RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
PKDCC-202ENST00000401498 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.1■■■■■ 5.13
PKDCC-202ENST00000401498 CFAP74Q9C0B2 1584 aa47.1■■■■■ 5.13
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP5Q13017 1502 aa47.09■■■■■ 5.13
PKDCC-202ENST00000401498 CCNB3Q8WWL7 1395 aa47.08■■■■■ 5.13
PKDCC-202ENST00000401498 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa47.07■■■■■ 5.12
PKDCC-202ENST00000401498 AKNAQ7Z591 1439 aa47.07■■■■■ 5.12
PKDCC-202ENST00000401498 ITSN2Q9NZM3 1697 aa46.95■■■■■ 5.11
PKDCC-202ENST00000401498 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP46.93■■■■■ 5.1
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRL1O94910 1474 aa46.93■■■■■ 5.1
PKDCC-202ENST00000401498 RAPGEF3O95398 923 aa46.86■■■■■ 5.09
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
PKDCC-202ENST00000401498 SCAPERQ9BY12 1400 aa46.86■■■■■ 5.09
PKDCC-202ENST00000401498 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa46.85■■■■■ 5.09
PKDCC-202ENST00000401498 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP46.84■■■■■ 5.09
PKDCC-202ENST00000401498 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa46.82■■■■■ 5.09
PKDCC-202ENST00000401498 RICTORQ6R327 1708 aa46.81■■■■■ 5.08
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC1P33527 1531 aa46.8■■■■■ 5.08
PKDCC-202ENST00000401498 MYOM3Q5VTT5 1437 aa46.78■■■■■ 5.08
PKDCC-202ENST00000401498 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP46.77■■■■■ 5.08
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa46.77■■■■■ 5.08
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP46.75■■■■■ 5.07
PKDCC-202ENST00000401498 POGZQ7Z3K3 1410 aa46.74■■■■■ 5.07
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa46.68■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 SYCP2Q9BX26 1530 aa46.68■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa46.67■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 MIA2Q96PC5 1412 aa46.67■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa46.65■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP46.64■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 AFAP1Q8N556 730 aa46.64■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa46.64■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa46.63■■■■■ 5.06
PKDCC-202ENST00000401498 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa46.61■■■■■ 5.05
PKDCC-202ENST00000401498 KDM5CP41229 1560 aa46.58■■■■■ 5.05
PKDCC-202ENST00000401498 FGD6Q6ZV73 1430 aa46.57■■■■■ 5.04
PKDCC-202ENST00000401498 MBD5Q9P267 1494 aa46.56■■■■■ 5.04
PKDCC-202ENST00000401498 PTPN23Q9H3S7 1636 aa46.51■■■■■ 5.04
PKDCC-202ENST00000401498 MAGI2Q86UL8 1455 aa46.48■■■■■ 5.03
PKDCC-202ENST00000401498 HECW2Q9P2P5 1572 aa46.44■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 YEATS2Q9ULM3 1422 aa46.44■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa46.43■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 MLH3Q9UHC1 1453 aa46.43■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF5Q12774 1597 aa46.42■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa46.42■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC141Q6ZP82 1450 aa46.39■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 RSPH4AQ5TD94 716 aa46.39■■■■■ 5.02
PKDCC-202ENST00000401498 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa46.37■■■■■ 5.01
PKDCC-202ENST00000401498 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
PKDCC-202ENST00000401498 MYT1LQ9UL68 1186 aa46.35■■■■■ 5.01
PKDCC-202ENST00000401498 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
PKDCC-202ENST00000401498 ATP7AQ04656 1500 aa46.28■■■■■ 5
PKDCC-202ENST00000401498 ABCA6Q8N139 1617 aa46.28■■■■■ 5
PKDCC-202ENST00000401498 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa46.27■■■■■ 5
PKDCC-202ENST00000401498 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP46.26■■■■■ 5
PKDCC-202ENST00000401498 ATP10AO60312 1499 aa46.25■■■■■ 4.99
PKDCC-202ENST00000401498 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
PKDCC-202ENST00000401498 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa46.22■■■■■ 4.99
PKDCC-202ENST00000401498 TSPY4P0CV99 314 aa46.22■■■■■ 4.99
PKDCC-202ENST00000401498 TSPY10P0CW01 314 aa46.22■■■■■ 4.99
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC5O15440 1437 aa46.21■■■■■ 4.99
PKDCC-202ENST00000401498 DAPK1P53355 1430 aa46.18■■■■■ 4.98
PKDCC-202ENST00000401498 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa46.18■■■■■ 4.98
PKDCC-202ENST00000401498 CROCC2H7BZ55 1655 aa46.17■■■■■ 4.98
PKDCC-202ENST00000401498 C9orf84Q5VXU9 1444 aa46.16■■■■■ 4.98
PKDCC-202ENST00000401498 MAST1Q9Y2H9 1570 aa46.15■■■■■ 4.98
PKDCC-202ENST00000401498 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP46.15■■■■■ 4.98
PKDCC-202ENST00000401498 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP46.1■■■■■ 4.97
PKDCC-202ENST00000401498 REREQ9P2R6 1566 aa46.1■■■■■ 4.97
PKDCC-202ENST00000401498 SHANK2Q9UPX8 1470 aa46.09■■■■■ 4.97
PKDCC-202ENST00000401498 ADGBQ8N7X0 1667 aa46.06■■■■■ 4.96
PKDCC-202ENST00000401498 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
PKDCC-202ENST00000401498 A2MP01023 1474 aa46.01■■■■■ 4.96
PKDCC-202ENST00000401498 PLXNC1O60486 1568 aa45.98■■■■■ 4.95
PKDCC-202ENST00000401498 CHIC2Q9UKJ5 165 aa45.97■■■■■ 4.95
PKDCC-202ENST00000401498 PTPRKQ15262 1439 aa45.96■■■■■ 4.95
PKDCC-202ENST00000401498 AGLP35573 1532 aa45.95■■■■■ 4.95
PKDCC-202ENST00000401498 BCORL1Q5H9F3 1711 aa45.94■■■■■ 4.94
PKDCC-202ENST00000401498 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
PKDCC-202ENST00000401498 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.92■■■■■ 4.94
PKDCC-202ENST00000401498 ITGAEP38570 1179 aa45.89■■■■■ 4.94
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRL2O95490 1459 aa45.87■■■■■ 4.93
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa45.86■■■■■ 4.93
PKDCC-202ENST00000401498 NCOA1Q15788 1441 aa45.86■■■■■ 4.93
PKDCC-202ENST00000401498 MLECQ14165 292 aa45.85■■■■■ 4.93
PKDCC-202ENST00000401498 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa45.85■■■■■ 4.93
PKDCC-202ENST00000401498 KIF15Q9NS87 1388 aa45.84■■■■■ 4.93
PKDCC-202ENST00000401498 ADAMTSL3P82987 1691 aa45.84■■■■■ 4.93
PKDCC-202ENST00000401498 DUOX2Q9NRD8 1548 aa45.8■■■■■ 4.92
PKDCC-202ENST00000401498 MADDQ8WXG6 1647 aa45.73■■■■■ 4.91
PKDCC-202ENST00000401498 ROCK1Q13464 1354 aa45.73■■■■■ 4.91
PKDCC-202ENST00000401498 KIF3BO15066 747 aa45.71■■■■■ 4.91
PKDCC-202ENST00000401498 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
PKDCC-202ENST00000401498 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa45.66■■■■■ 4.9
PKDCC-202ENST00000401498 ERBINQ96RT1 1412 aa45.66■■■■■ 4.9
PKDCC-202ENST00000401498 GGT6Q6P531 493 aa45.66■■■■■ 4.9
PKDCC-202ENST00000401498 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP45.61■■■■■ 4.89
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa45.57■■■■■ 4.89
PKDCC-202ENST00000401498 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
PKDCC-202ENST00000401498 PTPRMP28827 1452 aa45.52■■■■■ 4.88
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