RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CLDN5-201ENST00000403084 USP35Q9P2H5 1018 aa29.47■■■□□ 2.31
CLDN5-201ENST00000403084 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
CLDN5-201ENST00000403084 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.46■■■□□ 2.31
CLDN5-201ENST00000403084 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.46■■■□□ 2.31
CLDN5-201ENST00000403084 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.46■■■□□ 2.31
CLDN5-201ENST00000403084 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.45■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGEF11O15085 1522 aa29.43■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.42■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.42■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 CUL7Q14999 1698 aa29.41■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 KDM6BO15054 1643 aa29.41■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.41■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.39■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 GRIN2BQ13224 1484 aa29.39■■■□□ 2.3
CLDN5-201ENST00000403084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.37■■■□□ 2.29
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CLDN5-201ENST00000403084 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.37■■■□□ 2.29
CLDN5-201ENST00000403084 SAMD9Q5K651 1589 aa29.37■■■□□ 2.29
CLDN5-201ENST00000403084 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.36■■■□□ 2.29
CLDN5-201ENST00000403084 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.35■■■□□ 2.29
CLDN5-201ENST00000403084 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CLDN5-201ENST00000403084 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.34■■■□□ 2.29
CLDN5-201ENST00000403084 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CLDN5-201ENST00000403084 NEFMP07197 916 aa29.32■■■□□ 2.28
CLDN5-201ENST00000403084 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
CLDN5-201ENST00000403084 ERCC6Q03468 1493 aa29.3■■■□□ 2.28
CLDN5-201ENST00000403084 MIA2Q96PC5 1412 aa29.29■■■□□ 2.28
CLDN5-201ENST00000403084 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CLDN5-201ENST00000403084 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.27■■■□□ 2.28
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CLDN5-201ENST00000403084 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.24■■■□□ 2.27
CLDN5-201ENST00000403084 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.24■■■□□ 2.27
CLDN5-201ENST00000403084 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
CLDN5-201ENST00000403084 PDE4AP27815 886 aa29.23■■■□□ 2.27
CLDN5-201ENST00000403084 MS4A1P11836 297 aa29.22■■■□□ 2.27
CLDN5-201ENST00000403084 BACH2Q9BYV9 841 aa29.21■■■□□ 2.27
CLDN5-201ENST00000403084 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
CLDN5-201ENST00000403084 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.18■■■□□ 2.26
CLDN5-201ENST00000403084 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CLDN5-201ENST00000403084 FOXD1Q16676 465 aa29.18■■■□□ 2.26
CLDN5-201ENST00000403084 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CLDN5-201ENST00000403084 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa29.15■■■□□ 2.26
CLDN5-201ENST00000403084 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
CLDN5-201ENST00000403084 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
CLDN5-201ENST00000403084 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.12■■■□□ 2.25
CLDN5-201ENST00000403084 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.11■■■□□ 2.25
CLDN5-201ENST00000403084 MBD5Q9P267 1494 aa29.09■■■□□ 2.25
CLDN5-201ENST00000403084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CLDN5-201ENST00000403084 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CLDN5-201ENST00000403084 ROCK1Q13464 1354 aa29.07■■■□□ 2.24
CLDN5-201ENST00000403084 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.06■■■□□ 2.24
CLDN5-201ENST00000403084 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.06■■■□□ 2.24
CLDN5-201ENST00000403084 GSE1Q14687 1217 aa29.06■■■□□ 2.24
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CLDN5-201ENST00000403084 KDM5CP41229 1560 aa29.05■■■□□ 2.24
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CLDN5-201ENST00000403084 KIF14Q15058 1648 aa29.03■■■□□ 2.24
CLDN5-201ENST00000403084 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.02■■■□□ 2.24
CLDN5-201ENST00000403084 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CLDN5-201ENST00000403084 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.98■■■□□ 2.23
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CLDN5-201ENST00000403084 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CLDN5-201ENST00000403084 KIF15Q9NS87 1388 aa28.98■■■□□ 2.23
CLDN5-201ENST00000403084 DAPK1P53355 1430 aa28.96■■■□□ 2.23
CLDN5-201ENST00000403084 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
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CLDN5-201ENST00000403084 WDR62O43379 1518 aa28.93■■■□□ 2.22
CLDN5-201ENST00000403084 PDE3BQ13370 1112 aa28.93■■■□□ 2.22
CLDN5-201ENST00000403084 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CLDN5-201ENST00000403084 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CLDN5-201ENST00000403084 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.92■■■□□ 2.22
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CLDN5-201ENST00000403084 PZPP20742 1482 aa28.89■■■□□ 2.22
CLDN5-201ENST00000403084 E9PCH4 1651 aa28.88■■■□□ 2.21
CLDN5-201ENST00000403084 RALBP1Q15311 655 aa28.88■■■□□ 2.21
CLDN5-201ENST00000403084 ABCC5O15440 1437 aa28.87■■■□□ 2.21
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CLDN5-201ENST00000403084 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.83■■■□□ 2.21
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CLDN5-201ENST00000403084 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.74■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
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CLDN5-201ENST00000403084 INSRP06213 1382 aa28.72■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.72■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 NLRP13Q86W25 1043 aa28.72■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 ADAMTS12P58397 1594 aa28.71■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 SKAP1Q86WV1 359 aa28.71■■■□□ 2.19
CLDN5-201ENST00000403084 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
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