RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.49■■□□□ 1.67
RALGPS1-208ENST00000424082 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-208ENST00000424082 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.46■■□□□ 1.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.45■■□□□ 1.67
RALGPS1-208ENST00000424082 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.44■■□□□ 1.66
RALGPS1-208ENST00000424082 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.42■■□□□ 1.66
RALGPS1-208ENST00000424082 CHD1O14646 1710 aa25.41■■□□□ 1.66
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
RALGPS1-208ENST00000424082 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
RALGPS1-208ENST00000424082 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
RALGPS1-208ENST00000424082 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM6BO15054 1643 aa25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1-208ENST00000424082 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.34■■□□□ 1.65
RALGPS1-208ENST00000424082 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC184Q52MB2 194 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-208ENST00000424082 MIA2Q96PC5 1412 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCA8O94911 1581 aa25.28■■□□□ 1.64
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXD1Q16676 465 aa25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
RALGPS1-208ENST00000424082 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.25■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 AKNAQ7Z591 1439 aa25.24■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPRGP23470 1445 aa25.23■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF14Q15058 1648 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP10BO94823 1461 aa25.22■■□□□ 1.63
RALGPS1-208ENST00000424082 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.19■■□□□ 1.62
RALGPS1-208ENST00000424082 NCOA1Q15788 1441 aa25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SHROOM2Q13796 1616 aa25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC7Q96M83 1385 aa25.16■■□□□ 1.62
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.16■■□□□ 1.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.15■■□□□ 1.62
RALGPS1-208ENST00000424082 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.13■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DAPK1P53355 1430 aa25.12■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.12■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC5O15440 1437 aa25.12■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MRS2Q9HD23 443 aa25.11■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.1■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.1■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.07■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.07■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.05■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.04■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.04■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.04■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.04■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.03■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.02■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 ROCK1Q13464 1354 aa25.02■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25■■□□□ 1.59
RALGPS1-208ENST00000424082 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCC2Q92887 1545 aa24.94■■□□□ 1.58
RALGPS1-208ENST00000424082 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
RALGPS1-208ENST00000424082 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RALGPS1-208ENST00000424082 PZPP20742 1482 aa24.88■■□□□ 1.57
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.579e-6■■■■□ 22.2
RALGPS1-208ENST00000424082 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.86■■□□□ 1.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.83■■□□□ 1.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRL2O95490 1459 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 USP47Q96K76 1375 aa24.82■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MBD5Q9P267 1494 aa24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PREX2Q70Z35 1606 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.8■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.79■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NBR1Q14596 966 aa24.78■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.77■■□□□ 1.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPY4P0CV99 314 aa24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPY10P0CW01 314 aa24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 PKD2Q13563 968 aa24.75■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDCQ9Y266 331 aa24.74■■□□□ 1.55
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms