RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400299.6

SELENOM-201, Transcript of selenoprotein M, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SELENOM, Length 694 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOM-201ENST00000400299 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.18■■□□□ 1.94
SELENOM-201ENST00000400299 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SELENOM-201ENST00000400299 HECW1Q76N89 1606 aa27.13■■□□□ 1.93
SELENOM-201ENST00000400299 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.12■■□□□ 1.93
SELENOM-201ENST00000400299 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.12■■□□□ 1.93
SELENOM-201ENST00000400299 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.06■■□□□ 1.92
SELENOM-201ENST00000400299 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.06■■□□□ 1.92
SELENOM-201ENST00000400299 ATP10AO60312 1499 aa27.05■■□□□ 1.92
SELENOM-201ENST00000400299 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SELENOM-201ENST00000400299 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
SELENOM-201ENST00000400299 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.99■■□□□ 1.91
SELENOM-201ENST00000400299 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.99■■□□□ 1.91
SELENOM-201ENST00000400299 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
SELENOM-201ENST00000400299 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.98■■□□□ 1.91
SELENOM-201ENST00000400299 NCOA1Q15788 1441 aa26.97■■□□□ 1.91
SELENOM-201ENST00000400299 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
SELENOM-201ENST00000400299 HSPA1LP34931 641 aa26.94■■□□□ 1.9
SELENOM-201ENST00000400299 C3P01024 1663 aa26.94■■□□□ 1.9
SELENOM-201ENST00000400299 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.87■■□□□ 1.89
SELENOM-201ENST00000400299 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.87■■□□□ 1.89
SELENOM-201ENST00000400299 PRXQ9BXM0 1461 aa26.87■■□□□ 1.89
SELENOM-201ENST00000400299 SAMD9Q5K651 1589 aa26.86■■□□□ 1.89
SELENOM-201ENST00000400299 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SELENOM-201ENST00000400299 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.84■■□□□ 1.89
SELENOM-201ENST00000400299 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SELENOM-201ENST00000400299 PIP4K2BP78356 416 aa26.82■■□□□ 1.88
SELENOM-201ENST00000400299 PLCH2O75038 1416 aa26.8■■□□□ 1.88
SELENOM-201ENST00000400299 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SELENOM-201ENST00000400299 AFAP1Q8N556 730 aa26.76■■□□□ 1.87
SELENOM-201ENST00000400299 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.74■■□□□ 1.87
SELENOM-201ENST00000400299 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
SELENOM-201ENST00000400299 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.71■■□□□ 1.87
SELENOM-201ENST00000400299 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.71■■□□□ 1.87
SELENOM-201ENST00000400299 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.68■■□□□ 1.86
SELENOM-201ENST00000400299 TOM1O60784 492 aa26.66■■□□□ 1.86
SELENOM-201ENST00000400299 PKD2Q13563 968 aa26.65■■□□□ 1.86
SELENOM-201ENST00000400299 KDM5CP41229 1560 aa26.65■■□□□ 1.86
SELENOM-201ENST00000400299 REREQ9P2R6 1566 aa26.65■■□□□ 1.86
SELENOM-201ENST00000400299 ABCA6Q8N139 1617 aa26.63■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 AGLP35573 1532 aa26.63■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.61■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 NPATQ14207 1427 aa26.59■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.59■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.58■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SELENOM-201ENST00000400299 PLA2R1Q13018 1463 aa26.57■■□□□ 1.84
SELENOM-201ENST00000400299 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
SELENOM-201ENST00000400299 ZMYM3Q14202 1370 aa26.55■■□□□ 1.84
SELENOM-201ENST00000400299 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.53■■□□□ 1.84
SELENOM-201ENST00000400299 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SELENOM-201ENST00000400299 MROH2AA6NES4 1674 aa26.5■■□□□ 1.83
SELENOM-201ENST00000400299 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.49■■□□□ 1.83
SELENOM-201ENST00000400299 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.48■■□□□ 1.83
SELENOM-201ENST00000400299 ALKQ9UM73 1620 aa26.48■■□□□ 1.83
SELENOM-201ENST00000400299 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SELENOM-201ENST00000400299 KIF14Q15058 1648 aa26.46■■□□□ 1.83
SELENOM-201ENST00000400299 CPS1P31327 1500 aa26.44■■□□□ 1.82
SELENOM-201ENST00000400299 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.42■■□□□ 1.82
SELENOM-201ENST00000400299 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.42■■□□□ 1.82
SELENOM-201ENST00000400299 PTPRKQ15262 1439 aa26.4■■□□□ 1.82
SELENOM-201ENST00000400299 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SELENOM-201ENST00000400299 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SELENOM-201ENST00000400299 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.37■■□□□ 1.81
SELENOM-201ENST00000400299 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.37■■□□□ 1.81
SELENOM-201ENST00000400299 POTEAQ6S8J7 498 aa26.36■■□□□ 1.81
SELENOM-201ENST00000400299 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.32■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.31■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 ABCC1P33527 1531 aa26.29■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.28■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.28■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SELENOM-201ENST00000400299 GGT6Q6P531 493 aa26.23■■□□□ 1.79
SELENOM-201ENST00000400299 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SELENOM-201ENST00000400299 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.2■■□□□ 1.78
SELENOM-201ENST00000400299 PREX2Q70Z35 1606 aa26.19■■□□□ 1.78
SELENOM-201ENST00000400299 CLIP1P30622 1438 aa26.18■■□□□ 1.78
SELENOM-201ENST00000400299 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.18■■□□□ 1.78
SELENOM-201ENST00000400299 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.17■■□□□ 1.78
SELENOM-201ENST00000400299 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.15■■□□□ 1.78
SELENOM-201ENST00000400299 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
SELENOM-201ENST00000400299 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.12■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.11■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 PLXNC1O60486 1568 aa26.1■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 A2MP01023 1474 aa26.09■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 FMN1Q68DA7 1419 aa26.08■■□□□ 1.77
SELENOM-201ENST00000400299 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.07■■□□□ 1.76
SELENOM-201ENST00000400299 TNRQ92752 1358 aa26.07■■□□□ 1.76
SELENOM-201ENST00000400299 MED14O60244 1454 aa26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms