RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 PREX2Q70Z35 1606 aa28.43■■■□□ 2.14
SEMA3B-201ENST00000416295 MAP3K1Q13233 1512 aa28.43■■■□□ 2.14
SEMA3B-201ENST00000416295 RAPGEF3O95398 923 aa28.42■■■□□ 2.14
SEMA3B-201ENST00000416295 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.39■■■□□ 2.14
SEMA3B-201ENST00000416295 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.38■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.38■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.37■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.37■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.35■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 RICTORQ6R327 1708 aa28.35■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 APLP2Q06481 763 aa28.34■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.34■■■□□ 2.13
SEMA3B-201ENST00000416295 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SEMA3B-201ENST00000416295 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.3■■■□□ 2.12
SEMA3B-201ENST00000416295 NCOA2Q15596 1464 aa28.3■■■□□ 2.12
SEMA3B-201ENST00000416295 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCC1P33527 1531 aa28.28■■■□□ 2.12
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.27■■■□□ 2.12
SEMA3B-201ENST00000416295 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.27■■■□□ 2.12
SEMA3B-201ENST00000416295 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.26■■■□□ 2.11
SEMA3B-201ENST00000416295 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SEMA3B-201ENST00000416295 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.23■■■□□ 2.11
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.23■■■□□ 2.11
SEMA3B-201ENST00000416295 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.22■■■□□ 2.11
SEMA3B-201ENST00000416295 KDM5CP41229 1560 aa28.2■■■□□ 2.11
SEMA3B-201ENST00000416295 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.2■■■□□ 2.1
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.2■■■□□ 2.1
SEMA3B-201ENST00000416295 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.19■■■□□ 2.1
SEMA3B-201ENST00000416295 AFAP1Q8N556 730 aa28.18■■■□□ 2.1
SEMA3B-201ENST00000416295 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.17■■■□□ 2.1
SEMA3B-201ENST00000416295 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.17■■■□□ 2.1
SEMA3B-201ENST00000416295 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.16■■■□□ 2.1
SEMA3B-201ENST00000416295 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.13■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.12■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.12■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.09■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.09■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.09■■■□□ 2.09
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP10AO60312 1499 aa28.07■■■□□ 2.08
SEMA3B-201ENST00000416295 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.07■■■□□ 2.08
SEMA3B-201ENST00000416295 MIA2Q96PC5 1412 aa28.06■■■□□ 2.08
SEMA3B-201ENST00000416295 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.05■■■□□ 2.08
SEMA3B-201ENST00000416295 MBD5Q9P267 1494 aa28.04■■■□□ 2.08
SEMA3B-201ENST00000416295 PTPRMP28827 1452 aa28.03■■■□□ 2.08
SEMA3B-201ENST00000416295 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
SEMA3B-201ENST00000416295 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.01■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 RSPH4AQ5TD94 716 aa28■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.99■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCA6Q8N139 1617 aa27.99■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 MADDQ8WXG6 1647 aa27.99■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.98■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 ATP7AQ04656 1500 aa27.97■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 REREQ9P2R6 1566 aa27.97■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.95■■■□□ 2.07
SEMA3B-201ENST00000416295 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.93■■■□□ 2.06
SEMA3B-201ENST00000416295 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.92■■■□□ 2.06
SEMA3B-201ENST00000416295 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.92■■■□□ 2.06
SEMA3B-201ENST00000416295 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SEMA3B-201ENST00000416295 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.89■■■□□ 2.05
SEMA3B-201ENST00000416295 AGLP35573 1532 aa27.87■■■□□ 2.05
SEMA3B-201ENST00000416295 TSPY4P0CV99 314 aa27.87■■■□□ 2.05
SEMA3B-201ENST00000416295 TSPY10P0CW01 314 aa27.87■■■□□ 2.05
SEMA3B-201ENST00000416295 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SEMA3B-201ENST00000416295 MLECQ14165 292 aa27.84■■■□□ 2.05
SEMA3B-201ENST00000416295 A2MP01023 1474 aa27.83■■■□□ 2.05
SEMA3B-201ENST00000416295 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.81■■■□□ 2.04
SEMA3B-201ENST00000416295 PLXNC1O60486 1568 aa27.81■■■□□ 2.04
SEMA3B-201ENST00000416295 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.8■■■□□ 2.04
SEMA3B-201ENST00000416295 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.8■■■□□ 2.04
SEMA3B-201ENST00000416295 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.76■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCC5O15440 1437 aa27.75■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.74■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 DAPK1P53355 1430 aa27.74■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.72■■■□□ 2.03
SEMA3B-201ENST00000416295 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.68■■■□□ 2.02
SEMA3B-201ENST00000416295 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
SEMA3B-201ENST00000416295 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.65■■■□□ 2.02
SEMA3B-201ENST00000416295 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.62■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.62■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF15Q9NS87 1388 aa27.61■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF3BO15066 747 aa27.61■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 GGT6Q6P531 493 aa27.61■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.6■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
SEMA3B-201ENST00000416295 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.57■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.57■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 ADGRL2O95490 1459 aa27.57■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
SEMA3B-201ENST00000416295 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms