RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397054.7

P3H1-204, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H1, Length 2,705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-204ENST00000397054 AKNAQ7Z591 1439 aa26.07■■□□□ 1.76
P3H1-204ENST00000397054 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
P3H1-204ENST00000397054 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
P3H1-204ENST00000397054 KIAA0556O60303 1618 aa26.03■■□□□ 1.76
P3H1-204ENST00000397054 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.03■■□□□ 1.76
P3H1-204ENST00000397054 IFT140Q96RY7 1462 aa26.02■■□□□ 1.76
P3H1-204ENST00000397054 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
P3H1-204ENST00000397054 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
P3H1-204ENST00000397054 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.01■■□□□ 1.75
P3H1-204ENST00000397054 FBLN2P98095 1184 aa26■■□□□ 1.75
P3H1-204ENST00000397054 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
P3H1-204ENST00000397054 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
P3H1-204ENST00000397054 GRIN2AQ12879 1464 aa25.97■■□□□ 1.75
P3H1-204ENST00000397054 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.95■■□□□ 1.75
P3H1-204ENST00000397054 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.94■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 ROCK1Q13464 1354 aa25.94■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 CCDC7Q96M83 1385 aa25.91■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.9■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.9■■□□□ 1.74
P3H1-204ENST00000397054 NCOA1Q15788 1441 aa25.88■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.87■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.87■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.85■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 KIF14Q15058 1648 aa25.84■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 PZPP20742 1482 aa25.84■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.84■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 CEP170Q5SW79 1584 aa25.84■■□□□ 1.73
P3H1-204ENST00000397054 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
P3H1-204ENST00000397054 ERCC6Q03468 1493 aa25.8■■□□□ 1.72
P3H1-204ENST00000397054 JPH4Q96JJ6 628 aa25.79■■□□□ 1.72
P3H1-204ENST00000397054 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.79■■□□□ 1.72
P3H1-204ENST00000397054 MRS2Q9HD23 443 aa25.79■■□□□ 1.72
P3H1-204ENST00000397054 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.79■■□□□ 1.72
P3H1-204ENST00000397054 PKD2Q13563 968 aa25.78■■□□□ 1.72
P3H1-204ENST00000397054 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.73■■□□□ 1.71
P3H1-204ENST00000397054 SYNJ2O15056 1496 aa25.72■■□□□ 1.71
P3H1-204ENST00000397054 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
P3H1-204ENST00000397054 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.68■■□□□ 1.7
P3H1-204ENST00000397054 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.65■■□□□ 1.7
P3H1-204ENST00000397054 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.65■■□□□ 1.7
P3H1-204ENST00000397054 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.65■■□□□ 1.7
P3H1-204ENST00000397054 USP47Q96K76 1375 aa25.65■■□□□ 1.7
P3H1-204ENST00000397054 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.64■■□□□ 1.7
P3H1-204ENST00000397054 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.63■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 MBD5Q9P267 1494 aa25.63■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 NUP155O75694 1391 aa25.63■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 ADGRL2O95490 1459 aa25.62■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.62■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 NUP160Q12769 1436 aa25.62■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.61■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 ATP10BO94823 1461 aa25.61■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.61■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.59■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.59■■□□□ 1.69
P3H1-204ENST00000397054 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.57■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.56■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.56■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.56■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 MSH5O43196 834 aa25.56■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 ABCA8O94911 1581 aa25.53■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.52■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 TSPY4P0CV99 314 aa25.52■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 TSPY10P0CW01 314 aa25.52■■□□□ 1.68
P3H1-204ENST00000397054 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.51■■□□□ 1.67
P3H1-204ENST00000397054 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
P3H1-204ENST00000397054 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.5■■□□□ 1.67
P3H1-204ENST00000397054 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.49■■□□□ 1.67
P3H1-204ENST00000397054 KIF15Q9NS87 1388 aa25.48■■□□□ 1.67
P3H1-204ENST00000397054 KDM5CP41229 1560 aa25.48■■□□□ 1.67
P3H1-204ENST00000397054 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.47■■□□□ 1.67
P3H1-204ENST00000397054 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.44■■□□□ 1.66
P3H1-204ENST00000397054 PTPRGP23470 1445 aa25.41■■□□□ 1.66
P3H1-204ENST00000397054 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.4■■□□□ 1.66
P3H1-204ENST00000397054 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.4■■□□□ 1.66
P3H1-204ENST00000397054 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.4■■□□□ 1.66
P3H1-204ENST00000397054 RGL3Q3MIN7 710 aa25.39■■□□□ 1.66
P3H1-204ENST00000397054 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.652e-9■■■□□ 17.1
P3H1-204ENST00000397054 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.37■■□□□ 1.65
P3H1-204ENST00000397054 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
P3H1-204ENST00000397054 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.34■■□□□ 1.65
P3H1-204ENST00000397054 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.34■■□□□ 1.65
P3H1-204ENST00000397054 TMC1Q8TDI8 760 aa25.34■■□□□ 1.65
P3H1-204ENST00000397054 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.31■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 NUDCQ9Y266 331 aa25.3■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.3■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms