RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407022.7

BSCL2-207, Transcript of BSCL2, seipin lipid droplet biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene BSCL2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSCL2-207ENST00000407022 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
BSCL2-207ENST00000407022 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
BSCL2-207ENST00000407022 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.33■■■□□ 2.45
BSCL2-207ENST00000407022 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.31■■■□□ 2.44
BSCL2-207ENST00000407022 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
BSCL2-207ENST00000407022 CD109Q6YHK3 1445 aa30.3■■■□□ 2.44
BSCL2-207ENST00000407022 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
BSCL2-207ENST00000407022 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.28■■■□□ 2.44
BSCL2-207ENST00000407022 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.28■■■□□ 2.44
BSCL2-207ENST00000407022 TSPOAP1O95153 1857 aa30.27■■■□□ 2.44
BSCL2-207ENST00000407022 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
BSCL2-207ENST00000407022 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.26■■■□□ 2.43
BSCL2-207ENST00000407022 FANCAO15360 1455 aa30.22■■■□□ 2.43
BSCL2-207ENST00000407022 ABCC1P33527 1531 aa30.2■■■□□ 2.43
BSCL2-207ENST00000407022 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.19■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.18■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.17■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 MBD5Q9P267 1494 aa30.17■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 SYCP2Q9BX26 1530 aa30.16■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.15■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.15■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
BSCL2-207ENST00000407022 PTPRKQ15262 1439 aa30.12■■■□□ 2.41
BSCL2-207ENST00000407022 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.12■■■□□ 2.41
BSCL2-207ENST00000407022 NEO1Q92859 1461 aa30.12■■■□□ 2.41
BSCL2-207ENST00000407022 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa30.11■■■□□ 2.41
BSCL2-207ENST00000407022 AKNAQ7Z591 1439 aa30.1■■■□□ 2.41
BSCL2-207ENST00000407022 ABCC5O15440 1437 aa30.09■■■□□ 2.41
BSCL2-207ENST00000407022 DAPK1P53355 1430 aa30.08■■■□□ 2.41
BSCL2-207ENST00000407022 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.07■■■□□ 2.4
BSCL2-207ENST00000407022 ADGRL1O94910 1474 aa30.06■■■□□ 2.4
BSCL2-207ENST00000407022 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.04■■■□□ 2.4
BSCL2-207ENST00000407022 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP30.04■■■□□ 2.4
BSCL2-207ENST00000407022 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.03■■■□□ 2.4
BSCL2-207ENST00000407022 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.02■■■□□ 2.4
BSCL2-207ENST00000407022 RICTORQ6R327 1708 aa30.01■■■□□ 2.4
BSCL2-207ENST00000407022 SCAPERQ9BY12 1400 aa30■■■□□ 2.39
BSCL2-207ENST00000407022 ADGBQ8N7X0 1667 aa30■■■□□ 2.39
BSCL2-207ENST00000407022 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.99■■■□□ 2.39
BSCL2-207ENST00000407022 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.98■■■□□ 2.39
BSCL2-207ENST00000407022 ITGAEP38570 1179 aa29.98■■■□□ 2.39
BSCL2-207ENST00000407022 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.97■■■□□ 2.39
BSCL2-207ENST00000407022 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
BSCL2-207ENST00000407022 KDM5CP41229 1560 aa29.96■■■□□ 2.39
BSCL2-207ENST00000407022 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.94■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 ADGRL2O95490 1459 aa29.93■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.91■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.91■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.9■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.9■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.89■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 AFAP1Q8N556 730 aa29.89■■■□□ 2.38
BSCL2-207ENST00000407022 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.88■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 ROCK1Q13464 1354 aa29.87■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 PLXNC1O60486 1568 aa29.86■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.86■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 NCOA1Q15788 1441 aa29.86■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 ATP7AQ04656 1500 aa29.83■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.83■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.83■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 HFM1A2PYH4 1435 aa29.83■■■□□ 2.37
BSCL2-207ENST00000407022 NAIPQ13075 1403 aa29.82■■■□□ 2.36
BSCL2-207ENST00000407022 RAPGEF3O95398 923 aa29.81■■■□□ 2.36
BSCL2-207ENST00000407022 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.81■■■□□ 2.36
BSCL2-207ENST00000407022 TSPY4P0CV99 314 aa29.8■■■□□ 2.36
BSCL2-207ENST00000407022 TSPY10P0CW01 314 aa29.8■■■□□ 2.36
BSCL2-207ENST00000407022 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.8■■■□□ 2.36
BSCL2-207ENST00000407022 KDM6BO15054 1643 aa29.79■■■□□ 2.36
BSCL2-207ENST00000407022 ABCA6Q8N139 1617 aa29.76■■■□□ 2.35
BSCL2-207ENST00000407022 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
BSCL2-207ENST00000407022 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.75■■■□□ 2.35
BSCL2-207ENST00000407022 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.75■■■□□ 2.35
BSCL2-207ENST00000407022 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.73■■■□□ 2.35
BSCL2-207ENST00000407022 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.71■■■□□ 2.35
BSCL2-207ENST00000407022 KIF15Q9NS87 1388 aa29.7■■■□□ 2.35
BSCL2-207ENST00000407022 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.68■■■□□ 2.34
BSCL2-207ENST00000407022 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.67■■■□□ 2.34
BSCL2-207ENST00000407022 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.66■■■□□ 2.34
BSCL2-207ENST00000407022 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.66■■■□□ 2.34
BSCL2-207ENST00000407022 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.62■■■□□ 2.33
BSCL2-207ENST00000407022 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.62■■■□□ 2.33
BSCL2-207ENST00000407022 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.59■■■□□ 2.33
BSCL2-207ENST00000407022 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.58■■■□□ 2.33
BSCL2-207ENST00000407022 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
BSCL2-207ENST00000407022 ERBINQ96RT1 1412 aa29.57■■■□□ 2.32
BSCL2-207ENST00000407022 A2MP01023 1474 aa29.57■■■□□ 2.32
BSCL2-207ENST00000407022 REREQ9P2R6 1566 aa29.56■■■□□ 2.32
BSCL2-207ENST00000407022 HRCP23327 699 aa29.55■■■□□ 2.32
BSCL2-207ENST00000407022 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
BSCL2-207ENST00000407022 DEPDC5O75140 1603 aa29.53■■■□□ 2.32
BSCL2-207ENST00000407022 UNC13BO14795 1591 aa29.53■■■□□ 2.32
BSCL2-207ENST00000407022 ATP10AO60312 1499 aa29.51■■■□□ 2.31
BSCL2-207ENST00000407022 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.5■■■□□ 2.31
BSCL2-207ENST00000407022 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.49■■■□□ 2.31
BSCL2-207ENST00000407022 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms