RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409611.1

AQP1-202, Transcript of aquaporin 1 (Colton blood group), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AQP1, Length 1,140 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP1-202ENST00000409611 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.5■■■■□ 3.43
AQP1-202ENST00000409611 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.5■■■■□ 3.43
AQP1-202ENST00000409611 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
AQP1-202ENST00000409611 AKNAQ7Z591 1439 aa36.48■■■■□ 3.43
AQP1-202ENST00000409611 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
AQP1-202ENST00000409611 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.46■■■■□ 3.43
AQP1-202ENST00000409611 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.45■■■■□ 3.43
AQP1-202ENST00000409611 ADGRL1O94910 1474 aa36.38■■■■□ 3.41
AQP1-202ENST00000409611 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
AQP1-202ENST00000409611 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.37■■■■□ 3.41
AQP1-202ENST00000409611 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
AQP1-202ENST00000409611 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.32■■■■□ 3.4
AQP1-202ENST00000409611 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
AQP1-202ENST00000409611 RAPGEF3O95398 923 aa36.28■■■■□ 3.4
AQP1-202ENST00000409611 ABCC1P33527 1531 aa36.28■■■■□ 3.4
AQP1-202ENST00000409611 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.27■■■■□ 3.4
AQP1-202ENST00000409611 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.26■■■■□ 3.39
AQP1-202ENST00000409611 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.25■■■■□ 3.39
AQP1-202ENST00000409611 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.25■■■■□ 3.39
AQP1-202ENST00000409611 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.23■■■■□ 3.39
AQP1-202ENST00000409611 RICTORQ6R327 1708 aa36.22■■■■□ 3.39
AQP1-202ENST00000409611 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.19■■■■□ 3.38
AQP1-202ENST00000409611 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.19■■■■□ 3.38
AQP1-202ENST00000409611 MIA2Q96PC5 1412 aa36.18■■■■□ 3.38
AQP1-202ENST00000409611 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.18■■■■□ 3.38
AQP1-202ENST00000409611 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.17■■■■□ 3.38
AQP1-202ENST00000409611 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
AQP1-202ENST00000409611 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.14■■■■□ 3.38
AQP1-202ENST00000409611 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.14■■■■□ 3.38
AQP1-202ENST00000409611 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.13■■■■□ 3.37
AQP1-202ENST00000409611 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
AQP1-202ENST00000409611 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.37
AQP1-202ENST00000409611 AFAP1Q8N556 730 aa36.11■■■■□ 3.37
AQP1-202ENST00000409611 KDM5CP41229 1560 aa36.1■■■■□ 3.37
AQP1-202ENST00000409611 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.08■■■■□ 3.37
AQP1-202ENST00000409611 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.07■■■■□ 3.37
AQP1-202ENST00000409611 MBD5Q9P267 1494 aa36.05■■■■□ 3.36
AQP1-202ENST00000409611 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.01■■■■□ 3.36
AQP1-202ENST00000409611 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.01■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 MLH3Q9UHC1 1453 aa35.99■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.99■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.98■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.97■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.97■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.97■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
AQP1-202ENST00000409611 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.94■■■■□ 3.34
AQP1-202ENST00000409611 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 ATP7AQ04656 1500 aa35.87■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.87■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 ATP10AO60312 1499 aa35.86■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.85■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.84■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 ABCA6Q8N139 1617 aa35.83■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 TSPY4P0CV99 314 aa35.83■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 TSPY10P0CW01 314 aa35.83■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.83■■■■□ 3.33
AQP1-202ENST00000409611 ABCC5O15440 1437 aa35.79■■■■□ 3.32
AQP1-202ENST00000409611 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
AQP1-202ENST00000409611 DAPK1P53355 1430 aa35.78■■■■□ 3.32
AQP1-202ENST00000409611 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.76■■■■□ 3.32
AQP1-202ENST00000409611 REREQ9P2R6 1566 aa35.76■■■■□ 3.31
AQP1-202ENST00000409611 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
AQP1-202ENST00000409611 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.75■■■■□ 3.31
AQP1-202ENST00000409611 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.74■■■■□ 3.31
AQP1-202ENST00000409611 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.73■■■■□ 3.31
AQP1-202ENST00000409611 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
AQP1-202ENST00000409611 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.68■■■■□ 3.3
AQP1-202ENST00000409611 A2MP01023 1474 aa35.67■■■■□ 3.3
AQP1-202ENST00000409611 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.66■■■■□ 3.3
AQP1-202ENST00000409611 AGLP35573 1532 aa35.63■■■■□ 3.29
AQP1-202ENST00000409611 PLXNC1O60486 1568 aa35.63■■■■□ 3.29
AQP1-202ENST00000409611 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
AQP1-202ENST00000409611 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.58■■■■□ 3.29
AQP1-202ENST00000409611 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.58■■■■□ 3.29
AQP1-202ENST00000409611 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.57■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.56■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 ADGRL2O95490 1459 aa35.55■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 PTPRKQ15262 1439 aa35.55■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 KIF15Q9NS87 1388 aa35.53■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 MLECQ14165 292 aa35.52■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 NCOA1Q15788 1441 aa35.51■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 ITGAEP38570 1179 aa35.51■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.51■■■■□ 3.28
AQP1-202ENST00000409611 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.51■■■■□ 3.27
AQP1-202ENST00000409611 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.5■■■■□ 3.27
AQP1-202ENST00000409611 ROCK1Q13464 1354 aa35.46■■■■□ 3.27
AQP1-202ENST00000409611 ERBINQ96RT1 1412 aa35.42■■■■□ 3.26
AQP1-202ENST00000409611 MADDQ8WXG6 1647 aa35.42■■■■□ 3.26
AQP1-202ENST00000409611 KIF3BO15066 747 aa35.41■■■■□ 3.26
AQP1-202ENST00000409611 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
AQP1-202ENST00000409611 GGT6Q6P531 493 aa35.36■■■■□ 3.25
AQP1-202ENST00000409611 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa35.35■■■■□ 3.25
AQP1-202ENST00000409611 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.32■■■■□ 3.24
AQP1-202ENST00000409611 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
AQP1-202ENST00000409611 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
AQP1-202ENST00000409611 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms