RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 RALBP1Q15311 655 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 STK26Q9P289 416 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-203ENST00000409212 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF3BO15066 747 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 JPH4Q96JJ6 628 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 SOX12O15370 315 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.854e-7■■■■□ 21.3
SH3BP4-203ENST00000409212 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP4-203ENST00000409212 SMARCA4P51532 1647 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP44Q96MT7 982 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 NPHP1O15259 732 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 KCNJ4P48050 445 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 FGD1P98174 961 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4-203ENST00000409212 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 HSCBQ8IWL3 235 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 NLRP13Q86W25 1043 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 MCCP23508 829 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA2Q08379 1002 aa20.22■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SH3BP4-203ENST00000409212 EID1Q9Y6B2 187 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPRGP23470 1445 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 PDE3BQ13370 1112 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.15■□□□□ 0.82
SH3BP4-203ENST00000409212 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 STK31Q9BXU1 1019 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 UACAQ9BZF9 1416 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF15Q9NS87 1388 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 PLCB2Q00722 1185 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 IGF1RP08069 1367 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP4-203ENST00000409212 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.08■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 APBB1O00213 710 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 NRDCO43847 1150 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.05■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 HMMRO75330 724 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 AMPHP49418 695 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 PANK3Q9H999 370 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP4-203ENST00000409212 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.791e-8■■□□□ 14.2
SH3BP4-203ENST00000409212 EVC2Q86UK5 1308 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 OSCARQ8IYS5 282 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 USP47Q96K76 1375 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-203ENST00000409212 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.96■□□□□ 0.79
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