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.26■■■■□ 3.24
PXDN-202ENST00000425171 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.25■■■■□ 3.23
PXDN-202ENST00000425171 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.25■■■■□ 3.23
PXDN-202ENST00000425171 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.23
PXDN-202ENST00000425171 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.24■■■■□ 3.23
PXDN-202ENST00000425171 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.23■■■■□ 3.23
PXDN-202ENST00000425171 ATP10AO60312 1499 aa35.22■■■■□ 3.23
PXDN-202ENST00000425171 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.19■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.17■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 MBD5Q9P267 1494 aa35.16■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.16■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.15■■■■□ 3.22
PXDN-202ENST00000425171 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.1■■■■□ 3.21
PXDN-202ENST00000425171 REREQ9P2R6 1566 aa35.1■■■■□ 3.21
PXDN-202ENST00000425171 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.1■■■■□ 3.21
PXDN-202ENST00000425171 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.08■■■■□ 3.21
PXDN-202ENST00000425171 TSPY4P0CV99 314 aa35.08■■■■□ 3.21
PXDN-202ENST00000425171 TSPY10P0CW01 314 aa35.08■■■■□ 3.21
PXDN-202ENST00000425171 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.05■■■■□ 3.2
PXDN-202ENST00000425171 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.05■■■■□ 3.2
PXDN-202ENST00000425171 ATP7AQ04656 1500 aa35.05■■■■□ 3.2
PXDN-202ENST00000425171 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.04■■■■□ 3.2
PXDN-202ENST00000425171 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
PXDN-202ENST00000425171 ABCA6Q8N139 1617 aa34.99■■■■□ 3.19
PXDN-202ENST00000425171 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.99■■■■□ 3.19
PXDN-202ENST00000425171 AGLP35573 1532 aa34.98■■■■□ 3.19
PXDN-202ENST00000425171 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.97■■■■□ 3.19
PXDN-202ENST00000425171 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
PXDN-202ENST00000425171 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.95■■■■□ 3.18
PXDN-202ENST00000425171 A2MP01023 1474 aa34.9■■■■□ 3.18
PXDN-202ENST00000425171 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.9■■■■□ 3.18
PXDN-202ENST00000425171 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.88■■■■□ 3.17
PXDN-202ENST00000425171 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.85■■■■□ 3.17
PXDN-202ENST00000425171 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
PXDN-202ENST00000425171 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.84■■■■□ 3.17
PXDN-202ENST00000425171 PLXNC1O60486 1568 aa34.83■■■■□ 3.17
PXDN-202ENST00000425171 MLECQ14165 292 aa34.82■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 PPP6R1Q9UPN7 881 aa34.81■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 ABCC5O15440 1437 aa34.81■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 DAPK1P53355 1430 aa34.8■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 PTPRMP28827 1452 aa34.78■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 MADDQ8WXG6 1647 aa34.78■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.78■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
PXDN-202ENST00000425171 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.73■■■■□ 3.15
PXDN-202ENST00000425171 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.72■■■■□ 3.15
PXDN-202ENST00000425171 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.72■■■■□ 3.15
PXDN-202ENST00000425171 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
PXDN-202ENST00000425171 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.7■■■■□ 3.15
PXDN-202ENST00000425171 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
PXDN-202ENST00000425171 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.66■■■■□ 3.14
PXDN-202ENST00000425171 KIF3BO15066 747 aa34.64■■■■□ 3.14
PXDN-202ENST00000425171 KIF15Q9NS87 1388 aa34.63■■■■□ 3.13
PXDN-202ENST00000425171 GGT6Q6P531 493 aa34.63■■■■□ 3.13
PXDN-202ENST00000425171 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.63■■■■□ 3.13
PXDN-202ENST00000425171 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
PXDN-202ENST00000425171 ADGRL2O95490 1459 aa34.6■■■■□ 3.13
PXDN-202ENST00000425171 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
PXDN-202ENST00000425171 NCOA1Q15788 1441 aa34.6■■■■□ 3.13
PXDN-202ENST00000425171 ERBINQ96RT1 1412 aa34.59■■■■□ 3.13
PXDN-202ENST00000425171 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.57■■■■□ 3.12
PXDN-202ENST00000425171 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms