RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RICTORQ6R327 1708 aa19.61■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.6■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PREX2Q70Z35 1606 aa19.6■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.6■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCNB3Q8WWL7 1395 aa19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.59■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
TTC28-AS1-203ENST00000419253 APLP2Q06481 763 aa19.58■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.57■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.57■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.55■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.54■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.54■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TIAM1Q13009 1591 aa19.53■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.53■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.52■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AFAP1Q8N556 730 aa19.52■□□□□ 0.72
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCC1P33527 1531 aa19.49■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.49■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 YEATS2Q9ULM3 1422 aa19.48■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.48■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAP3K1Q13233 1512 aa19.47■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.47■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NCOA2Q15596 1464 aa19.46■□□□□ 0.71
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.45■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP10AO60312 1499 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KDM5CP41229 1560 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HECW2Q9P2P5 1572 aa19.44■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.43■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.42■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MLH3Q9UHC1 1453 aa19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BCORL1Q5H9F3 1711 aa19.4■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MLECQ14165 292 aa19.4■□□□□ 0.7
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADAMTSL3P82987 1691 aa19.37■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.35■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa19.35■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCA6Q8N139 1617 aa19.33■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MADDQ8WXG6 1647 aa19.33■□□□□ 0.69
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.33■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.33■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTPRMP28827 1452 aa19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP7AQ04656 1500 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSPY4P0CV99 314 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TSPY10P0CW01 314 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MYOM3Q5VTT5 1437 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 REREQ9P2R6 1566 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MBD5Q9P267 1494 aa19.29■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MIA2Q96PC5 1412 aa19.28■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa19.27■□□□□ 0.68
TTC28-AS1-203ENST00000419253 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-203ENST00000419253 AGLP35573 1532 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.25■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A2MP01023 1474 aa19.24■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.23■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.22■□□□□ 0.67
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.18■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GGT6Q6P531 493 aa19.18■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FGD6Q6ZV73 1430 aa19.17■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNTLNQ9NXG0 1405 aa19.16■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLXNC1O60486 1568 aa19.15■□□□□ 0.66
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KIF3BO15066 747 aa19.13■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPP6R1Q9UPN7 881 aa19.12■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.11■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABCC5O15440 1437 aa19.08■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DAPK1P53355 1430 aa19.08■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 C3P01024 1663 aa19.07■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZMYM3Q14202 1370 aa19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MROH2AA6NES4 1674 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.05■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.04■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LMTK3Q96Q04 1460 aa19.04■□□□□ 0.64
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms