RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 RICTORQ6R327 1708 aa28.9■■■□□ 2.22
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PTPRN2-204ENST00000404321 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.9■■■□□ 2.22
PTPRN2-204ENST00000404321 PREX2Q70Z35 1606 aa28.85■■■□□ 2.21
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PTPRN2-204ENST00000404321 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.83■■■□□ 2.21
PTPRN2-204ENST00000404321 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PTPRN2-204ENST00000404321 AFAP1Q8N556 730 aa28.83■■■□□ 2.21
PTPRN2-204ENST00000404321 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.82■■■□□ 2.2
PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.82■■■□□ 2.2
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PTPRN2-204ENST00000404321 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.77■■■□□ 2.2
PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.77■■■□□ 2.2
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.77■■■□□ 2.2
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PTPRN2-204ENST00000404321 ABCC1P33527 1531 aa28.75■■■□□ 2.19
PTPRN2-204ENST00000404321 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.7■■■□□ 2.18
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PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
PTPRN2-204ENST00000404321 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.66■■■□□ 2.18
PTPRN2-204ENST00000404321 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.66■■■□□ 2.18
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PTPRN2-204ENST00000404321 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.63■■■□□ 2.17
PTPRN2-204ENST00000404321 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.62■■■□□ 2.17
PTPRN2-204ENST00000404321 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.62■■■□□ 2.17
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PTPRN2-204ENST00000404321 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRN2-204ENST00000404321 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRN2-204ENST00000404321 APLP2Q06481 763 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRN2-204ENST00000404321 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.59■■■□□ 2.17
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PTPRN2-204ENST00000404321 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRN2-204ENST00000404321 MAP3K1Q13233 1512 aa28.58■■■□□ 2.17
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PTPRN2-204ENST00000404321 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.49■■■□□ 2.15
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PTPRN2-204ENST00000404321 AGLP35573 1532 aa28.37■■■□□ 2.13
PTPRN2-204ENST00000404321 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.35■■■□□ 2.13
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PTPRN2-204ENST00000404321 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRN2-204ENST00000404321 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.31■■■□□ 2.12
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PTPRN2-204ENST00000404321 TSPY10P0CW01 314 aa28.3■■■□□ 2.12
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PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRN2-204ENST00000404321 PLXNC1O60486 1568 aa28.27■■■□□ 2.12
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PTPRN2-204ENST00000404321 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.13■■■□□ 2.09
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PTPRN2-204ENST00000404321 ZMYM3Q14202 1370 aa28.11■■■□□ 2.09
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PTPRN2-204ENST00000404321 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.08■■■□□ 2.09
PTPRN2-204ENST00000404321 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.07■■■□□ 2.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PTPRN2-204ENST00000404321 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.05■■■□□ 2.08
PTPRN2-204ENST00000404321 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.05■■■□□ 2.08
PTPRN2-204ENST00000404321 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRN2-204ENST00000404321 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PTPRN2-204ENST00000404321 KIF15Q9NS87 1388 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRN2-204ENST00000404321 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.01■■■□□ 2.08
PTPRN2-204ENST00000404321 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.01■■■□□ 2.07
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