RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425171.1

PXDN-202, Transcript of peroxidasin, humanhuman

TSL 5

Gene PXDN, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDN-202ENST00000425171 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.72■■■■■ 6.35
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PXDN-202ENST00000425171 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.78■■■■■ 4.92
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PXDN-202ENST00000425171 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.63■■■■■ 4.9
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PXDN-202ENST00000425171 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.22■■■■■ 4.67
PXDN-202ENST00000425171 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.09■■■■■ 4.65
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PXDN-202ENST00000425171 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.65■■■■■ 4.42
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PXDN-202ENST00000425171 SMARCA2P51531 1590 aa42.23■■■■■ 4.35
PXDN-202ENST00000425171 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.19■■■■■ 4.34
PXDN-202ENST00000425171 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.09■■■■■ 4.33
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PXDN-202ENST00000425171 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.35■■■■■ 4.05
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PXDN-202ENST00000425171 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.37■■■■□ 3.89
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PXDN-202ENST00000425171 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
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PXDN-202ENST00000425171 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.64■■■■□ 3.78
PXDN-202ENST00000425171 KIF27Q86VH2 1401 aa38.6■■■■□ 3.77
PXDN-202ENST00000425171 CHD1O14646 1710 aa38.58■■■■□ 3.77
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PXDN-202ENST00000425171 CEP170Q5SW79 1584 aa38.08■■■■□ 3.69
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PXDN-202ENST00000425171 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.92■■■■□ 3.66
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